fa مطالعه بیوانفورماتیکی ژن Wdhn13 در گونه‌های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید گندم با استفاده از روش Insilco AFLP Analysis سلولی و مولکولی Cellular and molecular مقاله پژوهشی Research Article <p><strong>سابقه و هدف</strong>: ژن Wdhn13 کد کننده پروتئین های گروه 2 LEA می باشد. پروتئین های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. ساختار اولیه پروتئین های LEA شامل دمین های اولیه باردار و بدون بار از آمینواسید های قطبی باقی مانده اما غیرآبدوست می باشد، که دلالت برآبدوست بودن پروتئین‌های LEA دارد. </p><p><strong>مواد و روشها</strong>: در این تحقیق روابط فیلوژنتیکی و بیوانفورماتیکی ژن Wdhn13 در 8 گونه گندم مطالعه شد و جهت آنالیز های مولکولی 3 آنزیم برشی: HindIII با سایت برشی aagctt، AluBI با سایت برشی agct و TaqI با سایت برشی tcga استفاده شد و توسط نرم افزار بیولوژیکی CLC به صورت Insilco و در شرایط خارج آزمایشگاهی به توالی ها اعمال شد. </p><p><strong>یافته ها</strong>: نتایج حاصل از آنالیزهای فیلوژنتیکی بر اساس الگوریتم UPGMA نشان دهنده این موضوع بود که گندم های مورد بررسی از لحاظ این ژن در3 گروه قرار دارند.که گروه اول شامل 4 رقم گندم نان(توالی موجود در NCBI)، گندم سرداری، گندم دوروم شوش و گندم دوروم بروجرد، گروه دوم شامل 1رقم وحشی اورارتو و گروه سوم شامل 2 رقم نان گنبد و دیکوکوئیدز بودند.</p><p><strong> نتیجه گیری</strong>: نتایج این تحقیق نمایانگر ارتباط ویژه و نزدیکی بعضی گونه های مورد مطالعه بود. </p> <p><strong>Aim and background</strong>: The Wdhn13 gene codes the LEA 2 protein family. LEA proteins were identified and discussed in wheat and cotton as a proteins cumulative first time in the late embryo period. The primary structure of LEA proteins, including early charged domains and non-charged of polar amino acid residues non hydrophilic is that LEA proteins are being implicated on hydrophilic. </p><p><strong>Material and Methods</strong>: in this research, the Phylogenetic and bioinformatics relationship of Wdhn13 in 8 wheat species was investigated. The HindIII (AAGCTT), AluBI (AGCT) and TaqI (TCGA) restriction enzyme were used for molecular analysis and by biological CLC main workbench 6 software the Insilco and out of vitro were applied in sequence</p><p> <strong>Result</strong>: Phylogenetic analysis result based on UPGMA algorithm showed that studied wheat species were divided into 3 clusters. The first cluster includes 4 wheat cultivar NCBI database’s sequence, T.aestivum CV Sardari, T.durum CV shosh, T.durum CV borojerd. The T.urartu was located in the second cluster alone. The third cluster includes T.aestivum CV gonbad and T.dicocoides.</p><p><strong> Conclusion</strong>: The results indicated a relationship among some wheat species. </p> پروتئین های LEA، مقاومت به خشکی، گندم، Insilco AFLP Analysis LEA Protein, Drought resistance, Wheat, Insilco AFLP Analysis 15 20 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-261-5&slc_lang=fa&sid=1 Mehran Falaknaz مهران فلک ناز mehran.falaknaz@yahoo.com 10031947532846002667 10031947532846002667 No Agronomy and Plant Breeding Department, Ilam University, Ilam, Iran گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه ایلام Ali Ashraf Mehrabi علی اشرف مهرابی a.mehrabi@mail.ilam.ac.ir 10031947532846002668 10031947532846002668 No Agronomy and Plant Breeding Department, Ilam University, Ilam, Iran گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه ایلام Danial Kahrizi دانیال کهریزی dkahrizi@yahoo.com 10031947532846002669 10031947532846002669 Yes Agronomy and Plant Breeding Department, Razi University, Kermanshah, Iran گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه رازی کرمانشاه Aliasghar Nasrollah Nejad علی اصغر نصراله نژاد ali1346nn@yahoo.com 10031947532846002670 10031947532846002670 No Agronomy and Plant Breeding Department, Agricultural Sciences & Natural Resources University of Groan, Agricultural Sciences & Natural Resources University of Gorgan, Iran گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان Kheirollah Yari خیراله یاری kyari@kums.ac.ir 10031947532846002671 10031947532846002671 No Medical Biology Research Center, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran مرکز تحقیقات بیولوژی پزشکی دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه