fa تعیین هویت ایزوله‏ های بالینی مایکوباکتریوم جدا شده از بیماران ایرانی با استفاده از روش‏های فنوتیپیک و مولکولی میکروبیولوژی Microbiology مقاله پژوهشی Research Article <p align="justify"> <strong>سابقه و هدف.</strong> از آنجایی که گونه‏های مختلف مایکوباکتریوم دارای الگوی حساسیت دارویی متفاوتی می‏باشند، شناسایی دقیق برای به کار گیری درمان صحیح ضروری است و نهایتاً می تواند بر نتیجه درمان بیمار موثر باشد. در میان روش‏های مولکولی گوناگون استفاده از بررسی پلی مورفیسم حاصل از هضم آنزیمی محصول (PCR (PRAبر اساس ژن hsp65 به علت آسان بودن، سریع و ارزان بودن برای شناسایی ایزوله‏های پاتوژن مایکوباکتریومی تا سطح گونه ارجهیت دارد. تلفیقی از روش‏های فنوتیپیک و PRA بر اساس قطعه 441 جفت بازی از ژن hsp65 برای شناسایی تنوع گونه‏های ایزوله‏های بالینی مایکوباکتریومی مورد استفاده قرار گرفت. </p><p align="justify"><strong>مواد و روش‏ها.</strong> سویه‏های مورد بررسی شامل 270 ایزوله‏های بالینی مایکوباکتریومی می‏شدند که از 2358 بیمار در دو آزمایشگاه مرجع جمع آوری شده بودند. تعداد 207 ایزوله متعلق به مایکوباکتریوم توبرکولوزیس به وسیله روش‏های فنوتیپیک رایج و PCR اختصاصی بر اساس شناسایی IS6110 تشخیص داده شدند. ایزوله‏های متعلق به مایکوباکتریوم‏های محیطی (NTM) با استفاده از تعدادی تست فنوتیپکی و PRA ژن hsp65 مورد شناسایی قرار گرفتند. </p><p align="justify"><strong>یافته‏ها.</strong> از تعداد 270 سویه بالینی تعداد 207 ایزوله با استفاده از روش‏های فنوتیپکی و PCR اختصاصی بر اساس IS6110، به عنوان مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شناخته شدند. سویه‏های NTM (63 ایزوله) تنوعی از گونه‏های مختلف شامل 12 ایزوله M. simiae، 9 ایزوله M. fortuitum، 5 ایزوله M. gordonae، 5 ایزوله M. abscessus، 5 ایزوله M. kansasii و گونه‏های کمیاب شامل 3 ایزوله M. massilainase، 3 ایزوله M. thermoresitbile، 2 ایزوله M. senegalense type 2، 1 ایزوله M. conceptionense type 1 یا M. senegalense type 1، 1 ایزوله M. phlei، 1 ایزوله M. chelonae، 1 ایزوله M. nonchromogenicum، 1 ایزوله M. genavense،1 ایزوله M. montefiorense یا M. triplex،1 ایزوله M. branderi، 1 ایزوله M. novocastrense، 1 ایزوله M. nebraskense،1 ایزوله M. lentiflavumو 1 ایزوله M. avium شدند. </p><p align="justify"><strong>نتیجه گیری.</strong> این مطالعه نشان داده که تکنیک hsp65-PRA یک روش ساده، سریع و دقیق برای شناسایی ایزوله‏های بالینی NTM می باشد. </p> <p align="justify"> <strong>Aim and Background.</strong> As mycobacterial species have different drug susceptibilities, precise identification is crucial for adoption of correct drug therapy and can ultimately influence patient outcome. Among various molecular methods, PCR-restriction fragment length polymorphism (PRA) based on hsp65 gene is preferred since it offers an easy, rapid, and inexpensive means of identifying pathogenic mycobacterial isolates to species level. A combination of phenotypic tests and PCR-restriction fragment length polymorphism (PRA) method targeting 441 bp hsp65 DNA used to find species diversity of Iranian clinical strains of mycobacteria.</p><p align="justify"> <strong>Materials and Methods.</strong> The test strains consisted of 270 clinical isolates of mycobacteria recovered from 2358 patients in two reference laboratories. A total of 207 isolates belong to M. tuberculosis were initially identified using conventional phenotypic techniques and specific PCR, based on detection of IS 6110. The isolates belonging to non tuberculosis mycobacteria (NTM) were subjected to further definitive identification using batteries of phenotypic tests and hsp65-PRA. </p><p align="justify"><strong>Results.</strong> Out of 270 clinical strains, 207 isolates were found to be M. tuberculosis by phenotypic techniques and specific PCR based on detection of IS 6110. NTM strains (63 isolates) represented a variety of the species comprised of 12 M. simiae, 9 M. fortuitum, 5 M. gordonae , 5 M. abscessus, 5 M. kansasii and some rare species including 3 M. massilainase, 3 M. thermoresitbile, 2 M. senegalense type 2, 1 M. conceptionense type 1 or M. senegalense type 1, 1 M. phlei, 1 M. chelonae, 1 M. nonchromogenicum, 1 M. genavense, 1 M. montefiorense or M. triplex, 1 M. branderi, 1 M. novocastrense, 1 M. nebraskense, 1 M. lentiflavum and 1 M. avium.</p><p align="justify"> <strong>Conclusion.</strong> This study showed that hsp65-PRA technique offers a simple, rapid, and accurate method for the identification of NTM clinical isolates. </p> مایکوباکتریوم غیرسلی، تعیین هویت، hsp65،PRA Non-Tuberculous Mycobacteria, Identification, hsp65, PRA 49 56 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-61-26&slc_lang=fa&sid=1 Saeed Zaker Bostanabad سعید ذاکر بستان آباد 10031947532846001487 10031947532846001487 No Department of Biology, Faculty of Sciences, Islamic Azad University, Parand Branch,Tehran- Iran گروه زیست شناسی ،دانشکده علوم زیستی،دانشگاه آزاد اسلامی واحد پرند،تهران، ایران Parvin Heidarieh پروین حیدریه 10031947532846001488 10031947532846001488 No Alborz University of Medical Science, Alborz- Iran استادیار،دانشکده بهداشت علوم پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی البرز، البرز، ایران Nasrin Sheikhi نسرین شیخی 10031947532846001489 10031947532846001489 No Masoud Laboratory, Tehran-Iran آزمایشگاه مسعود، تهران،ایران Mostsfa Ghalami مصطفی قلمی 10031947532846001490 10031947532846001490 No Masoud Laboratory, Tehran-Iran آزمایشگاه مسعود، تهران،ایران Shahin Pour Azar شاهین پور آذر 10031947532846001491 10031947532846001491 No Masoud Laboratory, Tehran-Iran آزمایشگاه مسعود، تهران،ایران Seyed Ali Nojumi سید علی نجومی 10031947532846001492 10031947532846001492 No Pasteur Institute of Iran, Tehran- Iran بخش آب و غذا،انیستیتیو پاستور ایران، تهران،ایران abdolrazagh Hashemi-Shahraki عبدالرزاق هاشمی شهرکی abdolrazaghh@gmail.com 10031947532846001493 10031947532846001493 Yes Infectious and Tropical Diseases Research Center, Ahvaz Jundishapur University of Medical. Sciences, Ahvaz- Iran. گروه میکروبیولوژی،دانشکده علوم پزشکی، مرکز تحقیقات بیماریهای عفونی و گرمسیری، دانشگاه جندی شاپور اهواز، اهواز،ایران