fa مقایسه و بهینه سازی روش های جداسازی مایکوباکتریوم های غیر سلی از آب های سطحی ژنتیک Genetics مقاله پژوهشی Research Article <b> سابقه و هدف:</b> محیط زیست منبع احتمالی مایکوباکتریوم های غیر سلی(NTM) است که در عفونت های انسانی به ویژه ریه، پوست و عفونت بافت نرم دخالت دارند. کشت مایکوباکتریوم ها در محیط های کشت غنی نیاز به انکوباسیون طولانی مدت دارد که رشد میکروارگانیسم های تند رشد و آلوده کننده در این محیط ها مانع از مشاهده کلنی های مایکوباکتریومی روی محیط کشت می شود. به منظور اندازه گیری میزان شیوع NTM در اکوسیستم های مختلف آبزی ما سعی به استانداردسازی و مقایسه بسیاری از روش های جداسازی مایکوباکتریوم های غیر سلی در اکوسیستم های آبی پرداختیم که قبلا شرح داده شده بودند. <div style="direction: rtl"> <b>مواد و روش ها:</b> تعداد 38 نمونه از آب های سطحی استان تهران جمع آوری شد. نمونه گیری آب در حجم ۲۰۰-۱۰۰ میلی لیتر صورت گرفت. ظروف حاوی آب بلافاصله به آزمایشگاه انتقال یافت و مورد بررسی قرار گرفت. سه روش آلودگی زدایی (Tacquet-Tison, Cetylpridinium chloride, Petroff) برای جداسازی مایکوباکتریوم ها به صورت موازی برای هر 38 نمونه از آب های سطحی انجام شد. برای هر روش یک ترکیب ویژه از روش ضد عفونی تعریف شد. اثر هر یک از روش ها با محاسبه میزان آلودگی محیط های کشت، متوسط تعداد کلنی مایکوباکتریوم های رشد کرده و تعداد گونه های مایکوباکتریومی مختلف جدا شده مشخص شد. درآخر برای تایید جدایه های مایکوباکتریومی از تست PCR نیز استفاده شد. <div style="direction: rtl"><b>یافته ها: </b>ضد عفونی با CPC به نظر می رسد بهترین روش آلودگی زدایی باشد. این روش از یک سو به طور معنی داری میزان میکروارگانیسم های غیر هدف را کاهش داد و از سوی دیگر کمترین اثر مهاری را بر روی گونه های NTM مورد مطالعه داشت.  </div><div style="direction: rtl"><b>نتیجه گیری:</b> هدف ما برای بررسی روش های مختلف شناخته شده برای مهار رشد میکروارگانیسم های غیر هدف بود، با در نظر گرفتن این مطلب که روش بکار گرفته شده کمترین اثر مهاری را بر رشد NTM داشته باشد. مطابق با این بررسی، روش آلودگی زدایی CPC بهترین روش جداسازی مایکوباکتریوم ها ی غیر سلی از نمونه های آب در این مطالعه بود. </div></div> <b> Aim and Background:</b> Environment is the likely source of most Non-Tuberculous mycobacteria (NTM) involved in human infections, especially pulmonary, skin, and soft tissue infections. In order to measure the prevalence of NTM in different aquatic ecosystems, we tried to standardize the isolation methods used for surface water testing since many procedures have been described previously. Cultivation of mycobacteria requires long-term incubation in rich media and inactivation of rapidly growing microorganisms whose growth impedes observation of mycobacterial colonies. <div><b>Materials and Methods: </b>38 samples were collected from surface waters in Tehran. Water sampling was carried out in a volume of 200-100 ml. water sample was transferred immediately to the laboratory and examined. Three methods (Cetylpyridinium chlori, Petroff, Tacquet-Tison) for the isolation of mycobacteria were compared by applying them in parallel to 38 samples of surface water. Each method was defined by a particular combination of decontamination method. The efficacy of each method was determined by calculating the positivity, negativity, and contamination rates, the mean numbers of mycobacterial colonies grown and number of different mycobacterial strains isolated. The last value was determined by subjecting the isolates to PCR.  </div><div><b>Results:</b> Decontamination with CPC appeared to be the best decontamination method, on the one hand, it significantly decreased the level of non-target microorganisms and, on the other hand, it was significantly less lethal for the NTM strains studied. </div><div><b>Conclusion:</b> Our goal was to measure the effects of various methods known to inhibit the growth of non-target microorganisms, while we also took into consideration the inhibitory effects of these methods on the growth of NTM. We propose that CPC procedure could be used for detection of NTM in aquatic samples. </div> مایکوباکتریوم غیرسلی(NTM), روش های آلودگی زدایی, اکوسیستم آبی Aquatic ecosystems, Decontamination methods, Nontuberculous mycobacteria (NTM) 115 121 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-4-4&slc_lang=fa&sid=1 Sarvenaz Falsafi سروناز فلسفی 10031947532846003412 10031947532846003412 No Department of biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران ، ایران Saeed Zaker Bostanabad سعید ذاکر بستان آباد saeedzaker20@yahoo.com 10031947532846003413 10031947532846003413 Yes Department of Microbiology and Biology, Parand branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد پرند، تهران ، ایران Mohammad Mehdi Feizabadi محمد مهدی فیض آبادی 10031947532846003414 10031947532846003414 No Department of Microbiology, School of Medicine, Tehran University of Medical Science, Tehran, Iran گروه میکروبیولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران ، ایران Ramezan Ali Khavari-Nejad رمضانعلی خاوری نژاد 10031947532846003415 10031947532846003415 No Department of biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran گروه زیست شناسی ، دانشکده علوم پایه ، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران ، ایران