New Cellularand Molecular Biotechnology Journal

fa مطالعه تنوع اکتینوباکترهای قابل کشت در غار سهولان مهاباد و ارزیابی فعالیت ضدمیکروبی جدایه‌ها Study of cultivable actinobacterial diversity in Sahoulan Cave and evaluation of their antimicrobial activity فیزیولوژی Physiology مقاله پژوهشی Research Article سابقه و هدف: غارها محیطهای الیگوتروف و تاریکی هستند که کمتر مطالعه شده و میتوانند محیط‌های مناسبی از نظر منبع سویه‌های امیدوارکننده در زیست‌فناوری باشند. غار سهولان یک غار با ساختار دولومیتی در 42 کیلومتری جنوب شرقی شهر مهاباد است. <a name="_Hlk102941283">هدف این پژوهش بررسی تنوع اکتینوباکترهای قابل کشت در این غار و ارزیابی فعالیت ضدمیکروبی آنها بوده است.</a> مواد و روش ها: در این پروژه، نمونه‌های مختلف از خاک، آب، کف، دیوار و سقف غار و همچنین بی مهرگان غار سهولان بهمنظور جداسازی اکتینوباکترها جمع آوری شد. برای تسهیل جداسازی، نمونه‌های جمعآوری شده تحت سه پیش‌تیمار (سانتریفیوژ کردن، خشک کردن و گذاشتن در مایکروویو) و یک تیمار آنتی‌بیوتیکی قرار گرفت و نمونهها در ده محیط جداسازی متفاوت کشت شد. همچنین جدایه‌ها از نظر تولید مواد ضدمیکروبی علیه ده باکتری و قارچ غربال شدند. یافته ها: از 13 نمونه بهدست آمده از غار سهولان 8 ا کتینوباکتر شامل جنس‌های Streptomyces، Micromonospora وLysinibacter  جدا شدند. سویه ویژه Lysinibacter sp. UTMC 3606 ، 3/99 % شباهت به Lysinibacter cavernae، داشته است که در سال 2015 بهعنوان گونه جدید از یک غار در چین جدا شده است. از 8 جدایه بهدست آمده از 8  جدایه اکتینوباکتریایی حاصل از غار سهولان هامپوئیل 5 جدایه دارای فعالیت ضدمیکروبی بودند که از این میان 3 جدایه متعلقبه جنس Streptomyces و 2 جدایه متعلقبه جنس Micromonospora بوده است. 3 جدایه علیه Staphylococcus aureus  و Micrococcus luteus  فعالیت داشتند. یک جدایه علیه Escherichia coli TolC  فعالیت داشت.  فعالیت ضدمیکروبی علیه سویه Bacillus subtilis UTMC1464  در 1 جدایه دیده شد. 3 جدایه نیز فعالیت علیه Candida albicans UTMC5055  نشان دادند. جدایه Micromonospora sp. UTMC3322 بیشترین فعالیت ضدمیکروبی را علیه S. aureus ،M. luteus  و C. albicans  فعالیت نشان داد. نتیجه گیری: مقایسه نتایج بهدست آمده با نتایج مطالعههای دیگر انجام شده در مورد غارهای ایران نشان میدهد که غارها محیط‌های ارزشمندی برای مطالعههای تنوع زیستی و جداسازی اکتینوباکترها هستند، ولی غارهای بکر بیشتر ترجیح داده می‌شود. تنوع اکتینوباکتریایی در غار سهولان نسبت غار هامپوئیل کمتر بوده، ولی فعالیت زیستی جدایهها بیشتر بوده است. مطالعه بر غارهای توریستی مانند غار سهولان میتواند موضوع مناسبی برای بررسی تأثیر انسان و توریسم بر تنوع زیستی غارها باشد.   Aim and Background: Caves are less studied oligotrophic and dark environments and can be suitable sources for finding promising strains having biotechnological potentials. Sahoulan Cave has a dolomitic structure and is located 42 km southeast of Mahabad city. The aim of the current research was to study the actinobacterial diversity of this cave and evaluate their antimicrobial activity. Materials and Methods: In this project, different samples of soil, water, floor, wall, roof as well as invertebrates of the Sahoulan cave were collected to isolate actinobacteria. To facilitate the isolation, three pretreatments (centrifugation, drying and, microwave) and an antibiotic treatment were performed on the isolates. Then, they were cultured in 10 different isolation media. The isolates were also screened for antimicrobial activity against 10 bacteria and fungi. Results: From 13 samples obtained from the Sahoulan Cave, 8 actinobacteria were isolated from the genera Streptomyces, Micromonospora, and Lysinibacter. Lysinibacter sp. UTMC 3606 had 99.3% similarity to Lysinibacter cavernae, which was isolated from a cave in China in 2015 as a new species. Of the 8 isolates, 5 isolates had antimicrobial activity, including three Streptomyces and two Micromonospora. Three isolates were active against Staphylococcus aureus and Micrococcus luteus. One isolate was active against Escherichia coli TolC. Antimicrobial activity against Bacillus subtilis UTMC1464 was observed in one strain. Three isolates also showed activity against Candida albicans UTMC5055. The isolated Micromonospora sp. UTMC3322 showed the highest antimicrobial activity against S. aureus, M. luteus, and C. albicans. Conclusion: Comparison of the obtained results with that of other studies on caves in Iran shows that caves are valuable environments for biodiversity studies and isolation of actinobacteria, however, pristine caves are more preferred. Actinobacterial diversity in the Sahoulan cave was less than Hampoil cave, but the biological activity of the isolates was higher. Study of tourist caves such as the Sahoulan Cave can be a good subject to study the impact of humans and tourism on the biodiversity of caves.   اکتینوباکترها, تنوع زیستی, غار سهولان, فعالیت ضدمیکروبی, اکتینوباکترهای قابل کشت, مهاباد, Iau Science. Actinobacteria, Biodiversity, Sahoulan Cave, Antimicrobial activity, cultivable actinobacteria, Mahabad, Iau Science. 67 80 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-712-4&slc_lang=fa&sid=1 Maghsoud Kafshnouchi مقصود کفشنوچی 100319475328460013664 100319475328460013664 Yes Department of Microbiology, Maragheh Branch, Islamic Azad University, Maragheh, Iran گروه میکروبیولوژی، واحد مراغه، دانشگاه آزاد اسلامی، مراغه، ایران. Javad Hamedi جواد حامدی jhamedi@ut.ac.ir. 100319475328460013665 100319475328460013665 No Department of Microbial Biotechnology, School of Biology and Center of Excellence in Phylogeny of Living Organisms, College of Science, University of Tehran, Tehran, Iran. بخش زیست‌فناوری میکروبی، ‌‌دانشکده زیست‌شناسی و قطب تبارزایی موجودات زنده، دانشکدگان علوم، ‌‌دانشگاه تهران، تهران، ایران.