fa مطالعه فیلوژنتیکی و فیزیکوشیمیایی ژن SOS1 در گونه های مختلف گیاهی سلولی و مولکولی Cellular and molecular مقاله پژوهشی Research Article <b>سابقه و هدف: </b>سیستم های SOS مهم ترین نقش را در تحمل شوری گیاه دارد. این سیستم در آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان یک سیستم پیام رسانی سلول در مسیرهای تحمل به تنش شوری عمل می‌کند. <br><b>مواد و روش ها:</b> در این تحقیق با بررسی توالی ژن sos1 در آرابیدوبسیس از پایگاه Tair، EBI، NCBI، plantcare وEXPASY و هم چنین جهت بررسی روابط این ژن در سیزده گونه گیاهی مختلف، میزان همولوژی آن ها از لحاظ میزان تشابه با نرم افزارهای MEGA5، Bioedit و UPGMA تعیین گردید. <b><br>یافته ها:</b> بر مبنای نتایج تجزیه کلاستر، توالی پروتئینی این ژن در سه گروه قرار گرفت. نتایج ماتریس تکاملی نشان داد بیشترین فاصله بین آرابیدوپسیس و آجیلوپس توچی و کم ترین فاصله بین گندم نان و آجیلوپس توچی وجود داشت. نتایج هم ردیف نمودن توالی پروتئینی نشان داد که توالی ژن sos1 در این گیاهان، در 15 اسید آمینه کاملاً مشابه است. <b><br>بحث:</b> وجود ناحیه ABRE که در پاسخ به اسید آبسزیک فعال می شود و هم چنین جعبه CAAT که یک ناحیه جهت افزایش بیان ژن می باشد در همه نواحی پروموتوری گیاهان مورد مطالعه، حاکی از پتانسیل گیاهان حاوی ژن (SOS1) جهت مقابله با تنش های غیر زیستی می باشد. <br><b>نتیجه گیری:</b> تشابه 15 اسید آمینه در توالی پروتئینی در این گیاهان بیانگر ناحیه حفاظت شده در طی فرایند تکامل است و می تواند دارای نقش ساختاری مهمی در عملکرد پروتئین داشته باشد و توالی نوکلئوتیدی آن جهت طراحی پرایمر نیز پیشنهاد گردد. <br>   <b>Aim and Background:</b> Soil salinity is one of the major abiotic stresses reducing yield crop. SOS (Salt overly sensitive) system in Arabidopsis thaliana act as cellular signaling system in salinity tolerance pathways. SOS1 has an important role in salinity tolerance. <b> Materials and Methods:</b> In this study, SOS1 gene sequence identified in various plants has been recorded in the databases such as Tair, EBI, NCBI, plant care and EXPASY. We use an in silico analysis in order to determine phylogenetic study and the homology of 13 plant species by bioedit, UPGMA and MEGA5 software.<br><b> Results:</b> The cluster analysis showed that sos1 protein sequences of these plants classified in three groups. The results of the evolutionary matrix showed that the most distance was between Aegilops tauschii and Arabidobsis thaliana (0.542) and the least distance was between Triticum aestivum and Aegilops tauschii (0.004). Promoter Sequence analysis of SOS1 gene showed that, the ABRE and CAAT boxes were found in all areas of plant promoter. Also, aligning protein sequences showed complete similarity in 15 Amino acids. <br><b>Conclusion:</b> Due to the presence of ABRE box activated in response to Abscisic acid and CAAT box and increases gene expression in all areas of plant promoter, suggests the potentiality of plants to cope with abiotic stresses. Complete similarity in 15 Amino acids shows conserved region during the evolution process and can have an important structural role in the protein's function and nucleotide sequences of those suggested to design primers. : شوری, sos1 , آنالیز فیلوژنتیکی , تجزیه کلاستر salinity, sos1, phylogenetic analysis, cluster analysis 8 12 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-533-2&slc_lang=fa&sid=1 Farzaneh Fatemi فرزانه فاطمی f.fatemi88@yahoo.com 2093623293 10031947532846004003 No University of Agriculture and Natural Resources of Sari پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری Hamid Najafi zarrini حمید نجفی زرینی najafi316@yahoo.com 10031947532846004004 10031947532846004004 Yes University of Agriculture and Natural Resources of Sari دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، Parviz Heydari پرویز حیدری parviz63@gmail.com 10031947532846004005 10031947532846004005 No University of Agricultural Sciences and Natural Resources of Sari دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری،