<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>New Cellularand Molecular Biotechnology Journal</title>
<title_fa>مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي</title_fa>
<short_title>NCMBJ</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://ncmbjpiau.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-5458</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2228-6926</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>-</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1399</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2020</year>
	<month>8</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>10</volume>
<number>40</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>طراحی و ساخت سازه شبیه ساز جهت تشخیص باکتری بورخولدریا مالئی و سودومالئی</title_fa>
	<title>Design and production of a genetically simulant construct for the detection of B. malei and  pseudomaleii</title>
	<subject_fa>سلولی و مولکولی</subject_fa>
	<subject>Cellular and molecular</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;سابقه و هدف&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;: باکتری های بورخولدریا مالئی و سودومالئی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;(&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing: -0.4pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;Burkholderia &lt;em&gt;&lt;span style=&quot;background: white;&quot;&gt;mallei &lt;/span&gt;and &lt;/em&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;background: white;&quot;&gt;pseudomallei&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; species)&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; جزو عوامل بیماری زای خطرناک انسانی محسوب می شوند. تشخیص برپایه کشت برای این باکتری، هزینه بر و زمان بر و از طرف دیگر کار با این باکتری بسیار خطرناک بوده و همچنین امکان دسترسی به این باکتری و حتی ژنوم آن بسیار مشکل می باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;هدف از انجام این مطالعه طراحی و سنتز کنترل مثبتی ایمن و کارآمد برای تشخیص باکتری بورخولدریا می باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;مواد و روش ها&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;: در ابتدا، یک سازه شبیه ساز که، حاوی ژن های مرجع و اختصاصی باکتری بورخولدریا مالئی و سودومالئی می باشد و در دیگر گونه های خانواده مشاهده نمیشود ساخته شد و سپس کارایی عملیاتی سازه طراحی شده، با استفاده از روش&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Real-Time&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; کمی ( با استفاده از رنگ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SYBER Green&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; ) و کیفی(با استفاده از پروب &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TaqMan&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; )، مورد ارزیابی قرار گرفت. درنهایت محصولات تکثیری &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Real-Time&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; با استفاده از منحنی ذوب و الکتروفورز مورد بررسی قرار گرفتند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;یافته ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; میزان حداقل و حداکثر حساسیت به ترتیب 1/0پیکو گرم و 10 نانوگرم بر روی سازه طراحی شده در مطالعه حاضر، حاصل شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt;نتیجه گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family: B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size: 12pt;&quot;&gt; این سازه شبیه ساز میتواند به عنوان کنترل مثبت مناسبی، جهت تشخیص عامل بورخولدریا مورد استفاده قرار گیرد و همچنین می تواند در آینده باعث پیشرفت هرچه بیشتر کیت های تشخیصی جدید در این حوزه بشود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;strong&gt;Aim&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt; &amp; &lt;/span&gt;Background&lt;/strong&gt; the genus Burkholderia (&lt;em&gt;mallei &lt;/em&gt;&lt;em&gt;and &lt;/em&gt;&lt;em&gt;pseudomallei&lt;/em&gt; species) are classified as dangerous human pathogens. Diagnosing cultures for this bacterium is costly and time consuming and on the other hand it is very dangerous to work with and it is very difficult to access this bacterium&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt; the porpose of this research Design and production of a genetically simulant construct for the detection of &amp;nbsp;B. pseudomaleii&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Material &amp; Methods:&lt;/strong&gt; initially, a simulant construct containing the reference and specific genes of the mallei and pseudomallei species was not observed in other species of the family, and then the operational efficiency of the designed construct was quantified using Real-Time Quantitative PCR. Quality (SYBER Green) and qualitative (using TaqMan probe) were evaluated. Finally, Real-Time PCR amplification products were analyzed by melting curve and electrophoresis.&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; the minimum and maximum sensitivity were 0.1 pg and 10 ng on the constructs designed in the present study, was obtained.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; This simulat can be used as a positive control for the detection of the Burkholderia agent and can further enhance the development of new diagnostic kits in the field.</abstract>
	<keyword_fa>پاتوژن ها, بورخولدریا, Real Time PCR, کلونینگ,  IAU science. ,   SYBER Green</keyword_fa>
	<keyword>pathogens, Burkholderia, Real Time PCR, cloning, SYBR Green, IAU science.</keyword>
	<start_page>65</start_page>
	<end_page>76</end_page>
	<web_url>http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1584-3&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mohammad javad </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>dehghan esmatabadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدجواد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دهقان عصمت آبادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mohammad_dehghan@mut.ac.ir</email>
	<code>100319475328460011707</code>
	<orcid>100319475328460011707</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Maleke Ashtar University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>1مجتمع دانشگاهی شیمی و مهندسی شیمی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahmood</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>barati</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>براتی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460011708</code>
	<orcid>100319475328460011708</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Biotechnology, School of Allied Medical Sciences Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad ali </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>yaghobi moghaddam</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدعلی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>یعقوبی مقدم</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460011709</code>
	<orcid>100319475328460011709</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Maleke Ashtar University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>1مجتمع دانشگاهی شیمی و مهندسی شیمی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
