<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>New Cellularand Molecular Biotechnology Journal</title>
<title_fa>مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي</title_fa>
<short_title>NCMBJ</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://ncmbjpiau.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-5458</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2228-6926</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>-</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2020</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>10</volume>
<number>38</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی همزمان 3 فاکتور ویرولانس kpsMTII، iucD و usp در اشریشیا کلی ایجاد کننده عفونت دستگاه ادراری با روش Multiplex-PCR</title_fa>
	<title>Identification of 3 Virulence Factors kpsMTII, iucD‚ usp in Urinary Tract Infection E. coli by Multiplex-PCR</title>
	<subject_fa>سلولی و مولکولی</subject_fa>
	<subject>Cellular and molecular</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;سابقه و هدف&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; باکتری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;اشریشیاکلی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;E. coli&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;) فلور طبیعی در روده طبیعی انسان و حیوانات است. این باکتری یکی از عوامل اصلی عفونت ادراری است. هدف از این مطالعه شناسایی و بررسی حضور هم&amp;shy;زمان 3 فاکتور بیماری&amp;shy;زای &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;kpsMTII&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;iucD&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&amp;nbsp; &lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;و&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;usp&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; در ژنوم سویه&amp;shy;های باکتری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; اشریشیاکلی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;ایجاد کننده عفونت ادراری بود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;مواد و روش &amp;shy;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; 60 نمونه باکتری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; اشریشیاکلی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;ایجاد کننده عفونت ادراری جمع&amp;shy;آوری گردید. باکتری&amp;shy;های مورد نظر با تست&amp;shy;های بیوشیمیایی و رنگ&amp;shy;آمیزی گرم شناسایی شدند. ژنوم باکتری از طریق کیت&amp;shy;های جداسازی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; باکتری گرم منفی جداسازی شد. سپس برای حضور هم&amp;shy;زمان 3 عامل بیماری&amp;shy;زایی مورد نظر از روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;Multiplex-PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; استفاده شد&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;یافته&amp;shy; ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; در این 60 نمونه باکتری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; اشریشیاکلی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; جداسازی شده&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، حضور ژن&amp;shy;های بیماری&amp;shy;زا، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;kpsMTII&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; 66/71 درصد، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;iucD&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;33/88&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;درصد، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;usp&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;66/36 درصد بود و هم&amp;shy;چنین حضور هم&amp;shy;زمان 3 فاکتور در 33/28 درصد نمونه&amp;shy;ها مشاهده شد&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; بین &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;فراوانی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;حضور این سه ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;با ایجاد عفونت ادراری در نمونه&amp;shy; های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;اشریشیاکلی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; مورد بررسی ارتباط معنی&amp;shy;داری وجود داشت (&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;05/&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;0&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;Pvalue&lt; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;)&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;نتیجه &amp;shy;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; بر اساس نتایج این تحقیق، مشابه با مطالعه&amp;shy; های پیشین، بین حضور این سه ژن بیماری زا در نمونه&amp;shy;های مورد مطالعه از باکتری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; اشریشیاکلی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; ایجاد کننده عفونت ادراری &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;می&amp;shy;تواند ارتباط معنی&amp;shy;دار وجود داشته باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;strong&gt;Aim and Background:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; is a normal flura in the human and animal intestinal tract&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt; This bacteria is one of the main cause of the urinary tract infection. The aim of this study was identification and simultaneously presence of 3 virulence factors, &lt;em&gt;kpsMTII&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;iucD&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;usp&lt;/em&gt; in the genome of urinary tract infection&lt;em&gt; E. coli&lt;/em&gt; strains.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods:&lt;/strong&gt; 60 samples of &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt;, which caused urinary tract infection, were collected. These bacteria were isolated by biochemical tests and gram staining. Then bacteria genome was extracted by gram-negative bacteria DNA extraction kits.&amp;nbsp; Multiplex-PCR was used for identifying of 3 virulence factors.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; In these 60 samples of isolated &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt;, the prevalence of virulence genes is as follows: &lt;em&gt;kpsMTII&lt;/em&gt; 71.66%, &lt;em&gt;iucD&lt;/em&gt; 88.33%, and &lt;em&gt;usp&lt;/em&gt; 36.66%. As also, simultaneously presence of 3 virulence factors were observed in 28.33% of samples. There was significant association between prevalence of these three genes and urinary tract infection in studied &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; isolates (Pvalue&lt;0.05).&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; According to this study results, that was similar to previous researches, could be significant related between prevalence of these three genes in studied urinary tract infection&lt;em&gt; E. coli&lt;/em&gt; samples.</abstract>
	<keyword_fa>اشریشیاکلی,عفونت ادراری, ژن های بیماری‌زا, Multiplex PCR.</keyword_fa>
	<keyword>E. coli, Urinary tract infection, Virulence genes, Multiplex PCR.</keyword>
	<start_page>99</start_page>
	<end_page>111</end_page>
	<web_url>http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-954-21&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Elham </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Siasi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>الهام</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سیاسی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>emi_biotech2006@yahoo.ca</email>
	<code>100319475328460012390</code>
	<orcid>100319475328460012390</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Collage of science, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Atefeh </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rezaei</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عاطفه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رضایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460012391</code>
	<orcid>100319475328460012391</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Collage of science, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Jamileh </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nowroozi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جمیله</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نوروزی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460012392</code>
	<orcid>100319475328460012392</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Collage of science, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
