New Cellularand Molecular Biotechnology Journal

fa بررسی مولکولی ژن های clbSو clbAدر باکتری های E.coli جداشده از بافت های توموری کولورکتال Molecular Study of clbS and clbA genes in the E.coli bacteria isolated from tissue of patients with colorectal cancer سلولی و مولکولی Cellular and molecular مقاله پژوهشی Research Article مقدمه و هدف: یکی از مهمترین عوامل در ایجاد سرطان کولورکتال، باکتریها و توکسین های حاصله از آنها است. برخی سویه های E.coli  که دارای مجموعه ژنی PKS هستند، قادرند ژنوتوکسینی به نام کلی باکتین (Colibactin) را تولید کنند. کلی باکتین درباکتریهایPKS مثبت با فعال شدن مسیر سیگنالینگ،  باعث آسیب بهDNA و درنتیجه گسترش تومور (مانند سرطان کولورکتال) می شود. بررسی مولکولی ژن های   clbSو clbA ( دو ژن از ژن های جزیره ژنی PKS) در باکتری های  E .coliجدا شده از بافت های توموری کولورکتال می باشد. مواد و روش ها: بدین منظور79 نمونه بیوپسی از بافت روده بیمار مبتلا به سرطان کولورکتال، پس از اخذ پرسشنامه و رضایت نامه تهیه گردید. با روش های میکروبی و بیوشیمیایی باکتری  E.coli جداسازی و شناسایی شد. سپس سویه ها از نظر وجود ژن های clbA وclbS  با روش  PCR، ارزیابی شد. یا فته ها:  باکتریهای E.coli ایزوله شده از نظر تست های بیوشیمیایی موتیلیتی، متیل رد، اندول و تی اس آی مثبت و برای تست های سیترات و اوره  منفی بودند.  نتایج آزمایش PCR نشان داد، برای ژن ویرولانس clbA از بین 79 سویه مورد بررسی، در 66.67% از افراد نرمال ، د ر40.91% از بیماران التهابی روده بزرگ و59.09% از مبتلایان به سرطان کولورکتال مثبت بود<img alt="" height="12" src="file:///C:UsersmajaleAppDataLocalTempmsohtmlclip1�1clip_image001.png" width="3" > و برای ژن ویرولانس clbS در 50% از افراد نرمال و بیماران التهابی روده بزرگ و 58.62%  از مبتلایان به سرطان کولورکتال مثبت بود و 27.8% نمونه ها، واجد هر دو ژن(clbA/clbS) بود. بحث: هر دو ژن   clbSو clbA جزو ژن های ضروری جزیره ژنی PKS می باشند. با توجه به نتایج به دست آمده و اهمیت کلی باکتین و رابطه آن با ایجاد سرطان کولورکتال، مطالعه کامل تر در این زمینه ضروری به نظر می رسد. Background and Aim: One of the most important factors in the development of colorectal cancer(CRC) is the bacteria and their toxins. Some strains of E. coli have the PKS gene island, which produces exotoxin called colibactin. Colibactin causes damage to the DNA and leads to the development of tumor in colorectal cancer by activating the signaling pathway. The purpose of this study was the investigation of clbS and clbA genes (two genes in the PKS Island) in E .coli isolated from colorectal tumor tissues. Materials and Methods: For this purpose, 79 biopsy samples from tissue of patients with CRC were prepared after receiving a questionnaire and consent form. By microbial and biochemical methods, these E. coli were isolated and identified and then these bacteria were evaluated for the presence of clbA and clbS genes by PCR method. Results: E.coli isolated were positive in point of biochemical tests; Motility, Indol, TSI, and MR tests and negative for Citrate and Urea tests. The molecular results showed the frequency of 66.67% , 40.91% and 59.09%  for clbA in normal subjects, the patients with IBD and CRC patients respectively. Moreover the frequency of  50%, 58.62% and 27.8% for the clbS gene in normal subjects, the patients with IBD and CRC patients respectively. Also 27.8% of the samples had both genes (clbA / clbS). Discussion: Both the clbS and clbA genes are among the essential genes of the PKS Island. Considering these results and the importance of colibactin and its relation with colorectal cancer, seems the more studies in this regard is necessary. سرطان کولورکتال , اشریشیا کلی , ژن های clbAوclbS , کلی باکتین. colorectal cancer, E.coli, clbA, clbS, Colibactin 23 30 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1212-2&slc_lang=fa&sid=1 Sajede Sahari ساجده سحری 100319475328460011057 100319475328460011057 No Department of Microbiology ,Qom branch ,Islamic Azad university ,Qom,Iran. 1- گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد قم، قم،ایران Shahla Mohammad Ganji شهلا محمد گنجی shahlamg@yahoo.com 100319475328460011058 100319475328460011058 No National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology, Tehran, Iran 2- پژوهشکده بیوتکنولوژی پزشکی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران، ایران Mojtaba Sohrabi مجتبی سهرابی 100319475328460011059 100319475328460011059 Yes Department of Microbiology ,Qom branch ,Islamic Azad university ,Qom,Iran. 1- گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد قم، قم،ایران Atieh Salighe عطیه سلیقه 100319475328460011060 100319475328460011060 No Department of Microbiology ,Qom branch ,Islamic Azad university ,Qom,Iran. 1- گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد قم، قم،ایران