fa تنوع گونه های نوکاردیاهای بیماری زا جدا شده از بیماران میکروبیولوژی Microbiology مقاله پژوهشی Research Article <p dir="RTL" style="text-align: justify;"><strong>سابقه و هدف:</strong>به طور سنتی &nbsp;<em><span dir="LTR">Nocardia asteroides</span></em> &nbsp;گونه غالب مسبب نوکاردیوز در نظر گرفته میشود. شناسایی ایزوله ها بدست آمده با استفاده از تکنیک های مولکولی نشان میدهند که جنس ها در معرض پیچیدگی طبقه بندی قابل توجه ای قرار دارند و شناسایی پایه فنوتیپی می تواند مبهم باشد. هدف از این مطالعه بررسی توزیع گونه های نوکاردیا سویه های عمدتا بهبود یافته از بیماران مشکوک به سل، در طول دوره سه ساله بود (1388-1391).</p> <p dir="RTL" style="text-align: justify;"><strong>مواد و روش ها:</strong> ایزوله های بالینی در سطح گونه با استفاده از تست های فنوتیپیک و روش ژنوتیپی شامل تجزیه و تحلیل &nbsp;توالی های تک و چند ژنی (<span dir="LTR">MLSA</span>) از ژن <em><span dir="LTR">gyrB</span></em> &nbsp;<span dir="LTR">,&nbsp; 16S rRNA</span> و <em><span dir="LTR">secA1</span></em> شناسایی شدند.</p> <p dir="RTL" style="text-align: justify;"><strong>یافته ها:</strong>نوکاردیوز در این مطالعه در 46&nbsp; بیمار تشخیص داده شد. شایع ترین حالت زمینه ای پیوند عضو (6 نفر؛ 13٪)، سرطان (6 نفر؛ 13٪)، ویروس نقص ایمنی انسانی (<span dir="LTR">HIV</span>) (6 نفر؛ 13٪)، بیماری های ریوی مزمن غیر عفونی(5 نفر؛10.8 ٪) و سل (4 نفر؛ 8.7٪) شد. درگونه های نوکاردیا بدست آمده از 46 نمونه مختلف بالینی، شایع ترین نوع لاواژ برونکوآلوئولار (<span dir="LTR">BAL</span>) (43.5٪) بود. یازده گونه مختلف از نوکاردیا از بیماران شناسایی شد: &nbsp;<br> <em><span dir="LTR">asteroides</span></em> <em><span dir="LTR">N.</span></em> (12 ایزوله) ، <em><span dir="LTR">cyriacigeorgica</span></em> <em><span dir="LTR">N.</span></em> (9 ایزوله) ، <em><span dir="LTR">farcinica</span></em> <em><span dir="LTR">N</span></em><span dir="LTR">.</span> (7 ایزوله) ، <em><span dir="LTR">wallacei</span></em> <em><span dir="LTR">N.</span></em> (6 ایزوله) ، <em><span dir="LTR">N. carnea</span></em> (3 ایزوله) ، <em><span dir="LTR">N. otitidiscaviarum</span></em> (3 ایزوله) ، &nbsp;<em><span dir="LTR">N. abscessus</span></em> (1 ایزوله) ، <em><span dir="LTR">N. arthritidis</span></em> (1 ایزوله) ، <em><span dir="LTR">&nbsp;N. kruczakiae</span></em> (1 ایزوله) ، &nbsp;<em><span dir="LTR">N.nova</span></em>( 1ایزوله) و <em><span dir="LTR">N</span></em><span dir="LTR">. <em>veteran</em></span> ( 1ایزوله).</p> <p dir="RTL" style="text-align: justify;"><strong>نتیجه گیری: </strong>عفونت ناشی از گونه های نوکاردیا به نظر می رسد شایع تر از انتظار عمومی باشد.مطالعه حاضر شواهد بیشتری را ارائه می کند که گونه های نوکاردیا &nbsp;قادر به ایجاد طیف گسترده ای از بیماری های انسانی در افراد سالم و بیماران دارای نقص ایمنی هستند. <span dir="LTR">MLSA</span> یک روش قابل اعتماد برای شناسایی گونه های دقیق از نوکاردیاهای ایزوله شده است و برای استفاده های معمول در آزمایشگاه بالینی بیشتر امکان پذیر خواهد بود.</p> <p style="text-align: justify;"><strong>Aim and background:</strong>Traditionally <em>Nocardia asteroides </em>was considered the predominant species of causing nocardiosis. The improved identification of isolates using molecular techniques have shown that the genus exhibits considerable taxonomic complexity and phenotypic base identification can be ambiguous. The aim of this study was to assess the species distribution of <em>Nocardia </em>strains mostly recovered from patients suspected of having tuberculosis, during three years period (2009-2012).</p> <p style="text-align: justify;"><strong>Material and methods:</strong>The clinical isolates were identified to species level using conventional tests and genotypic methods using single and multi locus sequence analysis (MLSA) of 16S rRNA, <em>gyrB </em>and <em>secA1 </em>genes. Nocardiosis was diagnosed in 46 patients.</p> <p style="text-align: justify;"><strong>Results:</strong>The most frequent underlying condition were organ transplantation (6 patients; 13%), cancer (6 patients; 13%), human immunodeficiency virus (HIV) (6 patients; 13%), non-infectious chronic lung disease (5 patients; 10.8%) and tuberculosis (4 patients; 8.7%). <em>Nocardia </em>species was recovered from 46 different clinical specimens, the most common of which was bronchoalveolar lavage (BAL) (43.5%). Eleven different <em>Nocardia </em>species were identified: <em>N. asteroides </em>(n=12), <em>N. cyriacigeorgica </em>(n=9), <em>N. farcinica </em>(n=7), <em>N. wallacei</em> (n=6), <em>N. carnea </em>(n=3), <em>N. otitidiscaviarum </em>(n=3), <em>N. abscessus </em>(n=1), <em>N. arthritidis </em>(n=1), <em>N.</em> <em>kruczakiae </em>(n=1), <em>N. nova </em>(n=2) and <em>N. veterana </em>(n=1).</p> <p style="text-align: justify;"><strong>Conclusion:</strong>In conclusion, infection caused by <em>Nocardia </em>species appears to be more common than is generally appreciated. The current study provides further evidence that <em>Nocardia </em>species are capable of causing a wide range of human diseases in healthy and immunocompromised patients. MLSA is a reliable method for accurate species identification of <em>Nocardia </em>isolates and would be more feasible for routine use in clinical laboratories.</p> نوکاردیا, عفونت, شناسایی, MLSA Nocardia, infection, identification, MLSA 75 84 http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-930-4&slc_lang=fa&sid=1 Masoud Salehipour مسعود صالحی پور 10031947532846005426 10031947532846005426 No 1Microbiology Department, Islamic Azad University—Parand Branch, Tehran, Iran گروه میکروب شناسی و بیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد پرند، تهران، ایران Saeed Zaker Bostanabad سعید ذاکر بستان آباد SaeedZaker20@yahoo.com 10031947532846005427 10031947532846005427 Yes 1Microbiology Department, Islamic Azad University—Parand Branch, Tehran, Iran گروه میکروب شناسی و بیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد پرند، تهران، ایران Sahla Rezaee شهلا رضایی 10031947532846005428 10031947532846005428 No Tehran University of Medical Sciences بخش فارماس ت وکال ب وتکنولوژی، دانشکده داروسازی و مرکز تحق قات ب وتکنولوژی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ا ران Abdolrazagh Hashemi-Shahraki عبدالرزاق هاشمی شهرکی 10031947532846005429 10031947532846005429 No Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran بخش اپیدمیولوژی، انستیتو پاستور ایران