New Cellularand Molecular Biotechnology Journal
مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي
NCMBJ
Basic Sciences
http://ncmbjpiau.ir
1
admin
2228-5458
2228-6926
-
-
-
8888
-
fa
jalali
1394
10
1
gregorian
2016
1
1
6
21
online
1
fulltext
fa
بررسی مولکولی جمعیت ماهی سوکلا Rachycentron Canadum در آب های شمالی خلیج فارس و دریای عمان با استفاده از ژن(NADH dehydrogenase subunit 2 (ND2
Molecular investigation of population of Rachycentron Canadum species in the northern part of the Persian Gulf and Oman Sea based on NADH dehydrogenase (ND2) gene
فارماکولوژی
Pharmacology
مقاله پژوهشی
Research Article
<p dir="RTL" style="margin-right: 2.45pt; text-align: justify;"><strong>سابقه و هدف</strong>: ماهی سوکلا <em><span dir="LTR">Rachycentron Canadum</span></em> از جمله ماهیان استخوانی خلیج فارس و دریای عمان است که از نظر اقتصادی حائز اهمیت می باشد. در مطالعۀ حاضر، بررسی جمعیت و تعیین میزان تنوع ژنتیکی این گونه به منظور حفظ تنوع زیستی و معرفی ژنوتیپ های احتمالی موجود در مناطق عمدۀ صید و پراکنش آن جهت اعمال مدیریت صحیح بر ذخایر این گونۀ مهم و اقتصادی انجام گردید.</p>
<p dir="RTL" style="margin-right: 36pt; text-align: justify;"></p>
<p dir="RTL" style="margin-right: 2.45pt; text-align: justify;"><strong>مواد و روش ها</strong>: در این مطالعه ماهیان چهار منطقه از لحاظ ژنتیکی مورد ارزیابی قرار گرفتند. به این منظور 120 عدد ماهی سوکلا از سواحل شمالی خلیج فارس و دریای عمان جمع آوری گردید. <span dir="LTR">DNA</span> با روش فنل- کلروفرم از بافت باله پشتی استخراج شد و واکنش <span dir="LTR">PCR</span> با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی (پرایمر) بر اساس توالی نوکلئوتیدی ژن<span dir="LTR">NADH dehydrogenase subunit 2 (ND2)</span> طراحی گردید و سپس محصول <span dir="LTR">PCR</span> متعلق به 54 عدد ماهی سوکلا برای مطالعه تنوع جمعیتی این گونه تعیین توالی شد.</p>
<p dir="RTL" style="margin-right: 36pt; text-align: justify;"></p>
<p dir="RTL" style="margin-right: 2.45pt; text-align: justify;"><strong>یافته ها:</strong> نتایج حاصل از این بررسی نشان داد که میزان تنوع هاپلوتیپی در درون جمعیت نمونه های بوشهر 00/ 0 ± 00/0 و در نمونه های سیستان و بلوچستان 03/ 0 ± 00/0 و میانگین دو منطقه 015/ 0 ± 00/0 بود. همچنین میزان تنوع هاپلوتیپی در درون جمعیت نمونه های خوزستان 04/ 0 ± 00/0 ، در نمونه های هرمزگان 04/ 0 ± 00/0 و میانگین دو منطقه 04/ 0 ± 00/0 بود. همین طور میزان تنوع هاپلوتیپی در درون جمعیت نمونه های خوزستان 04/0 ± 00/0 و در نمونه های بوشهر 00/ 0 ± 00/0<br>
و میانگین دو منطقه 02/ 0 ± 00/00 بود. همچنین میانگین مناطق سیستان و بلوچستان و هرمزگان 035/ 0 ± 00/0 و میانگین مناطق بوشهر و هرمزگان 02/ 0 ± 00/0 ارزیابی گردید. در این پژوهش، در منطقه هرمزگان 8 ، سیستان و بلوچستان 4 ، بوشهر 4<br>
و در خوزستان 5 هاپلوتیپ مشاهده شد که بیشترین تنوع هاپلوتیپی در درون جمعیت ها به ترتیب در آب های هرمزگان<br>
و خوزستان و کم ترین تنوع هاپلوتیپی در بوشهر و سیستان و بلوچستان مشاهده گردید.</p>
<p dir="RTL" style="margin-right: 2.45pt; text-align: justify;"><strong>بحث:</strong> در بین هاپلوتیپ های مشاهده شده، چند هاپلوتیپ از منطقه خوزستان در یک شاخه <span dir="LTR">Clade</span> جداگانه از دیگر مناطق (هرمزگان، سیستان وبلوچستان و بوشهر) قرار گرفت که می توان استنباط کرد این گونۀ غیر مهاجر دارای جریان ژنی کم تری در منطقه خوزستان نسبت به مناطق دیگر مورد مطالعه می باشد. این درجه از تمایز ژنتیکی را می توان به اثر عواملی مانند ساختار هیدروداینامیک منطقه (جریان های دریایی) بین تنگه هرمز و گواتر، وجود جریان گردابی در خلیج عمان و همچنین وجود جنگل های انبوه حرا به عنوان یکی از مهم ترین مناطق از لحاظ منطقه نوزاد گاهی برای لاروهای ماهی و میگو نسبت داد.</p>
<p style="text-align: justify;"><strong>Aim and Background</strong>: <em>Rachycentron Canadum</em> is one of the most important commercial species in the Persian Gulf. This study focuses on molecular investigation of mentioned species in order to find and introduce the genetic differentiations and also probable genotypes for monitoring and managing the genetic resources of populations in three major catch areas in the Persian Gulf and the Oman Sea.</p>
<p style="text-align: justify;"><strong>Materials and methods</strong>: 120 individuals of this species were caught from the northern part of the Persian Gulf and Oman Sea. DNA extraction was performed from the dorsal part of the fin of 54 Individuals using Phenol-Chloroform method. Polymerase chain Reaction (PCR) was performed using a set of primers which designed based on NADH dehydrogenase (ND2) gene.</p>
<p style="text-align: justify;"><strong>Results</strong><strong>:</strong> The haplotype diversity from the populations of Bushehr 0. ± 0, Sistan Baluchestan 0. ± 0.3 and mean diversity was recorded 0. ± 0.015. Also haplotype diversity from the populations of Khuzestan and Hormozgan were 0. ± 0.04 and 0. ± 0.04 respectively and the mean diversity was recorded 0. ± 0.04. haplotype diversity from the populations of Khuzestan and Bushehr were 0. ± 0.04 and 0. ± 0 respectively and the mean diversity was recorded 0. ± 0.02.</p>
<p style="text-align: justify;"><strong>Discussion:</strong> The study showed that some haplotypes of the populations belonging to Khuzestan were setting in one clade with common ancestor compared with the other population (Bushehr, Hormozgan and Sistan population) shown in another clade indicating that restricted genetic flow between Khuzestan and other studied areas. This study confirmed that several factors including barriers (mangrove forests) and marine currents can have an effect on the population diversity of this species in the Persian Gulf and Oman Sea.</p>
<p dir="rtl"></p>
ماهی سوکلا Rachycentron Canadum, ژن NADH dehydrogenase subunit 2 (ND2), خلیج فارس و دریای عمان, تعیین توالی
Rachycentron Canadum, Cobia, Persian Gulf and Oman Sea, Sequencing, NADH dehydrogenase subunit 2 (ND2) gene
49
57
http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-747-2&slc_lang=fa&sid=1
Maryam
Tala
مریم
طلا
M_Tala2002@Yahoo.com
10031947532846005262
10031947532846005262
Yes
Department of Fisheries, Qeshm Branch, , Islamic Azad University Qeshm, Iran.
گروه شیلات، واحد قشم، دانشگاه آزاد اسلامی، قشم ایران
Mansour
Azad
منصور
آزاد
10031947532846005263
10031947532846005263
No
Department of Fisheries, Qeshm Branch, , Islamic Azad University Qeshm, Iran.
گروه شیلات، واحد قشم، دانشگاه آزاد اسلامی، قشم ایران
Faramarz
Lalooei
فرامرز
لالویی
10031947532846005264
10031947532846005264
No
Persian Gulf and Oman Sea Ecological Research Institute
پژوهشکده اکولوژی دریای خزر- ساری
Saeed
Tamadoni jahromi
سعید
تمدنی جهرمی
10031947532846005265
10031947532846005265
No
Caspian Sea Ecological Research Institute
پژوهشکده اکولوژی خلیج فارس و دریای عمان- بندر عباس
Mohammad Javad
Taghavi
محمد جواد
تقوی
10031947532846005266
10031947532846005266
No
Persian Gulf and Oman Sea Ecological Research Institute
پژوهشکده اکولوژی دریای خزر- ساری