<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>New Cellularand Molecular Biotechnology Journal</title>
<title_fa>مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي</title_fa>
<short_title>NCMBJ</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://ncmbjpiau.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-5458</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2228-6926</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>-</journal_id_pii>
<journal_id_doi>-</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>-</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>-</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>7</volume>
<number>25</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>مقایسه و ارزیابی روش‌های آزمایشگاهی اسمیر-کشت-مولکولی عفونت‌های قارچی در نمونه‌های بالینی بیماران</title_fa>
	<title>Comparison and evaluation of laboratory diagnostic method -smear, culture, molecular- in the fungal infection(Aspergillus, Dermatophyte and Mucor)</title>
	<subject_fa>میکروبیولوژی</subject_fa>
	<subject>Microbiology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;strong&gt;سابقه و هدف&lt;/strong&gt;: افزایش نگران کننده عفونت&#8204;های قارچی به ویژه در بیمارانی که به نحوی سیستم ایمنی آنها در دفاع از عوامل عفونی تضعیف شده و نیز پیشرفت&#8204;های گسترده در روش&#8204;های تشخیصی، موجب بررسی&#8204;های گسترده&#8204;تر در تشخیص عفونت&#8204;های قارچی با روش&#8204;های نوین&#8204;تر در گروه&#8204;های مختلف بیماران گردیده است. هدف اصلی این مطالعه مقایسه و ارزیابی روش&#8204;های آزمایشگاهی اسمیر-کشت-مولکولی عفونت&#8204;های قارچی در نمونه&#8204;های بالینی بیماران می&#8204;باشد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;مواد و روش&amp;shy;ها&lt;/strong&gt;: از مرداد 1393 تا دی ماه1393، 420 نمونه &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&#8204;&lt;/span&gt;مشکوک به عفونت&#8204;های قارچی، از سه مرکز بیمارستان رازی، بیمارستان بقیه&#8204;اله و آزمایشگاه مسعود جمع&#8204;آوری شد. آزمایش لام مستقیم برای نمونه&#8204;ها آماده شد و بر اساس نتایج آن&#8204;، نوع ضایعه و تشخیص پزشک متخصص، نمونه&#8204;ها گروه&#8204;بندی شده وآزمایش&#8204;های کشت و مولکولی(&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;) همزمان صورت گرفت.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته &amp;shy;ها&lt;/strong&gt;: از 420 نمونه بررسی شده با روش میکروسکوپی، 15 نمونه(5/3%) آسپرژیلوس، 64 نمونه(2/15%) درماتوفیت و برای موکور نمونه&#8204;ای تشخیص داده نشد. از15 نمونه آسپرژیلوس، 12 نمونه(80%) در نتیجه کشت مثبت و 3 نمونه (20%) منفی بود و با روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Nested&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;، 15 نمونه مثبت شدند. از64 نمونه درماتوفیت&#8204;ها&#8204;، نتیجه کشت40 مورد&#8204; (5/62%) مثبت و16 نمونه(25%) منفی بودند. تعداد 6 مورد (3/9%) آلودگی ساپروفیت و 2 نمونه &#8204;(12/3%) در محل تلقیح، آسپرژیلوس رشد کرده بودند. با روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Nested&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;،&amp;nbsp; 62 مورد (8/96%) مثبت شد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;نتیجه&#8204;&#8204;گیری: نتایج بدست آمده در این مطالعه، نشان می&#8204;دهد که &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; با توجه به حساسیت بالا، قابلیت خوبی در تشخیص بیماری قارچی در مراحل اولیه عفونت دارد. از آنجایی که تشخیص سریع و اختصاصی عفونت&#8204;های قارچی، به ویژه با توجه به جنس&#8204;ها و گونه&#8204;های عامل بیماری، امکان اعمال پروتکل&#8204;های درمانی ضد قارچی را بطور جهت&#8204;دار و با کفایت فراهم خواهد کرد، طراحی و به&#8204;کار&#8204;گیری تکنیک&#8204;های سریع، دقیق و حساس در این رابطه بسیار ضروری و اجتناب ناپذیر خواهد بود.&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>Aim and Background: Alarming increase in fungal infections, especially in immunocompromised patients against the infectious agents and the vast advances in diagnostic methods of such diseases, causing extensive investigations for the diagnosis of fungal infections with more modern methods in different groups of patients.  Our main objective is to evaluate and compare methods of laboratory diagnosis of smear-culture-molecular in fungal infections (dermatophytes, Aspergillus, Mucor) in clinical samples.

Materials and Methods: since August 2014 to January 2015, 420 cases of suspected fungal infections, from the Razi Hospital, Baqiyatallah hospital and Massoud laboratory were collected.
Smear preparation of the samples was carried out and on the basis of these findings, type of lesion and diagnosed by specialists, samples are grouped. Culture and molecular methods (PCR and PCR-Sequencing) at the same time was performed.

Results: Of the 420 samples analyzed by direct smear, 15 (5/3%) of Aspergillus, 64 samples (15/2%) of dermatophytes and zero sample of Mucor were identified. In 15 specimens of Aspergillus, 12 samples (80%) consisted with positive cultures and 3 cases (20%) were negative and based on Nested PCR results, all of 15 samples were positive. Of 64 samples of dermatophytes, 40 cases (62/5%) were positive by culture method and 16 cases (25%) were negative. 6 samples (3/9%) consisted with saprophytic contamination and 2 samples (12/3%) showed Aspergillus growth at the injection site, respectively. Based on Nested PCR method, 62 samples (8/96%) showed positive result.

Conclusion: The results of this study indicate that the PCR, with respect to its high sensitivity, bearings good capabilities for detection of fungal disease in the early stages of infection. Since the rapid and specific diagnosis of fungal infections, especially with regard to the genera and species of the fungal organisms, provide the possibility of proper and adequate applying of antifungal therapy protocols. Thus in this context, appropriate performance of rapid, specific and sensetive techniques would be necessary and inevitable.
</abstract>
	<keyword_fa>آسپرژیلوس, درماتوفیت, موکور, اسمیر, PCR, کشت</keyword_fa>
	<keyword>Mucor ,Aspergillus, Dermatophyte, Smear, ‍‍Culture, PCR</keyword>
	<start_page>19</start_page>
	<end_page>26</end_page>
	<web_url>http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-877-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Nasrin </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>sheikhi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نسرین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شیخی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>nasrin_sheikhi@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846006780</code>
	<orcid>10031947532846006780</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Genetics, Zanjan Branch, Islamic Azad University, Zanjan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ژنتیک دانشگاه آزاد واحد زنجان، زتجان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Saeid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zaker Bostanabad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سعید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ذاکر بستان آباد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846006781</code>
	<orcid>10031947532846006781</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department  of Biology and Microbiology, Islamic Azad University, Parand Branch, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی دانشگاه آزاد اسلامی واحد پرند</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sina </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mirza Ahmadi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سینا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>میرزا احمدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846006782</code>
	<orcid>10031947532846006782</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Genetics, Zanjan Branch, Islamic Azad University, Zanjan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ژنتیک دانشگاه آزاد واحد زنجان، زتجان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
