fa مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن Wdhn13 (LEA) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها سلولی و مولکولی Cellular and molecular مقاله پژوهشی Research Article <p><strong>سابقه و هدف </strong><strong>: </strong>پروتئین‌های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین‌های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی‌های عمومی ژن‌های LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می‌آید. روش‌های بیو انفورماتیکی روش‌های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می‌باشند. </p><p><strong>مواد و روشها </strong><strong>: </strong>در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn13 پروتئین های LEA درگونه های مختلف گندم از 8 گندم زراعی و وحشی(شامل سرداری، نان گنبد، دوروم شوش، دورورم بروجرد، اورارتو، دیکوکوئیدز،‌ تائوشی و اسپلتوئیدز) استفاده شد و توالی بدست آمده از آنها با تنها توالی ژن Wdhn13 مربوط به گندم نان در پایگاه اطلاعاتی NCBI از طریق نرم افزار های بلاست، CLC و داروین مقایسه شد </p><p><strong>یافته ها: </strong>نتایج آنالیز نشان داد که توالی ژن Wdhn13 در گندم سرداری با توالی ژن Wdhn13 مربوط به گندم نان موجود در NCBI بیشترین شباهت و توالی ژن Wdhn13 در گندم اورارتو کمترین شباهت را با توالی ژن Wdhn13 مربوط به گندم نان موجود در NCBI دارد. علت این تفاوت هم تغییرات در اسید های آمینه بر اساس تغییرات در توالی DNA نمونه ها می باشد. همردیفی از طریق نرم افزار BLAST و درخت فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس الگوریتم UPGMA نیز موید این نتیجه بودند. همچنین درخت فیلوژنتیکی رسم شده سیر تکاملی منطقی را در ارتباط با این ژن برای اشتقاق گونه های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید از یکدیگر نشان داد. جدول فاصله توالی ها نیز موید این بود که نتایج BLAST و درخت فیلوژنتیک بر هم منطبق می باشند </p><p><strong>نتیجه گیری </strong>: نتایج این تحقیق نشان داد که با توجه به تکثیر ژن مورد نظر بر روی ژنوم های دیپلوئید اورارتو( AA ) و گونه های تتراپلوئید و هگزاپلوئید شامل ژنوم AA و عدم تکثیر برروی گونه های اسپلتوئیدز ( BB ) و تائوشی( DD ) می توان نتیجه گرفت که ژن Wdhn13 بر روی ژنوم AA گندم قرار دارد. </p> <p> <strong> Aim and background.</strong> LEA proteins in wheat and cotton were identified and discussed as the first report in late embryonic proteins . Public classification for more LEA genes was inferred from the structure of the protein domain or chemically derived characters. Bioinformatics methods in genome research methods are useful in situations outside the laboratory . </p><p><strong>Material and Methods.</strong>  In this study, LEA proteins for Wdhn13 genes in 8 wheat and wild wheat (including Triticum aestivum cv. Sardari, aestivum gonbad, durum Shosh, durum borojerd, urartu, dicocoides, tauschii and speltoides) were used and sequences from Wdhn13 was compared with Single gene sequences of Wdhn13 in NCBI </p><p><strong>Results.</strong> The result of analysis showed that the Wdhn13 gene sequences in Sardari wheat were the most similar to the sequences in NCBI and the Wdhn13 gene sequences in <i>urartu</i> have the lowest similarity to the sequences in NCBI one. This difference is due to amino acid changes in the DNA sequence of samples . BLAST and Phylogenetic tree drawn from DNA sequence based on the UPGMA algorithm also confirmed this result. The Phylogenetic tree drawn with the logical evolution of the gene for the derivation of diploid species, and hexaploid, tetraploid was indicated. The table of sequence also confirmed that the sequence of the BLAST results and Phylogenetic trees are consistent over the time. </p><p><strong>Conclusion.</strong>The main result of this study was that given the amplification of target gene on the genomes of diploid, tetraploid and hexaploid species including genome AA and non-amplification on Species <i>speltoides</i> (BB) and <i>tauschii</i> (DD), it can be concluded that there is a target gene on the AA wheat genome. </p> گندم، ژن Wdhn13 ، پروتئین LEA Wheat, Wdhn13 gene, LEA Protein 19 27 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-61-47&slc_lang=fa&sid=1 Mehran Falaknaz مهران فلک ناز 10031947532846002190 10031947532846002190 No Plant Breeding of Ilam University, Ilam, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ایلام Ali Ashraf Mehrabi علی اشرف مهرابی 10031947532846002191 10031947532846002191 No Agronomy and Plant Breeding Department, Ilam University, Ilam, Iran گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه ایلام Danial Kahrizi دانیال کهریزی dkahrizi@yahoo.com 10031947532846002192 10031947532846002192 Yes Agronomy and Plant Breeding Department, Razi University, Kermanshah, Iran دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه رازی کرمانشاه Aliasghar Nasrollah Nejad علی اصغر نصراله نژاد 10031947532846002193 10031947532846002193 No Agronomy and Plant Breeding Department, Agricultural Sciences & Natural Resources University of Groan گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان Kheir elah Yari خیراله یاری 10031947532846002194 10031947532846002194 No Medical Biology Research Center, Kermanshah University of Medical Sciences مرکز تحقیقات بیولوژی پزشکی دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه