fa تجزیه و تحلیل توالی مولکولی ژن ITS جهت شناسایی گونه‌های جداسازی شده جنس فوزاریم از مناطق مختلف ایران سلولی و مولکولی Cellular and molecular مقاله پژوهشی Research Article <a name="OLE_LINK72"><strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:16.0pt;">سابقه و هدف:</span></span></strong></a> <a name="OLE_LINK158"></a><a name="OLE_LINK157"></a><a name="OLE_LINK163"></a><a name="OLE_LINK162"><span style="font-family:b nazanin;">شناسایی و تمایز جنس فوزاریم در سطح گونه، برای مقاصد </span></a><span style="font-family:b nazanin;">اپیدیمیولوژی و پاتولوژیکی ضروری است. <a name="OLE_LINK168">هدف از این مطالعه </a></span><span style="font-family:b nazanin;">بررسی روابط فیلوژنتیکی و </span><span style="font-family:b nazanin;">یافتن الگو‌های </span><span style="font-family:b nazanin;">تکراری کلاستر ‌شده</span><span style="font-family:b nazanin;"> مشخص در ناحیه </span><span dir="LTR"><span style="font-size:11.0pt;">ITS</span></span> &nbsp;<span style="font-family:b nazanin;">به&shy;منظور شناسایی گونه‌های متفاوت جنس فوزاریم است.</span><br> <strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:16.0pt;">مواد و روش‌ها:</span></span></strong> <a name="OLE_LINK172"></a><a name="OLE_LINK173"><span style="font-family:b nazanin;">16 جدایه از گونه‌های متفاوت جنس فوزاریم و از نواحی مختلف ایران جمع آوری شدند.</span></a><span style="font-family:b nazanin;"> ناحیه فاصله&shy;انداز داخلی </span><span dir="LTR"><span style="font-size:11.0pt;">DNA</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> ریبوزومی توسط واکنش زنجیره‌ای پلی&shy;مراز تکثیر، </span>&nbsp;<span style="font-family:b nazanin;">توالی</span><span dir="LTR">&shy;</span><span style="font-family:b nazanin;">یابی و با ابزار‌های مختلف مورد تجزیه و تحلیل قرار گر</span><span style="font-family:b nazanin;">فتند.</span><br> <a name="OLE_LINK176"><strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:16.0pt;">یافته&shy; ها:</span></span></strong></a> <span style="font-family:b nazanin;">محصول واکنش زنجیره‌ای پلی&shy;مراز، قطعه&shy;های به&shy;طول به&shy;طورتقریبی 550 جفت باز در تمام جدایه‌ها بود. مقایسه توالی‌ها و فیلوگرام حاصل از تجزیه و تحلیل ناحیه </span><span dir="LTR"><span style="font-size:11.0pt;">ITS</span></span><span style="font-family:b nazanin;">، گونه‌های جنس فوزاریم را در ده گروه مختلف قرار داد. </span><br> <a name="OLE_LINK177"><strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:16.0pt;">بحث:</span></span></strong></a> <span style="font-family:b nazanin;">ناحیه فاصله&shy;انداز داخلی بی&shy;ثبات و تغییرپذیر هستند. سطح بالای تنوع بین </span><span style="font-family:b nazanin;">ناحیه فاصله&shy;انداز داخلی </span><span style="font-family:b nazanin;">ناشی از حذف یا اضافه شدن واحدهای تکراری در ناحیه فوق است.</span><br> <a name="OLE_LINK233"><strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:16.0pt;">نتیجه&shy; گیری</span></span></strong></a><strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:16.0pt;">:</span></span></strong> <span style="font-family:b nazanin;">بعضی از جدایه‌ها به&shy;طور قطعی شناسایی می</span><span dir="LTR">‌</span><span style="font-family:b nazanin;">شوند. بعضی از آن</span><span dir="LTR">‌</span><span style="font-family:b nazanin;">ها دارای الگوی متفاوتی هستند.</span><span style="font-family:b nazanin;"> وجود موتیف&shy;های خوشه‌شده بی‌همتا در ناحیه </span><span dir="LTR"><span style="font-size:11.0pt;">ITS</span></span> <span style="font-family:b nazanin;">یک گونه خاص نشان می‌دهد که این موتیف‌ها می&shy;توانند به&shy;عنوان یک ابزار شناسایی گونه مورد نظر به‌کار‌ روند.</span> <strong>Aim and Background</strong><strong><span dir="RTL">:</span></strong>&nbsp; <em>Fusarium </em>species are capable of infecting a wide range of crop plants. They can rarely cause human infections. Identification of <em>Fusaria </em>to the species level is necessary for biological, epidemiological, pathological, and toxicological purposes. The aim of this study was to evaluate phylogenetic relationships and finding specified <a name="OLE_LINK185"></a><a name="OLE_LINK184">repetitive patterns clustered </a>in the area of ITS in order to identify different species of <em>Fusarium.</em><br> <strong>Materials and Methods: </strong>Ribosomal DNA internal spacer region was amplified by polymerase chain reaction. ITS PCR product sequenced and analyzed by different methods.<br> <strong>Results</strong>: Amplification resulted in approximately 550 bp in all the isolates. In the phylogram derived from analysis of the ITS region, the <em>Fusarium </em>spp. examined were divided into ten groups<br> <strong>Discission: </strong>As expected the ITS region was variable and informative.<br> The high level of variation between internal transcribed spacer is concluded from the elimination or addition of repeating units is in this area.<br> <strong>Conclusion</strong><br> Some strains are identified and some isolates definitely has a different pattern. There are repetitive patterns at the ITS in the particular species suggesting that this motifs can be used as a tool to identify species. روابط فیلوژنتیکی, هم‌ردیف‌سازی, ژن ITS Phylogenetic, Alignment,ITS 95 110 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1176-2&slc_lang=fa&sid=1 Amir Hosein Beiki امیر حسین بیکی amirbeiki@gmail.com 10031947532846008434 10031947532846008434 Yes Department of Biology, Faculty of Science, University of Qom, Qom, Iran دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم