<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>New Cellularand Molecular Biotechnology Journal</title>
<title_fa>مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي</title_fa>
<short_title>NCMBJ</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://ncmbjpiau.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-5458</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2228-6926</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>-</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>7</volume>
<number>26</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی و  بررسی گوناگونی ژنتیکی باکتری‌های اسید لاکتیک باکتری‌های اسید لاکتیک غیر آغازگر در پنیر رسیده تالشی

</title_fa>
	<title>Identification and Genotypic Characterization of Non-Starter
Lactic Acid Bacteria in Mature Taleshi Cheese

</title>
	<subject_fa>ژنتیک</subject_fa>
	<subject>Genetics</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align:justify;line-height:normal;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;سابقه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &amp;nbsp;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;امروزه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;روش های مولکولی بر پایه &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; در مطالعه گوناگونی میکروبی غذاهای تخمیری به طور گسترده ای کاربرد یافته اند. هدف این مطالعه شناسایی و بررسی گوناگونی ژنتیکی باکتری &amp;shy;های اسیدلاکتیک جدا شده از پنیر سنتی تالشی است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;line-height:normal;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;مواد و روش&amp;shy;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;54 سویه وحشی باکتری اسید لاکتیک در محیط &amp;shy;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;M17&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; و&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;MRS&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; ایزوله شده و پس از استخراج &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; با روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;RAPD-PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; و نرم افزار &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;MVSP&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; خوشه بندی شدند. گونه &amp;shy;ها توسط &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;آزمون&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;S rRNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;16 شناسایی شدند.&amp;nbsp; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;line-height:normal;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;یافته ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;شش بیوتایپ اصلی و غالب در این پنیر سنتی شامل&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; جنس ها و گونه های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;لاکتوباسیلوس&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; پاراپلانتاروم، پلانتاروم، ساکئی، پاراکازئی و لاکتوکوکسی ها، گونه های استرپتوکوکوس گالولیتیکوس، انتروکوکوس فکالیس و فیسیوم بودند. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;line-height:normal;&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;بحث: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;پرایمر های به کار گرفته شده &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;M13&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;D836&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt; در روش&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;RAPD-PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; قادر به ایجاد پروفایل ها باندی مجزایی بوده که امکان تفکیک و خوشه بندی جدایه ها را فراهم ساخت. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;وجود 26 ژنوتایپ در میان 54 جدایه نشان دهنده گوناگونی ژنتیکی بالایی بود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;line-height:normal;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16.0pt;&quot;&gt;نتیجه گیری: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;روش های مولکولی قادر به تفکیک و شناسایی سریع و قابل اطمینان باکتری&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:arial,sans-serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&amp;shy;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; های اسید لاکتیک بوده و گوناگونی ژنتیکی بالایی آنها را نیز نشان دادند. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;غالب ترین باکتری غیر آغازگر را نیز لاکتوباسیلوس &amp;shy;های هترو فرمانتاتیو تشکیل می دادند. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>Background: 
The development of molecular methods such as RAPD-PCR and 16SrRNA sequencing has facilitated the identification and evaluation of microbial diversity of complex microbial environment like fermented food. The aim of this study is identifying and genotyping of different lactic acid bacteria genius and species involved in maturation of traditional Taleshi Cheese.  
Methods:
About 54 wild isolates on MRS and M17 mediums were selected and analyzed by culture dependent RAPD-PCR technique. Gel patterns derived by randomly designed M13 and D8635 primers clustered based on Pearson product moment correlation coefficient and UPGMA via MVSP software. 16SrRNA sequencing has been used for species identification. 
Results 
The results revealed dominate non-starter lactic acid bacteria among isolates belonged to Lactobacillus genus including paraplantarum, curvatus, Sakei, paracase species following by Streptococcus gallolyticus and Enterococcus faecalis/Enterococcus faecium. 
Conclusion:
The results showed that RAPD-PCR and 16SrRNA sequencing were useful and rapid tools for grouping, strain discrimination and identification of lactic acid bacteria. Also, obtained 26 different genotypes represented a wide genetic diversity in this type of traditional cheese. 
</abstract>
	<keyword_fa>RAPD-PCR, باکتری اسید ‌‌‌لاکتیک غیر آغاز کننده, S rRNA16, پنیر تالشی, گوناگونی ژنتیکی</keyword_fa>
	<keyword>Lactic acid bacteria, RAPD-PCR, Taleshi cheese, traditional cheese, Genetic diversity </keyword>
	<start_page>111</start_page>
	<end_page>118</end_page>
	<web_url>http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-994-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Tiva </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kafili</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>تیوا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کفیلی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>tivkafil@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846007249</code>
	<orcid>10031947532846007249</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of food science and engineering, Islamic Azad University, Buinzahra Branch, Buinzahra, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم و صنایع غذایی،‌ دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بویین زهرا</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohsen </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alinesaii</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>علی‌نسایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846007250</code>
	<orcid>10031947532846007250</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of food science and engineering, Islamic Azad University, Buinzahra Branch, Buinzahra, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم و صنایع غذایی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بویین زهرا</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
