<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>New Cellularand Molecular Biotechnology Journal</title>
<title_fa>مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي</title_fa>
<short_title>NCMBJ</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://ncmbjpiau.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-5458</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2228-6926</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>-</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1393</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2014</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>4</volume>
<number>16</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی فیلوژنتیکی گونه Charybdis hellerii از سخت‌پوستان (سخت‌پوستان، خرچنگ‌ها) در سواحل بین جزر و مدی چابهار بر اساس توالی ژنی قطعه‌ی 1 ژن سیتوکروم اکسیداز (CO1)</title_fa>
	<title>Phylogeny of Charybdis hellerii (Decapoda, Crabs) in intertidal coasts of Chabahar based on cytochrome oxidase subunit 1 (CO1) gene sequence</title>
	<subject_fa>ژنتیک</subject_fa>
	<subject>Genetics</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Research Article</content_type>
	<abstract_fa>
&lt;b&gt;سابقه و هدف :&lt;/b&gt; Charybdis hellerii گونه‌ی بسیار شناخته ‌شده‌ای در اقیانوس هند است. بررسی‌های مولکولی فراوانی بر روی این‌گونه در سایر نقاط دنیا انجام شده است. در ایران مطالعات مولکولی کمی بر روی خرچنگ‌ها صورت گرفته شده است، با این حال مطالعات ریخت‌شناسی بسیار جامع و مفیدی بر روی آنها انجام گرفته شده است. در تحقیق حاضر برای اولین بار در ایران به بررسی مولکولی جنس Charybdis گونه‌ی Charybdis hellerii  پرداخته شده است.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;مواد و روش‌ها : &lt;/b&gt;در بهار سال 1392 و از سواحل صخره‌ای خلیج چابهار نمونه‌ها جمع‌آوری گردیدند.  پس از نگهداری در دمای 20- ، برش بافتی از آبشش نمونه‌ها جدا گردید. عمل استخراج DNA با استفاده از روش CTAB انجام گرفت.  واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) انجام شد . پس از توالی یابی، درخت فیلوژنی گونه‌ی مورد نظر رسم گردید.&lt;br&gt;&lt;b&gt; یافته‌ها : &lt;/b&gt;
با بررسی‌های مورفولوژی گونه مورد مطالعه Charybdis hellerii  شناسایی گردید و بررسی‌های مولکولی داده های مورفولوژی را تأیید کردند. توالی نوکلئوتیدی به دست آمده در قطعه‌ی 1 ژن سیتوکروم اکسیداز(CO1)  مورد آنالیزهای مولکولی قرار گرفت. با آنالیزهای انجام‌شده و ترسیم درخت فیلوژنی مشخص شد که گونه‌ی ایرانی  با 94 درصد بوت استرپ حمایت با گونه C. hellerii در یک کلاد قرار گرفته است. 
&lt;br&gt;&lt;b&gt;نتایج : &lt;/b&gt;نتایج حاصل از آنالیز ML نشان داد که گونه مورد نظر  در کلاد   Eubrachyura قرار می‌گیرد که 94 درصد شبیه به Charybdis hellerii است و در یک گروه خواهری قرار گرفتند. آنالیزهای مولکولی نتایج حاصل از بررسی های موفولوژی را تأیید می کند.



</abstract_fa>
	<abstract>
&lt;b&gt;Aim and Background:&lt;/b&gt;Charybdis hellerii is a well-known species in the Indian Ocean. There are many molecular researches on this species all over the word. Molecular researches on Iranian water crabs are very scarce however there are several comprehensive morphological studies. In this paper, for the first time, phylogeny of Charybdis hellerii from Iranian waters are studied.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Materials and Methods:&lt;/b&gt;Specimens were collected in 2013 from sandy sediments of shallow-waters in Chabahar Bay at full tide. Collections were transported to the laboratory and preserved in -20 degrees. The gill tissue was used for DNA extraction. The Hexadecyltrimethylammonium bromide (CTAB) method was used to extract DNA.  Polymerase Chain Reaction (PCR) was then carried out. The sequencing alignments were conducted and phylogenic tree was obtained.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Results:&lt;/b&gt;The crab sample was identified as Charybdis hellerii by morphological analysis confirmed by molecular analysis. Nucleotides sequence of the cytochrome oxidase subunit 1 (CO1) gene was analyzed. The phylogenetic analysis was conducted and found that the Iranian species with other Charybdis hellerii are in a clade and support with 94% bootstrap.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Conclusion:&lt;/b&gt;The maximum Likelihood phylogenetic analysis showed that the Iranian species is in the Eubrachyura clad and with 94% bootstrap support is a sister group Charybdis hellerii. The molecular results were also confirmed by morphological features.

</abstract>
	<keyword_fa>Charybdis hellerii, قطعه‌ی 1 ژن سیتوکروم اکسیداز , فیلوژنی , چابهار , سخت‌پوستان</keyword_fa>
	<keyword>cytochrome oxidase subunit 1 (CO1), Charybdis hellerii, Phylogeny, Chabahar, Crustacean.</keyword>
	<start_page>67</start_page>
	<end_page>74</end_page>
	<web_url>http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-616-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Gilan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Attaran Fariman</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>گیلان</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عطاران فریمان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>gilan.attaran@gmail.com</email>
	<code>4251252705</code>
	<orcid>10031947532846003777</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Chabahr Maritime University Chabahar</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه دریانوردی و علوم دریایی چابهار</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Yaser</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Fatemi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>یاسر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فاطمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846003778</code>
	<orcid>10031947532846003778</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Chabahr Maritime University Chabahar</affiliation>
	<affiliation_fa>، دانشگاه دریانوردری و علوم  دریایی چابهار</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
