دوره ۸، شماره ۳۰ - ( ۱-۱۳۹۷ )
جلد ۸ شماره ۳۰ صفحات ۱۱۰-۹۵ |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Beiki A H. Molecular Sequence Analysis of the ITS rRNA Region for Identification of Fusarium species. NCMBJ 2018; 8 (30) :95-110
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1097-fa.html
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1097-fa.html
بیکی امیر حسین. تجزیه و تحلیل توالی مولکولی ژن ITS جهت شناسایی گونه‌های جداسازی شده جنس فوزاریم از مناطق مختلف ایران. مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي. ۱۳۹۷; ۸ (۳۰) :۹۵-۱۱۰
تجزیه و تحلیل توالی مولکولی ژن ITS جهت شناسایی گونه‌های جداسازی شده جنس فوزاریم از مناطق مختلف ایران
دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم ، amirbeiki@gmail.com
چکیده: (۵۹۷۸ مشاهده)
سابقه و هدف: شناسایی و تمایز جنس فوزاریم در سطح گونه، برای مقاصد اپیدیمیولوژی و پاتولوژیکی ضروری است. هدف از این مطالعه بررسی روابط فیلوژنتیکی و یافتن الگو‌های تکراری کلاستر شده مشخص در ناحیه ITS بهمنظور شناسایی گونه‌های متفاوت جنس فوزاریم است.
مواد و روش‌ها: 16 جدایه از گونه‌های متفاوت جنس فوزاریم و از نواحی مختلف ایران جمع آوری شدند. ناحیه فاصلهانداز داخلی DNA ریبوزومی توسط واکنش زنجیره‌ای پلیمراز تکثیر، توالییابی و با ابزار‌های مختلف مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند.
یافته ها: محصول واکنش زنجیره‌ای پلیمراز، قطعههای بهطول بهطورتقریبی 550 جفت باز در تمام جدایه‌ها بود. مقایسه توالی‌ها و فیلوگرام حاصل از تجزیه و تحلیل ناحیه ITS، گونه‌های جنس فوزاریم را در ده گروه مختلف قرار داد.
بحث: ناحیه فاصلهانداز داخلی بیثبات و تغییرپذیر هستند. سطح بالای تنوع بین ناحیه فاصلهانداز داخلی ناشی از حذف یا اضافه شدن واحدهای تکراری در ناحیه فوق است.
نتیجه گیری: بعضی از جدایه‌ها بهطور قطعی شناسایی می‌شوند. بعضی از آن‌ها دارای الگوی متفاوتی هستند. وجود موتیفهای خوشه‌شده بی‌همتا در ناحیه ITS یک گونه خاص نشان می‌دهد که این موتیف‌ها میتوانند بهعنوان یک ابزار شناسایی گونه مورد نظر به‌کار روند.
مواد و روش‌ها: 16 جدایه از گونه‌های متفاوت جنس فوزاریم و از نواحی مختلف ایران جمع آوری شدند. ناحیه فاصلهانداز داخلی DNA ریبوزومی توسط واکنش زنجیره‌ای پلیمراز تکثیر، توالییابی و با ابزار‌های مختلف مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند.
یافته ها: محصول واکنش زنجیره‌ای پلیمراز، قطعههای بهطول بهطورتقریبی 550 جفت باز در تمام جدایه‌ها بود. مقایسه توالی‌ها و فیلوگرام حاصل از تجزیه و تحلیل ناحیه ITS، گونه‌های جنس فوزاریم را در ده گروه مختلف قرار داد.
بحث: ناحیه فاصلهانداز داخلی بیثبات و تغییرپذیر هستند. سطح بالای تنوع بین ناحیه فاصلهانداز داخلی ناشی از حذف یا اضافه شدن واحدهای تکراری در ناحیه فوق است.
نتیجه گیری: بعضی از جدایه‌ها بهطور قطعی شناسایی می‌شوند. بعضی از آن‌ها دارای الگوی متفاوتی هستند. وجود موتیفهای خوشه‌شده بی‌همتا در ناحیه ITS یک گونه خاص نشان می‌دهد که این موتیف‌ها میتوانند بهعنوان یک ابزار شناسایی گونه مورد نظر به‌کار روند.
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
سلولی و مولکولی
دریافت: 1397/4/27 | پذیرش: 1397/4/27 | انتشار: 1397/4/27
دریافت: 1397/4/27 | پذیرش: 1397/4/27 | انتشار: 1397/4/27
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
