<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>New Cellularand Molecular Biotechnology Journal</title>
<title_fa>مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي</title_fa>
<short_title>NCMBJ</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://ncmbjpiau.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-5458</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2228-6926</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>-</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1399</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2021</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>11</volume>
<number>42</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>جداسازی و شناسایی گونه ‌های نوکاردیا از نمونه های شست وشوی برونش و خلط بیماران مشکوک به نوکاردیازیس با استفاده از روش مولکولی مبتنی بر توالی PCR  در استان خوزستان</title_fa>
	<title>Isolation and identification of Nocardia species from bronchial lavage and sputum specimens of patients suspected of Nocardiasis using molecular method based on PCR sequence in Khuzestan province</title>
	<subject_fa>سلولی و مولکولی</subject_fa>
	<subject>Cellular and molecular</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;سابقه&#8204; و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; &lt;em&gt;نوکاردیا&lt;/em&gt; عضوی از خانواده نوکاردیاسه است که54 گونه برای انسان بیماری&amp;shy;زا هستند. با توجه&amp;shy;به اینکه مطالعه&amp;shy;های کمی در خصوص شیوع نوکاریازیس در استان خوزستان انجام گرفته است هدف از انجام این مطالعه جداسازی و شناسایی گونه&amp;shy;&#8204;های &lt;em&gt;نوکاردیا&lt;/em&gt; از نمونه&amp;shy;های شست&amp;shy;وشوی برونش و خلط بیماران مشکوک به نوکاردیازیس با استفاده از روش مولکولی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; در استان خوزستان است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;مواد و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;روش&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;در این بررسـی تعـداد 178 نمونه شست&amp;shy;وشوی برونش و 100 نمونه خلط از بیماران مشکوک به نوکاردیازیس در طی مدت 1سال جمع&amp;shy;آوری گردیده و به آزمایشگاه میکروب&amp;shy;شناسی شهر اهواز جهت شناسایی دقیق فرستاده شدند سپس از شناسایی از طریق &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;ردیابی ژن&amp;shy;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;16 S rRNA&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;،&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; NG &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;و&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Bet&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;انجام گرفت و محصولات&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; PCR &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;تعیین توالی گردید&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; در این مطالعه 278 نمونه شامل 178 نمونه شست&amp;shy;وشوی برونش و 100 نمونه خلط اخذ شده از بیماران&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مشکوک&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;به&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;نوکاردیوزیس&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مورد&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;بررسی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;قرار&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;گرفتند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;. &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;نتایج تعیین توالی نـشان داد که 27 مورد از نمونه&amp;shy;ها از نظر گونه&amp;shy;های &lt;em&gt;نوکاردیا&lt;/em&gt; مثبت بود&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; .&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;از 7 نمونه شست&amp;shy;و شوی برونش، 6&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مورد متعلـق&amp;shy;بـه گونـه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;N . Nova &lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;و 1 مورد متعلق&amp;shy;به گونه &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;farcinica&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;N&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;است. 20 نمونه مربوط به خلط و8 متعلق&amp;shy;به &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;N. cyriacigeorgica&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; 4نمونه مربوط به &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;farcinica&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;N&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; 3 نمونه مربوط&amp;shy;به &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp;N. asteroide&lt;strong&gt;s&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; و5 نمونه مربوط&amp;shy;به &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp;N. nova&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; بود. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مطالعه حاضر نشان از توانای بالای روش مولکولی در تشخیص دقیق جنس و گونه &lt;em&gt;نوکاردیا&lt;/em&gt; دارد و لزوم مطالعه بیش&amp;shy;تر این بیماری در مطالعه&amp;shy;های آینده بیش از پیش احساس می&amp;shy;شود. نوکاردیوزیس نباید به&amp;shy;عنوان یک بیماری غیرمعمول تلقی شود هم&amp;shy;چنین در مطالعه ما نشان داده شد که شاخص بالایی از از نظر شیوع بالینی به&amp;shy;خصوص در بیماران نقص ایمنی و بیماران ریوی و مبتلا به سل دارد. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;a href=&quot;https://en.wikipedia.org/wiki/Restriction_fragment_length_polymorphism&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;strong&gt;Aim and Background:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;Nocardia&lt;/em&gt; is a member of the Nocardiaceae family. Due to the fact that few studies have been conducted on the prevalence of nocariasis in Khuzestan province, the aim of this study was to isolate and identify nocardia species from bronchial lavage and sputum specimens of patients suspected of nocardiasis using molecular PCR in Khuzestan province.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and &lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;Methods:&lt;/strong&gt; In this study, 178 bronchial lavage samples and 100 sputum samples were collected from patients suspected of nocardiasis during 1 year and sent to Ahvaz Microbiology Laboratory for more accurate identification, then identified by PCR for gene tracking. 16 S rRNA, NG and Bet were performed and PCR products were sequenced.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; In this study, 278 samples including 178 samples of bronchial lavage and 100 samples of sputum taken from patients suspected of neocardiosis were examined. Sequencing results showed that 27 of the samples were positive for Nocardia species. Out of 7 bronchial lavage samples, 6 belonged to N type. Nova and 1 case belong to .&lt;em&gt;N .farcinica&lt;/em&gt;. 20 samples belonged to sputum and 8 belonged to N. cyriacigeorgica, 4 samples belonged &lt;em&gt;N .farcinica&lt;/em&gt; 3 samples belonged to &lt;em&gt;N. asteroides&lt;/em&gt; and 5 samples belonged to &lt;em&gt;N. nova&lt;/em&gt;.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; The present study shows the high ability of molecular methods in accurate diagnosis of species and species of Nocardia and the need for further study of this disease in future studies is felt more than ever.</abstract>
	<keyword_fa>نوکاردیا, تعیین توالی,نوکاردیازیس, برونش, خلط, IAU science</keyword_fa>
	<keyword>Nocardia, sequencing, Nocardiasis, bronchitis, sputum, IAU science</keyword>
	<start_page>9</start_page>
	<end_page>17</end_page>
	<web_url>http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1659-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mohammad </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hashemzadeh </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>هاشم زاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460011778</code>
	<orcid>100319475328460011778</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Student Research Committee, Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences, Ahvaz, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، اهواز، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Aram </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>asareh zadegan dezfuli </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>آرام</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عصاره زادگان دزفولی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>aramasareh836@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460011779</code>
	<orcid>100319475328460011779</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Ahvaz Jundishapur University of  Medical Sciences, Ahvaz, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اهواز، اهواز، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sara </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Afzal zadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سارا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>افضل زاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460011780</code>
	<orcid>100319475328460011780</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Infectious Diseases, Razi Teaching Hospital, Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences Ahvaz, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیماری‌های عفونی، بیمارستان آموزشی رازی، دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز ، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
