New Cellularand Molecular Biotechnology Journal

fa تحلیل انطباق پذیری تنوع ژرم پلاسم فندق شمالغرب ایران بر اساس صفات کیفی و نشانگر ژنتیکی ناحیه کدون آغاز ATG (SCoT) Distinctive analysis of qualitative traits of hazelnut germplasm in Northwestern Iran using ATG start codon region genetic marker(SCoT) ژنتیک Genetics مقاله پژوهشی Research Article <div dir="RTL"> <div class="WordSection1" dir="RTL">سابقه و هدف: ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسمی طبیعی و حفاظت شده از راهبردیترین فعالیتهای جهانی و بهعنوان سرمایه ملی هر کشور است. بهطوریکه در طول سالیان متمادی جهشها و تلاقیهای مختلف باعث تجمع برخی ژنهای مفید در این ژرم پلاسمها شده و میتواند بهعنوان ذخایر ژنتیکی در مواقع بحرانی مورد استفاده قرار گیرد. ارزیابی تنوع بر اساس صفات مورفولوژیکی و فنوتیپی بهدلیل تأثیر محیط و اثر متقابل ژنوتیپ در محیط پایداری مناسبی ندارد. بنابراین استفاه از نشانگرهای مبتنیبر DNA که تکرارپذیری بالایی دارد. نشانگر مبتنیبر امپلیکون DNA ناحیه شروع کدون برای ترجمه SCoT در گیاهان بهدلیل وراثتپذیری و تکرارپذیری، بهتازگی مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از این پژوهش ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسمهای ذخیرهگاه ژنتیکی فندق در رگههای جنگلی شمالغرب کشور با استفاده نشانگر مولکولی  SCoTو به روش PCR انطباقپذیری آن با تنوع صفات کیفی بر اساس نشانگرهای ملی آزمونهای تمایز فندق است. مواد و روشها: در این تحقیق 77 ژنوتیپ از جنگلهای فندق اردبیل، میانه و ارسباران انتخاب و محل هر ژنوتیپ با استفاده از GPS نشانهگذاری شد. با استفاده از دستورالعمل ملی آزمونهای تمایز یکنواخت و پایداری فندق، صفات کیفی ارزشگذاری شد و پس از استخراج DNA از برگ آنها با استفاده از 15 پرایمر اختصاصی SCoT تنوع پلیمورفیسم آنها ارزیابی شد.</div> <div aria-label="شکستن صفحه" class="cke_pagebreak" data-cke-display-name="pagebreak" data-cke-pagebreak="1" style="page-break-after:always" title="شکستن صفحه" contenteditable="false"></div>یافته ها: نتایج نشان دادند که ژنوتیپها از نظر صفات کیفی تمایز به 17 کلاستر طبقهبندی شدند. با استفاده از 15 نشانگر SCoT تعداد نوارهای چند شکل 165 نوار با میانگین 11 نوار برای هر نشانگر و میانگین درصد پلیمورفیسم با میانگین 11 نوار برای هر نشانگر و میانگین درصد پلیمورفیسم برای نشانگر % 2/90 ژنوتیپها بر اساس این نشانگرها در 19 زیر کلاستر گروهبندی شدند. بحث: آنالیز صفات کیفی بر اساس نوارهای ایجاد شده در SCoT نشان دادند که نشانگرهای 3، 5، 11، 12، 18 و 20 دارای تنوع ژنتیکی بیشتر و معنیدار بودند که میزان انطباق گروهبندی ژنوتیپها بر اساس SCoT نشانگرها 87/0 بر اساس آزمون مانتل برآورد گردید. نتیجه گیری: با استفاده از دو نشانگر ژنتیکی میتوان (%75=R2) از تنوع دیسکریپتورهای تمایز فندق دسترسی پیدا نمود. </div> Aim and Background: Assessing the genetic diversity of natural and protected germplasm is one of the most strategic global activities and as the national capital of each country. Over the years, various mutations and crosses have caused the accumulation of some useful genes in this germplasm and can be used as genetic resources in critical situations. Evaluation of diversity based on morphological and phenotypic traits is not stable due to the influence of the environment and the interaction of genotype in the environment. Therefore, the use of DNA-based markers that have high reproducibility. Codon-based DNA amplifier-based markers have recently been used to translate SCoT in plants due to heritability and reproducibility. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity of hazelnut genetic germplasms in the forests of the northwest of the Iran by SCoT markers and it’s accordance to diversity estimates based on national markers of hazelnut differentiation tests. Materials and Methods: In this study, 77 genotypes from hazelnut forests of Ardabil, Miyaneh and Arasbaran were selected by locating each genotype using GPS. Qualitative traits were evaluated using the national guidelines for uniform differentiation and hazelnut stability tests. after DNA extraction from leaf tissue, their polymorphism diversity was assessed using 15 SCoT-specific primers. Results: The results showed that the genotypes were classified according to the qualitative traits of differentiation of 17 clusters. Using 15 SCoT markers, 165 polymorphic bands were produced with an average of 11 bands per marker and the average percentage of polymorphisms with an average of 11 bands per marker and the average percentage of polymorphisms for markers 90.2% of genotypes based on these markers in 19 sub-clusters Were grouped. Discussion: Analysis of qualitative traits based on bands created in SCoT showed that markers 3, 5, 11, 12, 18 and 20 had more genetic diversity and that the degree of  accordance of genotype grouping based on the SCoT markers was 0.87 on The basis of the Mantel test. Conclusion: Using two genetic markers, 75% (R2) of the variety of hazelnut differentiation descriptors can be accessed.   نشانگرSCoT , تنوع ژنتیکی, فندق, شمال‌غرب ایران,.Iau Science SCoT marker, genetic diversity, hazelnut, northwest of Iran, Iau Science. 76 86 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1766-1&slc_lang=fa&sid=1 Mehran Ochi-Ardabili مهران اوچی اردبیلی mehranochi@yahoo.com 100319475328460013425 100319475328460013425 No Departement of Horticulture ,Faculty of Agriculture, Miyaneh Branch, Islamic Azad University, Miyaneh ,Iran گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، واحد میانه، دانشگاه ازاد اسلامی، میانه، ایران Hassan Nourafcan حسن نورافکن hassannourafcan@gmail.com 100319475328460013426 100319475328460013426 Yes Department of Horticulture, Medicinal Plants and Organic Products Research Center, Miyaneh Branch, Islamic Azad University, Miyaneh, Iran گروه علوم باغبانی، مرکز تحقیقات گیاهان دارویی و فرآورده های ارگانیک، واحد میانه، دانشگاه آزاد اسلامی، میانه، ایران Hassanali Naghdi Badi حسنعلی نقدی بادی naghdibadi@yahoo.com 100319475328460013427 100319475328460013427 No Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Shahed University, Tehran, Iran مرکز تحقیقات گیاهان دارویی جهاد دانشگاهی Nasser Mohebalipour ناصر محبعلی پور n.mohebalipour@gmail.com 100319475328460013428 100319475328460013428 No Deparment of Argonomy and Plant Breeding, Miyaneh Branch, Islamic Azad University, Miyaneh, Iran گروه زراعت و اصلاح نباتات، واحد میانه، دانشگاه آزاد اسلامی، میانه، ایران Ardeshir Qaderi اردشیر قادری ardeshir582008@gmail.com 100319475328460013429 100319475328460013429 No Medicinal Plant Research Center, Institute of Medicinal Plants, ACECR, Karaj, Iran مرکز تحقیقات گیاهان دارویی جهاد دانشگاهی