other بررسی میزان بیان lncRNA GAPLINC در نمونه های سرطان پستانِ سه گانۀ منفی در نمونه های متاستاتیک و غیرمتاستاتیک ژنتیک Genetics مقاله پژوهشی Research Article <span style="font-size:11pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">سابقه و هدف</span></span></b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">:</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> هدف از این مطالعه بررسی میزان بیان </span></span><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt">lncRNA <i>GAPLINC</i></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> برای اولین بار در نمونه های بافت سرطان پستان سه گانۀ منفیِ متاستاتیک و غیرمتاستاتیک با استفاده از تکنیک </span></span><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt">Real-Time PCR</span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> به منظور یافتن مارکرِ احتمالی در تشخیص سرطان پستان سه گانۀ منفیِ متاستاتیک می باشد. </span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt" lang="EN"></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">مواد و روش‌ها</span></span></span></b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">:</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"> پس از انتخاب </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt"><span style="color:black">lncRNA</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"> کاندید و طراحی پرایمرها بر روی توالیِ ژنِ هدف،&nbsp; </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt"><span style="color:black">RT-quantitative PCR</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">با استفاده از پرایمرها و سایبرگرین بر روی 50 نمونۀ بافت تازه شامل 20 نمونۀ بافت سرطان پستانِ سه گانۀ منفیِ متاستاتیک، 20 نمونۀ بافت سرطانِ پستان غیرمتاستاتیک و 10 نمونۀ کنترل انجام شد. در این مطالعه از ژن </span></span></span><i><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt"><span style="color:black">&beta;-actin</span></span></i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"> به عنوان کنترل داخلی استفاده گردید که طبق مطالعه‌های صورت‌گرفته کنترل مناسبتری از نظر پایداریِ بیان در مقایسه با سایر ژنها در آزمایش‌های مولکولیِ سرطانِ پستان می باشد. </span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">برای آنالیز آماری از نرم‌افزار </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt"><span style="color:black">GraphPad Prism</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"> استفاده و </span></span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black">۰۵/۰ </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span style="color:black">Adj. p-value <</span></span><span style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"><span style="color:black"> به عنوان سطح معنی داری درنظر گرفته شد. </span></span></span><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt"><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">یافته</span></span></b><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt">‌</span></b><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">ها</span></span></b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">: </span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">افزایشی در سطحِ بیانِ </span></span><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt">lncRNA <i>GAPLINC</i></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> در نمونه‌های سرطانِ پستان سه‌گانۀ منفی در مقایسه با نمونه‌های سرطان پستان سه‌گانۀ منفیِ غیرمتاستاتیک با مقدار </span></span><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt">p</span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> کمتر از 05/0 مشاهده شد.</span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt" lang="EN"></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">نتیجه‌گیری</span></span></b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">: </span></span><i><span dir="LTR" lang="EN" style="font-size:10.0pt">GAPLINC</span></i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> می‌تواند به‌عنوان یک نشانگر زیستیِ بالقوّه در تشخیص سرطانِ پستانِ متاستاتیک از غیرمتاستاتیک عمل کند.</span></span><b><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt" lang="EN"></span></b></span></span></span></span><br> &nbsp; <span style="font-size:11pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:10.0pt">Aim</span></b><b><span style="font-size:10.0pt"> and Background</span></b><b><span lang="EN" style="font-size:10.0pt">:</span></b><span lang="EN" style="font-size:10.0pt"> For the first time in this study, we investigated the expression level of lncRNA <i>GAPLINC</i> in metastatic and non-metastatic triple-negative breast cancer tissue samples using real-time PCR technique in order to find a possible marker in the diagnosis of metastatic triple-negative breast cancer.</span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="EN" style="font-size:10.0pt">Materials and Methods:</span></b><span lang="EN" style="font-size:10.0pt"> After selecting the candidate lncRNA and designing primers on target gene sequence, the expression level of lncRNA <i>GAPLINC</i> was quantified using RT-qPCR with specific primers and SYBR Green on 50 fresh tissue samples, including 20 triple-negative metastatic and 20 non-metastatic breast cancer tissues, and 10 control tissue samples. The internal control used in this study included the <i>&beta;-actin</i> gene, a more suitable control in terms of stability of expression compared to other genes in breast cancer molecular tests. GraphPad Prism software was used for statistical analysis and Adj. p-value < 0.05 was considered as a significant level.</span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="EN" style="font-size:10.0pt">Results: </span></b><span lang="EN" style="font-size:10.0pt">An increase was observed in the expression level of lncRNA <i>GAPLINC</i> in triple-negative breast cancer samples compared to non-metastatic triple-negative breast cancer samples, with Adj. p-value < 0.05. </span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span lang="EN" style="font-size:10.0pt">Conclusion: </span></b><i><span lang="EN" style="font-size:10.0pt">GAPLINC</span></i><span lang="EN" style="font-size:10.0pt"> can serve as a potential biomarker in the diagnosis of metastatic from non-metastatic breast cancer.</span></span></span><br> &nbsp; سرطان پستان, سه گانۀ منفی, متاستاز, lncRNA GAPLINC, بیومارکر. Breast cancer, Triple negative, Metastatic, lncRNA GAPLINC, Biomarker. 63 71 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1976-2&slc_lang=other&sid=1 Shiva Soleimani شیوا سلیمانی 100319475328460015596 100319475328460015596 No Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran. 1. گروه زیست شناسی، واحد علوم تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران Farkhondeh Pouresmaeili فرخنده پوراسماعیلی pouresfar@gmail.com 100319475328460015597 100319475328460015597 Yes Department of Medical Genetics, Faculty of Medicine & Men’s Health and Reproductive Health Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran 2. گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی و مرکز تحقیقات سلامت مردان و سلامت باروری ، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی ، تهران، ایران Iman Salahshourifar ایمان سلحشوری پور 100319475328460015598 100319475328460015598 No .Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran. 1. گروه زیست شناسی، واحد علوم تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران