ردیابی ژنهای حدت اینتیمین، همولیزین و شیگاتوکسین در
اشریشیاکلی جدا شده از طوطیسانان
امیرحسین ضیاء الدینی1، مجید غلامی آهنگران2*، آسیه احمدی دستگردی3
1. دانشکده دامپزشکی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران.
2. گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران.
3. گروه علوم و صنایع غذایی، واحد اردستان، دانشگاه آزاد اسلامی، اردستان، ایران.
سابقه و هدف: اشریشیاکلی یک عامل عفونی مشترک بین انسان و حیوانات است که دارای ژنهای حدت زیادی است. یکی از ژنهای حدت واجد اهمیت اینتیمین است که عامل اتصال باکتری به سلولهای مخاطی است. از طرفی ژنهای حدت همولیزین و شیگاتوکسین نیز با تولید سم باکتریایی عامل ایجاد عوارض گوارشی هستند. لذا سویههای اشریشیاکلی که واجد ژنهای حدت مذکور باشند میتوانند در انسان ایجاد بیماری کنند. در این راستا، در مطالعه اخیر به ردیابی ژنهای حدت مذکور در سویههای اشریشیاکلی جدا شده از طوطیسانان پرداخته شد.
مواد و روشها: بهمنظور شناسایی ژنهای حدت در اشریشیاکلی با منشاء طوطیسانان، 100 نمونه سوآب از ناحیه کلواک انواع طوطیسانان از کلنیهای نگهداری طوطی در استان اصفهان و چهارمحال و بختیاری جمعآوری شد. پس از کشت و خالصسازی، با تستهای بیوشیمیایی به تأیید موارد آلودگی اشریشیاکلی پرداخته شد. سپس با استخراج DNA بهروش جوشاندن به ردیابی ژنهای همولیزین، اینتیمین و زیرردههای 1 و 2 شیگاتوکسین ( stx1و stx2 ) پرداخته شد.
یافتهها: نتایج نشان داد 57/18 درصد از جدایههای اشریشیاکلی جدا شده واجد ژن اینتیمین ، 28/4 درصد واجد ژن stx2 و 85/2% واجد همولیزین بودند. تنها یک جدایه واجد ژنهای اینتیمین و همولیزین وstx2 به طور همزمان بود (%42/1). در هیچیک از جدایهها ژن stx1 ردیابی نشد.
نتیجهگیری: با توجه به افزایش تقاضا برای نگهداری انواع طوطیسانان بهعنوان حیوان دستآموز برای کودکان و نوجوانان لازم است مراقبتهای بیشتری در جهت کاهش خطر انتقال بیماریهای مشترک از این پرندگان به انسان صورت بگیرد.
واژههای کلیدی: شیگاتوکسین، اینتیمین، همولیزین، اشریشیاکلی، طوطیسانان.
مقدمه
Silva همکاران در سال 2009 بهبررسی سویههای اشریشیاکلی در مدفوع تازه کبوتران پرداختند. نتایج نشان داد 12% نمونههای دریافتی قادر به تولید شیگاتوکسین بودند (6). در مطالعه دیگریSchmidt و همکاران واریانت دیگری از شیگاتوکسین2 تحت نام stx2f را در مدفوع کبوتر شناسایی کردند. شیوع این واریانت در سویههای اشریشیاکلی مدفوع کبوتر 5/12% گزارش شد (7). Kobayashi و همکاران در سال 2009 بهبررسی خصوصیتهای سویههای واجد ژنهای اینتیمین و شیگاتوکسین در پرندههای وحشی ژاپن پرداختند و نشان دادند شیوع سویههای واجد ژن اینتیمین و شیگاتوکسین بهترتیب 25% و 5% است. در این بررسی بیان شده است که پرندگان میتوانند بهعنوان مخزن و ناقل اشریشیاکلی انتروپاتوژن مطرح باشند (4). Nielsen و همکاران بهبررسی اشریشیاکلی تولیدکننده شیگاتوکسین در حیوانات وحشی که در تماس نزدیک با گلههای خوک و گاو بودند، پرداختند. این بررسی نشان داد موش و پرندگان بهعنوان ناقل اشریشیاکلی تولیدکننده شیگاتوکسین مطرح هستند (8). در یک بررسی از 97 سویه اشریشیاکلی پاتوژن طیور، 52 جدایه از ضایعات سلولیت، سپتی سمی و سندرم تورم سر و 5 جدایه مدفوعی از ماکیان سالم، واجد توالی ژن شیگاتوکسین بودند. اکثریت این جدایهها واجد ژن stx1 و فقط 3 نمونه واجد stx2 بودند. بهنظر میرسد طیور بهویژه کبوتر در برخی مناطق خاص جغرافیائی بهعنوان منبع طبیعی اشریشیاکلی تولیدکننده شیگاتوکسین عمل میکند، بهطوریکه کبوترها در کلرادو، ماکیان و کبوتر در هند و ماکیان و کبوتر در فنلاند منبع اشریشیاکلی تولیدکننده شیگاتوکسین نبودند (2). در یک بررسی دیگر Foster و همکاران مدفوع پرندکان وحشی را در جنوب شرق اسکاتلند از لحاظ وجود اشریشیاکلی O157H7 مورد بررسی قرار دادند و تنها یک مورد را از لحاظ وجود اشریشیاکلی O157H7 مثبت گزارش کردند (5).
براساس اطلاعات موجود تا بهحال بهبررسی خصوصیتهای انتروتوکسوژنیک اشریشیاکلی جدا شده از مدفوع طوطیسانان پرداخته نشده است. در همین راستا هدف از مطالعه اخیر شناسایی این باکتری در مدفوع طوطیسانان از طریق شناسایی سیتوتوکسینهای عامل بیماریزای رودهای (شیگاتوکسین 1 و 2) در کنار عامل اتصال باکتری به انتروسیت (اینتیمین) و شناسایی ژن عامل چسبیدن باکتری به سلولهای گوارشی و ژن تولیدکننده سیتوتوکسین است.
مواد و روشها
نمونهگیری
این مطالعه در بهار 1397 بهمدت 3 ماه انجام شد. 100 نمونه سوآب از ناحیه کلواک انواع طوطیسانان (کاسکو، مرغ عشق، لاوبرد، ماکائو، پاروت، عروس هلندی، کوکاتو و کونور) از کلنیهای نگهداری طوطی در اصفهان و چهارمحال و بختیاری جمعآوری شد و در لوله آزمایش استریل دربدار به آزمایشگاه منتقل گردید.
شناسایی اشریشیاکلی
بهمنظور شناسایی باکتری اشریشیاکلی، نمونههای جمعآوری شده، بر روی محیط مککانگی کشت داده شد و برای 24 ساعت در 37 درجه سانتیگراد انکوبه شد. در صورت رویت شدن پرگنههای لاکتوز مثبت (صورتی رنگ)، از پرگنههای مذکور بر روی محیط EMB بهصورت خطی کشت داده شد و بهمدت 24 ساعت در دمای 37 درجه سانتیگراد انکوبه شد. پرگنههای لاکتوز مثبت که بر روی محیط EMB ایجاد جلای سبز فلزی نمودند بهصورت اولیه بهعنوان باکتری اشریشیاکلی شناسایی گردیدند. سپس بر روی این پرگنهها تستهای افتراقی IMVIC انجام شد. در صورتی که از لحاظ تستهای بیوشیمیایی تولید ایندول، احیای متیل رد، واکنش Voges-proskawer و احیای سیترات بهترتیب بهصورت مثبت، مثبت، منفی، منفی بودند بهعنوان اشریشیاکلی شناسایی شدند.
استخراج DNA
برای استخراج DNA از روش جوشاندن استفاده شد (9). از کشت 24 ساعته باکتری در محیط BHI بهعنوان منبع DNA استفاد شد.
برای انجام PCR از دستگاه Master cycler gradiant (Eppendorf, Germany) استفاده شد. PCR در حجم 50 میکرولیتر شامل یک، میکرولیتر DNA تخلیص شده (حدود 50 نانو گرم)، 10 میلیمول تریس هیدروکلریدریک (اسیدیته 4/8)، 10 میلیمول کلرید پتاسیم، 3 میلیمول کلرید منیزیم، 2 میلیمول از هر کدام از پرایمرها، 2/0 میلیمول از هرکدام dntpها و یک واحد Taq-polymerase و مابقی تا 50 میکرولیتر آب دوبار تقطیر استریل (8/33 میکرولیتر) انجام شد. مشخصات پرایمرهای مورد استفاده در جدول 1 آمده است.
برای تعیین فاکتورهای حدت در جدایههای اشریشیاکلی جدا شده از زوج پرایمرهای معرفی شده توسط Fagan و همکاران (1999) استفاده شد (10،11). برنامه حرارتی برای انجام PCR شامل یک سیکل 95 درجه سانتیگراد بهمدت 3 دقیقه و 35 سیکل تکراری شامل واسرشتسازی در دمای 95 درجه سانتیگراد در 20 ثانیه، همسرشتسازی در دمای 58 درجه سانتیگراد بهمدت 40 ثانیه، گسترش در دمای 72 درجه سانتیگراد برای 90 ثانیه و گسترش نهایی در دمای 72 درجه سانتیگراد بهمدت 5 دقیقه بود. در پایان محصول PCR بر روی ژل آگارز 2 درصد بهمدت 40 دقیقه با ولتاژ 100 ولت و 400 میلیآمپر الکتروفورز گردید.
جدول 1- اختصاصات پرایمرهای مورد استفاده
نام پرایمر |
توالی پرایمر |
اندازه قطعه (جفت بازی) |
EHEC hly |
F:ACGATGTGGTTTATTCTGGA R:CTTCACGTGACCATACATAT |
165 |
stx1 |
F: ACACTGGATGATCTCAGTGG R: CTGAATCCCCCTCCATTATG |
614 |
stx2 |
F: CCATGACAACGGACAGCAGTT R: CCTGTCAACTGAGCAGCACTTTG |
779 |
eaeA |
F: GTGGCGAATACTGGCGAGACT R: CCCCATTCTTTTTCACCGTCG |
890 |
یافتهها
از صد نمونه سواب کلواک کشت داده شده بر روی محیط مک کانکی 70 نمونه از لحاظ کشت اختصاصی و تستهای بیوشیمیایی بهعنوان اشریشیاکلی شناسایی شدند. میزان آلودگی در هر یک از پرندگان به تفکیک در جدول 1 آمده است. در خانواده طوطیسانان از 22 نمونه اشریشیاکلی جدا شده از مرغ عشق سه مورد از لحاظ ژن eae و یک نمونه از لحاظ هر سه ژن اینتیمین، همولیزین و شیگاتوکسین 2 مثبت بود. از هشت نمونه اشریشیاکلی جدا شده از 14 عروس هلندی یک مورد از لحاظ ژن اینتیمین مثبت شد (5/12 درصد) و از 13 سویه اشریشیاکلی جدا شده از 19 طوطی خاکستری آفریقایی (کاسکو) دو مورد واجد ژن اینتیمین و یک مورد واجد stx2 بود. در طوطی برزیلی فقط در دو سویه از 9 جدایه اشریشیاکلی جدا شده ژن اینتیمین ردیابی شد. در طوطیهای سبز از 14 جدایه اشریشیاکلی جدا شده سه مورد دارای ژن اینتیمین و یک مورد واجد هر دو ژن stx2 و همولیزین بود. در سه جدایه اشریشیاکلی جدا شده از کونور و کوکاتو هیچکدام از ژنهای حدت ردیابی نشد.
گونه طوطی |
تعداد قفس پرنده |
تعداد جدایه اشریشیاکلی |
اینتیمین |
همولیزین |
شیگاتوکسین 1 |
شیگاتوکسین 2 |
مرغ عشق |
30 |
22 |
4 |
1 |
0 |
1 |
ماکائو |
1 |
1 |
1 |
0 |
0 |
0 |
عروس هلندی |
14 |
8 |
1 |
0 |
0 |
0 |
کاسکو |
19 |
13 |
2 |
0 |
0 |
1 |
طوطی کوتوله برزیلی |
13 |
9 |
2 |
0 |
0 |
0 |
کوکاتو |
2 |
1 |
0 |
0 |
0 |
0 |
کونور |
3 |
2 |
0 |
0 |
0 |
0 |
طوطی سبز |
18 |
14 |
4 |
1 |
0 |
1 |
کل |
100 |
70 |
13 |
2 |
0 |
3 |
درصد |
100 |
70 |
57/18 |
85/2 |
0 |
28/4 |
.