@article{ author = {Bozorgnejad, Alireza and Baghi, Fatemeh and Akbarzadeh, Azim and Arjmand, Mehdi Mehdi}, title = {A nano Carrier Extracted from Archaea Called Archaeosome Examination of Cisplatin Loading}, abstract ={Aim and Background. Archaeosome is known as a new lipid carrier for targeted drug delivery in cancer therapy. The anti cancer drug , Cisplatin , is encapsulated in archaeosome to reduce the side effects of drug on other cells and offer more dosage of drug on target cellMaterial and Method. Archaeosome was extracted from methanogens and after being dissolved in phosphate buffer, the solution was sonicated in bath sonicator for loading the cisplatin on extracted archaeosome and resize to nano scale.Results. Mass balance was obtained using density and molecular weight of sonicated solution elements, and therefore, the loading percentage of drug on nano archaeosome was obtained. The particles size in nano scale was confirmed with zeta sizer. Conclusion. The main purpose of this research was to load cisplatin on archaeosome for targeted drug delivery against cancer. We obtained very suitable loading percentage that allowed us to succeed in our aim.}, Keywords = {archaeosome, cisplatin , targeted drug delivery , loading }, volume = {2}, Number = {5}, pages = {9-13}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {نانو حاملی بر گرفته از آرکی باکترها تحت عنوان آرکئوزوم و بررسی بار گذاری داروی سیس پلاتین بر روی آن}, abstract_fa ={ سابقه و هدف : آرکئوزرم به عنوان یکی از حامل های لیپیدی جدید برای دارورسانی هدفمند، جهت درمان انواع سرطان شناخته شده است . برای حذف اثرات جانبی دارو بر سایر سلول ها و رسیدن دوز بالاتری از دارو به سلول هدف، داروی ضد سرطان سیس پلاتین در آرکئوزرم کپسوله می شود.  مواد و روش ها : آرکئوزرم از آرکی باکتر های متانوژن استخراج شد و پس از انحلال در بافر فسفات، به منظور بارگذاری سیس پلاتین بر آرکئوزرم ساخته شده و تغییر اندازه ذرات به ابعاد نانو، محلول در سونیکاتور حمام دار سونیکه شد . یافته ها : موازنه جرم با استفاده از دانسیته و جرم مولکولی مواد تشکیل دهنده محلول سونیکه شده محاسبه شد . سپس، میزان درصد بارگذاری دارو بر روی نانوآرکئوزرم حاصل گردید و در نهایت با استفاده از دستگاه زتاسایزر اندازه ذرات در ابعاد نانو تایید شد .  نتیجه گیری : هدف از پژوهش حاضر، تولید نانوآرکئوزرم حامل داروی سیس پلاتین بود که به منظور دارورسانی هدفمند، جهت درمان انواع سرطان به کار گرفته می شود که با درصد بارگذاری مناسب به این مهم دست یافتیم .   }, keywords_fa = {آرکئوزرم، سیس پلاتین، دارورسانی هدفمند}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-119-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-119-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Nasiri, Najmeh and Shokri, Ehsan and Nematzadeh, Ghorbanali}, title = {Molecular Cloning and Characterization of Vacuolar H+-ATPase Subunit C Gene in Halophyte Plant, Aeluropus Littoralis}, abstract ={Aim and Background. In plants, ions uptake management, translocation, exchange, compartmentalization and precise adjustment of ionic ratios were carried out through the activity of a series of carriers, ion channels and transporters. The vacuolar H+-ATPase (VHA), plays a crucial role in establishing and maintaining intracellular pH gradients across specialized organellar membranes, and influences the transport of cations into the vacuoles of plant cells. Activity of this pump provides the primary proton motive force for the execution and regulation of other ion transporters, semi-transporters and H+-dependent channels in the membrane vacuoles. Due to the apparent importance of this pump in improving salt tolerance, in this study, Aeluropus littoralis a monocot halophyte was used as a gene source. Materials and Methods. A cDNA clone with complete length of 498bp contains the necessary information to encode the c subunit of V-ATPase (AlVHA-c) isolated from the A. littoralis plant and was cloned in E. coli bacterium. Results. The nucleotide sequence of the gene (AlVHA-c) showed a significant homology with its counterpart in millet, rice, wheat and maize. In addition the various bioinformatics analysis was performed to clarify the evolutionary relationships and to investigate the possible amino acid and nucleotide sequences differences. Conclusion. Finally the complete coding sequence was submitted to GenBank with accession number of (JF504672). }, Keywords = {Proton pump, vH+-ATPase subunit c, Salt stress, Aeluropus littoralis }, volume = {2}, Number = {5}, pages = {15-23}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {همسانه سازی و تعیین خصوصیات ژن زیر واحد c آنزیم H+- ATPase واکوئلی در گیاه هالوفیت Aeluropus littoralis}, abstract_fa ={سابقه و هدف : مدیریت جذب، انتقال، تبادل و کده بندی کردن یون ها و تنظیم دقیق نسبت های یونی در گیاهان به واسطه فعالیت مجموعه ای از ناقل ها، حامل ها و کانال های یونی صورت می پذیرد . پمپ یونی H+-ATPase واکوئلی، نقش مهّمی در ایجاد و حفظ شیب الکتروشیمیایی دارد و انتقال یون ها به داخل واکوئل سلول های گیاهی را تحت تأثیر قرار می دهد . فعالیت این پمپ باعث ایجاد نیروی محرکه پروتونی اولیه برای راه اندازی و تنظیم سایر ترانسپورترها، سیمپورترها و کانال های وابسته به + H مستقر در غشای واکوئل می شود . در این تحقیق بدلیل اهمیت آشکاری که این پمپ در زمینه بهبود مقاومت به شوری دارد، از گیاه تک لپه و شورزی Aeluropus littoralis به عنوان منبع ژن استفاده شد . مواد و روش ها : یک کلون cDNA با طول کامل ( bp 498 ) ، که حاوی اطلاعات لازم برای کد کردن زیر واحد ( AlVHA-c)  V- H+ ATPase c می باشد از Aeluropus littoralis جداسازی و در باکتری E. coli همسانه سازی شد . یافته ها : توالی نوکلئوتیدی این ژن ( AlVHA-c ) ، همولوژی بسیار معنی داری با همتای خود در گونه های ارزن، برنج، گندم و ذرت نشان داد . همچنین آنالیزهای مختلف بیوانفورماتیکی به منظور آشکارسازی روابط خویشاوندی و تکاملی و بررسی تفاوت های احتمالی با استفاده از توالی آمینواسیدی و نوکلئوتیدی این ژن انجام شد . در نهایت توالی کامل ناحیه کد کننده در Genbank با شماره دسترسی ( JF504672 ) ثبت شد . نتیجه گیری : زیر واحد c ، پمپ H+-ATPase واکوئلی گیاه آلوروپوس نقش مهمی در فیزیولوژی پاسخ به تنش دارد .}, keywords_fa = {پمپ پروتونی، زیر واحد H+- ATPase c واکوئلی }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-120-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-120-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Peyvandi, Maryam and Mirza, Mehdi and KamaliJamakani, Zahr}, title = {The Effect of Nano Fe Chelate and Fe Chelate on the Growth and Activity of some Antioxidant}, abstract ={Aim and background. Satureja is a genus of aromatic plants of the family Lamiaceae. The effect of nano Fe chelate and Fe chelate on the growth of Satureja hortensis was investigated. Materials and methods. The experiment was conducted in farm condition in the form of randomized design based on four replications. Plants were treated by different concentrations of iron chelated fertilizer (0, 1.5 ,4.5 ,7.5 kgha-1) and nano chelated fertilizer (0, 1,  3 ,5 kgha-1).Results. Catalase and ascorbate peroxdiase activity was significantly increased in nano Fe fertilizer (4.5 kgha-1). The chlorophyll a content was significantly increased in the Fe chelate (1 kgha-1) and all nano Fe treatments. The effect of nano Fe on chlorophyll b content was more than Fe chelate.Conclusion. The length of stem and root were decreased in all Fe and nano Fe treatments in comparison to control. Also by using the fertilizers, the protein content showed significant differences. High concentrations of Fe chelate and nano Fe chelate decreased the protein content. In the nano Fe treatments indicated that decreasing protein content was more than Fe treatments. Fe chelate decreased and nano Fe increased the total chlorophyll content.}, Keywords = {Satureja hortensis, nano Fe chelate fertilizer, Catalase, Peroxdiase, ascorbate peroxdiase}, volume = {2}, Number = {5}, pages = {25-32}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {تاثیر نانو کلات آهن با کلات آهن بر رشد و فعالیت آنزیم های آنتی اکسیدان مرزه Satureja hortensis}, abstract_fa ={سابقه و هدف :جنس مرزه گیاه دارویی، از تیره نعناییان است. این تحقیق به منظور بررسی و مقایسه اثر نانو کود کلات آهن و کود کلات آهن معمولی بر عملکرد و رشد گیاه دارویی مرزه Satureja hortensis انجام گرفت.مواد و روش ها: آزمایش به صورت فاکتوریل در قالب بلوک های کاملاً تصادفی با 4 تکرار اجرا گردید. تیمار های مورد بررسی شامل 3 تیمار  نانو کود کلات آهن در سه غلظت 1 ، 3 ، 5 کیلوگرم در هکتار و 3 تیمار کود کلات آهن معمولی در 3 غلظت 5/1، 5/4، 5/7 کیلوگرم در هکتار و تیمار شاهد بود.یافته ها: فعالیت کاتالاز و آسکوربات پراکسیداز در تیمار نانو آهن (kgh-1 5/4) افزایش معنی داری را نشان داد. کاربرد کلات آهن در تیمار (F1)  و همه غلظت های نانو آهن موجب افزایش معنی دار در غلظت chl.a  شد. کاربرد کود نانو آهن در همه غلظت ها در افزایش میزان chl.b موثرتر از همه غلظت های کلات آهن بود.نتیجه گیری: طول ریشه و طول ساقه در تمام تیمارهای نانو کلات آهن کاهش یافت. همچنین با اعمال تیمار های مختلف کودی، تغییرات معنی داری بر محتوای پروتئین نسبت به گروه شاهد مشاهده شد.کاربرد کلات آهن و نانو آهن با غلظت بالا موجب کاهش میزان پروتئین شد. این کاهش در تیمار نانو آهن محسوس تر بود. کلات آهن، موجب کاهش و نانو کود کلات آهن موجب افزایش میزان مجموع کلروفیل های a وb شد.}, keywords_fa = {مرزه Satureja hortensis، نانو کود کلات آهن، آسکوربات پراکسیداز}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-121-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-121-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Ghanavati, Farangis}, title = {Pollen Grain Morphology in some of Onobrychis Species}, abstract ={Aim and background. The genus Onobrychis Adans (Fabacea) belongs to Hedysareae tribe. Onobrychis is the biggest genus of Hedysareae Tribe which has 27 endemic species in Iran.Materials and Methods. Pollen morphology of 11 taxa of the Onobrychis was studied with Scanning Electron Microscopy (SEM).Results. the results obtained showed that pollen grain is 3-collpate, prolate or perprolate. Exine ornamentation is reticulate and dimention of lumen is different. The equatorial view was elongated, elliptic and the pollar view was circular or obtus-triangular. One pollen type is recognized based on size, equatorial and polar view and exines ornamentation. Conclusion. Pollen morphological studies provided the opportunity to identify and separate species.}, Keywords = {Electron microscopy, Onobrychis, pollen morphology}, volume = {2}, Number = {5}, pages = {33-44}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {ریخت شناسی دانه گرده در برخی از گونه های اسپرس}, abstract_fa ={سابقه و هدف: جنس اسپرس با نام علمی Onobrychis متعلق به خانواده Fabaceae و بزرگترین جنس قبیله طایفه  Hedysareae  می باشد که 27 گونه آن انحصاری ایران است. مواد و روش ها: در تحقیق حاضر ویژگی های دانه گرده 11 تاکسون از جنس اسپرس به کمک میکروسکوپ الکترونی نگاره (SEM) مورد بررسی قرار گرفت. یافته ها: نتایج نشان داد که دانه های گرده مورد بررسی از نوع سه شیاری، پرولیت و پرپرولیت می باشند. در آن ها اکتوکولپی طویل، کم عمق یا عمیق و در قطبین باریک شده و غشاء شیار (colpi) با گرانول های ریزو درشت پوشیده شده است. تزئینات سطح اگزین از نوع مشبک (reticulate) و لومن از نظر اندازه متفاوت است. از دید استوایی دانه گرده از نوع کشیده، بیضوی بوده و از دید قطبی کروی و یا سه وجهی لب گرد می باشند. براساس اندازه، شکل از دید قطبی و استوایی، و تزئینات سطح اگزین دانه های گرده مورد بررسی به یک گروه تقسیم شدند. نتیجه گیری: مطالعات ریخت شناسی دانه گرده امکان تشخیص و تفکیک گونه ها را فراهم می کند. }, keywords_fa = {ریخت شناسی دانه گرده، اسپرس، میکروسکوپ الکترونی }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-122-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-122-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {zakerBostanAbad, Saeed and BakhshiKhaniki, Gholamreza and Mohsennejad, Fatemeh}, title = {Asexual Reproduction of Juglans regia L. by using Growth Regulators of IBA and 2,4-D}, abstract ={Aim and Background. The Juglans regia L. is a plant with difficulty in rooting, therefore, its asexual reproduction is almost impossible. The aim of this study was to conduct and improve the advantage of asexual reproduction by using growth regulators of  IBA and 2,4-D.Materials and Methods. In order to keep major characteristics, we studied the effects of treatments and growth regulators of  IBA and 2,4-D in several concentrations on 40 plantlet in five groups. Results. The results showed that application of IBA has important  effects on root primordium initiating  but application of 2,4-D does not show significant initiation. Both treatments of IBA and 2,4-D tend to increasing length of roots. Conclusion. This research show that,  treating of shoots with IBA  have not important effect on shoot primordium initiation,  but  2,4-D treatment are very important effects. Over all treatment with IBA and 2,4 –D caused to increasing the rooting  in survival of cutting.  }, Keywords = {Julans regia L, asexual reproduction, rooting, IBA, 2,4-D}, volume = {2}, Number = {5}, pages = {45-51}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {ازدیاد غیر جنسی گردوی خوراکی (.Juglans regia L)با استفاده از تنظیم کننده های رشد}, abstract_fa ={سابقه و هدف: گردو (.Juglans regia L) گیاهی است سخت ریشه زا و از این رو تکثیر گونه ها و واریته های مختلف آن با روش های متداول غیر جنسی تقریبا امکان پذیر نمی باشد. هدف از این تحقیق بررسی روش های تکثیر غیر جنسی گردوی خوراکی با استفاده از تنظیم کننده های رشد IBA و 2,4-D است. مواد و روش ها: ابتدا تعداد 40 قلمه‌ی 20 سانتی‌متری سالم و مرغوب از یک گردوی اصلاح نژاد شده با نام محلی گردوی کاغذی از مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی تبریز انتخاب و در 5 گروه (یک گروه شاهد و چهار گروه تیمار) قرار گرفتند. آزمایش با توجه به فاکتورهای پیش بینی شده با 4 تیمار (دو غلظت متفاوت از IBA و 2,4-D) و یک گروه شاهد در اواسط فروردین 1387 انجام شد.یافته ها: تیمار IBA در روش قلمه زنی نقش موثری در ظهور اولین پریموردیوم ریشه دارد، ولی تیمار 2,4-D روی ظهور اولین پریموردیوم ریشه، تاثیر چندانی از خود نشان نداد. همچنین تیمارهای 2,4-D و IBA هر دو موجب افزایش طول ریشه چه گردیدند.نتیجه گیری: مطالعات نشان داد که تیمار اندام های هوایی با IBA تاثیر چشم گیری روی ظهور اولین اندام هوایی (ساقه چه) ندارد ولی تیمار 2,4-D، ظهور، رشد و تکثیر اولین اندام هوایی را به شدت تحریک می کند. تیمار همزمان قلمه با تیمارهای 2,4-D و IBA موجب افزایش درصد بقای قلمه ی ریشه دار شده می شود.}, keywords_fa = {گردو، از دیاد غیر جنسی، ریشه زایی}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-123-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-123-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Heydarinasrabadi, Mitra and Haghighi, Fahimeh and SarafraziEsfandabadi, Fereshteh and Jahanbakhsh, Leyla and RahimiMotlagh, Mahsa and Zahedi, Farim}, title = {The Teratogenic Effects of Bromadiolone on Rat Fetus}, abstract ={Aim and background. Bromadiolone is one of the well known toxic substances. Toxic effects of bromadiolone have been studied more on different organs of experimental animals. But studying the effects of the toxin on fetus and placenta is still insufficient. In this study, we studied rat embryos exposed to bromadiolone in a short period. Materials and Methods. Animals used in this study were Wistar rats. After the occurrence of pregnancy, female rats were placed in two groups, randomly (n=7). Bromadiolone was given to the experimental group animals on the day 5 of pregnancy in one turn in a dose of 0.11 mg/kg and then sterilized water was given to the control group. On the 15th day of pregnancy, rats were killed and embryos were taken out of the womb. Weight and diameter of embryos were measured and then embryos were used for histological and statistical studies.Results. In the experimental group, there was no significant difference between fetal weight and size of experimented and control groups but in experimental group there were significant decreased in the number of embryos due to fetal atrophy (p<0.05). Hemorrhagic areas of the external structure in the experimental embryos and although, edema of gastric, intestinal lobe and liver was also seen. Conclusion. These results showed that bromadiolone causes teratogenic malformation in the ratfetus}, Keywords = {Bromadiolone, Teratogenic Effects, rat Fetus }, volume = {2}, Number = {5}, pages = {53-58}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {آثار تراتوژنی برومادیالون برروی جنین موش صحرائی}, abstract_fa ={سابقه و هدف: برومادیالون ماده سمی شناخته شده ای می باشد. اثرات سمی آن بر ساختمان های مختلف حیوانات آزمایشگاهی بالغ، مورد مطالعه زیادی قرار گرفته است. اما مطالعه اثرات آن بر جنین و جفت همچنان ناکافی می باشد. در این تحقیق جنین موش صحرائی قرار گرفته در معرض برمودیالون طی یک دوره زمانی کوتاه، مورد مطالعه قرار گرفته است. مواد و روش ها: حیوان مورد استفاده در این تحقیق، موش های صحرایی نژاد ویستار می باشند. موش های ماده پس از بروز بارداری به طور تصادفی در 2 گروه جای داده شدند (در هر گروه 7 راس). به حیوانات گروه تجربی این مطالعه، در روز 5 بارداری در یک نوبت برومادیالون با دوز mg/kg 11/0 و به موش های گروه کنترل در همان روز آب استریل داده شد. در روز 15 حاملگی، موش ها کشته شده و جنین ها از رحم بیرون آورده شدند. وزن و قطر جنین ها اندازه گیری شده و سپس جنین ها تحت مطالعات بافت شناسی و آماری قرار گرفتند.یافته ها: در گروه تجربی بین وزن و اندازه جنین ها با گروه کنترل اختلاف معنی داری دیده نشد اما در تعداد جنین ها به دلیل وجود جنین آتروفی در گروه تجربی کاهش معنی داری مشاهده گردید (05/0 > p). در ساختمان خارجی جنین گروه تجربی نواحی هموراژیک و همچنین آماس معده، لوپ های روده و کبد نیز مشاهده گردید.نتیجه گیری: نتایج فوق نشان دادند که برومادیالون باعث بروز ناهنجاری های تراتوژنی در جنین شده است.}, keywords_fa = {برومادیالون، تراتوژنیک، جنین موش}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-124-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-124-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {BakhshiKhaniki, Gholamreza and Ghorbanli, Mahlagha and Mirbagheri, Shokat sadat}, title = {Biochemical Changes of two Cultivars of Golab and Shafiabadi Apple at Harvesting Time and After Storing}, abstract ={Aim and Background. Physiological characteristics of two apple cultivars (Golab and Shafiabadi) were surveyed after harvesting  and storing at the Agricultural Pardis and Natural Resources of Tehran University. Materials and Methods. Two cultivars were selected and some certain physiological characteristics were examined twice. These characters were weight, volume, density, extracted volume, PH, amount of solved and unsolved material, dry matter and ethylene hormone of the fruit. Results. The result showed that there were significant differences among characters between two examined cultivars and also the differences were significant between two times of sampling among fruit weight, PH and ethylene amounts.Conclusion. There were significant differences between two apple cultivars corresponding to ethylene amount, Golab cultivar produces much more amount of ethylene compared with Shafiabadi cultivar.}, Keywords = {Golab apple, Shafiabadi apple, Biochemical changes, harvesting, storing }, volume = {2}, Number = {5}, pages = {59-65}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {تغییرات بیوشیمیایی دو رقم سیب گلاب و شفیع آبادی در زمان برداشت و پس از انبارداری}, abstract_fa ={سابقه و هدف: بررسی صفات فیزیولوژیکی دو رقم سیب در زمان برداشت آزمایشی و پس از انبارداری در پردیس کشاورزی و منابع طبیعی  دانشگاه تهران انجام شد.مواد و روش ها: دو رقم سیب ایرانی زودرس به نام های گلاب و شفیع آبادی انتخاب و چندین صفت در دو زمان (بلافاصله پس از برداشت و 20 روز پس از انبارداری) اندازه گیری شدند. این صفات عبارت بودند از: وزن میوه، حجم میوه، چگالی میوه، حجم عصاره، اسیدیته،pH ، میزان مواد جامد محلول، درصد ماده خشک، اتیلن و میزان برخی عناصر اندازه گیری شد.یافته ها: نتایج نشان داد که بین دو رقم، اختلاف معنی داری در بیشتر صفات اندازه گیری شده وجود داشت و همچنین بین دو زمان مختلف نمونه برداری از نظر صفات وزن میوه، اسیدیته و اتیلن اختلاف معنی داری وجود داشت.نتیجه گیری: اختلاف معنی داری بین ارقام مورد آزمایش (گلاب و شفیع آبادی) از نظر میزان تولید اتیلن وجود داشت. رقم گلاب نسبت به رقم شفیع آبادی دارای میزان تولید اتیلن بیشتری است.}, keywords_fa = {سیب گلاب، سیب شفیع آبادی، تغییرات بیوشیمیایی، برداشت، انبارداری}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-125-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-125-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Gholizadeh, Fatmeh}, title = {Biotechnology and Gene Silencing}, abstract ={ RNA interference (RNAi) is a system within living cells that helps to control which genes are active and how active they are. Two types of small RNA molecules-microRNA (miRNA) and small RNA interference (siRNA) - are central to RNA interference. RNAs are the direct products of genes, and these small RNAs can bind to specific other RNAs and either increase or decrease their activity, for example by preventing a messenger RNA from producing a protein. RNA interference has an important role in defending cells against parasitic genes – viruse and transpose – but also in directing development as well as gene expiration in general. RNA interference is now a widely used biology research technique that can be applied to both cultured cells and whole animals. RNA interference can be used to selectively reduce the level of expression of a specific protein. Clues to the function of the protein can be obtained by observing changes in cell or organism behavior after knockdown of expression in general.}, Keywords = {Gene Silencing- microRNA- RNA interference (RNAi)}, volume = {2}, Number = {5}, pages = {67-73}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {خاموشی ژن ها و بیوتکنولوژی}, abstract_fa ={  تداخل ژنی یک وسیله مهم دفاعی در زیست شناسی مولکولی و به خصوص در ارگانیسم های رده پایین است که در آن قطعات مشخصی از RNA دو رشته ای در بیان یک ژن خاص مداخله می کنند. تداخل RNA اخیرا به عنوان یک تکنیک آزمایشی موفق به منظور تعیین عملکرد ژن ها از طریق تخریب ژن ها در مدل های موجودات به کار رفته است. اهمیت RNA دو رشته ای به عنوان یک هدف یا واسطه ساختار کلیدی است که تمام مسیر های خاموشی RNA را در تمام موجودات مختلف به هم مرتبط می کند. تداخل RNA متد مهمی است که تنها روی تعداد اندکی از مولکول های دو رشته ای RNA در هر سلول برای خاموشی بیان ژن ها به کار می رود و در حال حاضر یکی از برجسته ترین موضوعات بیولوژی مولکولی است. توانایی قابل توجه دستکاری خاموشی RNA ، طیف وسیعی از کاربرد بیوتکونولوژی را در بیولوژی مولکولی و ژن درمانی در موجودات فراهم کرده است. این تکنولوژی قادر است ویروس های القا کننده خاموشی را به عنوان ابزاری مناسب جهت مطالعات ژنتیک کاربردی به کار برد. تکنیک تداخل RNA ، با انجام تحقیقات گسترده رو به تکامل است. در این مقاله مکانیسم تداخل RNA ، مسیرهای موجود در آن و همچنین تکنیک RNA درمانی مورد بررسی قرار گرفته اند.}, keywords_fa = {Gene Silencing , microRNA , RNAi }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-128-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-128-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Mohajeri, nasrin and Kazemi, Bahram}, title = {Investigation of Innate Immune Signaling Concerned with siRNA from a Molecular Viewpoint}, abstract ={RNA interference (RNAi) has emerged as a powerful tool to suppress gene expression in a variety of cell lines by mediated small interfering RNAs (siRNA). In addition to the gene-silencing activity of siRNA, it can induce pro-inflammatory cytokines and type I interferon. RNA-sensing immonoreceptors include Toll-like receptor (TLR) family and cytosolic RNA-sensing proteins like Protein Kinase R (PKR), 2 َ -5 َ Oligo adenylate synthetase (2›-5›OAS), Retinoic-acid Inducible Gene –I (RIG-I), Melanoma Differentiation-associated gene-5 (MDA-5) and Nuclear Factor kappa B cell (NF-κB). Induction of IFN can be raised the signaling pathways associated with the TLR. Each of receptors group is able to induce signals in response to a variety of ligands, initiating the pro inflammatory cytokines response. This review article describes gene silencing, the role of cellular factors in innate immunity gene regulation and induction of interferon by double-stranded and single stranded siRNA.}, Keywords = {RNAi, siRNA, gene regulation, innate immunity}, volume = {2}, Number = {6}, pages = {9-15}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی پیام رسانی در سیستم ایمنی ذاتی مرتبط با siRNA از دیدگاه مولکولی}, abstract_fa ={RNA interference) RNAi) که ازسوی siRNA) Small interfering RNA) میانجیگری می شود، ابزار قدرتمندی برای مهار بیان ژن در رده های مختلف سلولی است. siRNA ها علاوه بر عمل خاموش کردن ژن در القای سایتوکاین های پیش التهابی (Pro-inflammatory) و اینترفرون نوع I نیز دخالت دارند. گیرنده های ایمنی شناسایی کننده RNA شامل ( Toll-like receptor (TLR ها و پروتئین های سیتوزولی شناساگر RNA مانند: PKR1, RIG-I 2, MDA-5 3, 2'- 5'OAS4, IRF5, NF-κB6 می باشند. القای بیان اینترفرون ناشی از مسیرهای پیام رسانی است که به TLRها مربوط می شود. هرکدام از این رسپتورها در پاسخ به لیگاند های مختلف، توانایی القای پیام را دارند و سبب آغاز پاسخ سایتوکاین های پیش التهابی می شوند. در این مقاله درباره خاموش شدن ژن توسط siRNA، نقش فاکتورهای سلولی در تنظیم بیان ژن های سیستم ایمنی ذاتی و القای اینترفرون توسط siRNA دو رشته ای و تک رشته ای توضیح داده می شود.}, keywords_fa = {siRNA، RNAi، تنظیم بیان ژن، ایمنی ذاتی }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-177-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-177-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Fathi, Mojtaba and Taghikhani, Mohammad and GhannadiMaragheh, Mohammad and Yavari, Kamal}, title = {Lutetium labeled-siRNA Delivery into Colon Cancer Cells Using Liposomes: A Comparative Study}, abstract ={ Aim and Background. Gene silencing effect of siRNA significantly depends upon an appropriate method to introduce it into the cells. In the present study, the effect of liposomes on 177Lu-siRNA delivery into colon cancer cells has been studied quantitatively.  Material and Methods. siRNA was conjugated with p-SCN-Bn-DTPA and labeled with lutetium. After being purified with Vivaspin and Sephadex G25 columns, 177Lu-siRNA complexes were evaluated for purity and integrity using ITLC and PAGE, respectively. Labeled siRNAs were transfected into colon cancer cells using Lipofectamine and siPORT Neo FX. Then, percentage of the transfection was quantitatively calculated with a gamma counter. For the evaluation of cytotoxic effects of the labeled siRNA, microscopic photographs and cell counting were used.  Results. ITLC showed that the purity of 177Lu-siRNA complex products were in excess of 95%. The percentage of the transfected 177Lu-siRNA complexes with Lipofectamine was significantly higher compared to that of siPORT Neo FX (P < 0. 01). Cell counting and microscopic photographs indicated that 177lu-siRNA complex targeting IGF-1R had significantly cytotoxic effect on the understudied cells compared to the control groups (P < 0.001). Conclusion. The present study shows that efficiency of the lipofectamine in transfection of the 177Lu-siRNA into colon cancer cells is more than siPORT Neo FX, and 177Lu-siRNA targeting IGF-1R has cytotoxic effect on colon cancer cells.}, Keywords = {Transfection, Colon cancer, IGF-1R, siRNA, Lutetium, Cytotoxic }, volume = {2}, Number = {6}, pages = {17-25}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {انتقال siRNA نشاندار با لوتسیم به داخل سلول های سرطانی کولون با استفاده از لیپوزوم ها: مطالعه مقایسه ای}, abstract_fa ={سابقه و هدف: اثر خاموش سازی ژن با siRNA به طور قابل توجهی به یک روش مناسب جهت عرضه آن به سلول ها بستگی دارد. در پژوهش حاضر، اثر لیپوزوم ها در انتقال کمپلکس siRNA - 177Lu به سلول های سرطانی کولون به طور کمی مورد مطالعه قرار گرفته است.مواد و روش ها: siRNA با p-SCN-Bn-DTPA کونژوگه و با لوتسیم نشاندار شد. کمپلکس های siRNA - 177Lu پس از تخلیص با ستون های Vivaspin و سفادکس G25، به منظور تعیین در صد خلوص و سالم بودن به ترتیب با ITLC و PAGE بررسی شدند. siRNA های نشاندار با استفاده از لیپوفکتامین و siPORT Neo FX به سلول های سرطانی کولون ترانسفکت شدند، سپس در صد ترانسفکشن با شمارشگر گاما به طور کمی محاسبه گردید. از تصاویر میکروسکوپی و شمارش سلولی برای بررسی اثرات سیتوتوکسیک کمپلکس های نشاندار روی سلول های سرطانی استفاده شد.یافته ها: ITLC نشان داد که خلوص کمپلکس های siRNA - 177Lu تولید شده، بیش از %95 بود. در صد ترانسفکشن کمپلکس siRNA - 177Lu به سلول های سرطانی کولون توسط لیپوفکتامین در مقایسه با siPORT Neo FX به طور معنی دار بالا بود (P < 0.01). شمارش سلولی و تصاویر میکروسکوپی نشان داد که کمپلکس siRNA - 177Lu ضد IGF-1R اثر سیتوتوکسیک معنی داری روی سلول‌های مورد مطالعه نسبت به گروه کنترل دارد (P < 0.001).نتیجه گیری: پژوهش حاضر نشان می دهد که کارایی لیپوفکتامین در انتقال کمپلکس siRNA - 177Lu به سلول های سرطانی کولون در مقایسه با siPORT Neo FX بیشتر است و siRNA - 177Lu ضد IGF-1R اثر سیتوتوکسیک بر روی سلول های سرطانی کولون دارد.}, keywords_fa = {ترانسفکشن، سرطان کولون، رسپتور فاکتور رشد شبه انسولین نوع یک، RNA مداخله گر کوچک، لوتسیم، سیتوتوکسیک}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-178-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-178-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Gholami-Shabani, Mohammad Hassan and Imani, Afshin and chamani, Mohammad and Razzaghi-Abyaneh, Mahdi and Riazi, Gholam Hossein and Chian, Mohsen and Akbarzadeh, Azim}, title = {Evaluation of the Antibacterial Properties of Silver Nanoparticles synthesized with Fusarium Oxysporum and Escherichia coli}, abstract ={Aim and Background. Silver nanoparticles have antibacterial properties and are used in textile, hygiene, refinement, staining, agriculture and livestock industries. The aim of this study was the production of silver nanoparticles using Fusarium oxysporum and Escherichia coli. Materials and Methods. We used agar diffusion disk for the inspection of antibacterial properties of nanosilver colloids. The shape and morphology of nanosilver colloids were evaluated by transmission electron microscopy. Results. The presence of nanosilver colloids was confirmed by UV/Vis spectrophotometry. The mean size of nanoparticles produced by F. oxysporum was smaller than those of them in E. coli. Conclusion. Results of the present study showed that the quality of nanosilver colloids from F. oxysporum is better than those of them in E. coli.}, Keywords = {Silver nanoparticles, Antibacterial activity, Escherichia coli, Fusarium oxysporum}, volume = {2}, Number = {6}, pages = {27-33}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی خواص آنتی باکتریال سطوح دارای پوشش نانو ذرات نقره زیست سنتز شده با قارچ فوزاریوم اگزیسپوروم و باکتری اشرشیا کلی}, abstract_fa ={سابقه و هدف: نانو ذرات نقره به دلیل داشتن خواص آنتی باکتریال کاربردهای زیادی از جمله در صنایع نساجی، سرامیک های بهداشتی، تصفیه آب، رنگ، کشاورزی، دامپروری و در کامپوزیت های پلیمری به منظور کاربردهای صنعتی و خانگی به عنوان مثال در بدنه داخلی یخچال، انواع فیلترهای آب و هوا، ظروف پلاستیکی و غیره دارند. هدف از این تحقیق استفاده از قارچ فوزاریوم اگزیسپوروم و باکتری اشرشیا کلی برای تولید نانو ذرات نقره می باشد. مواد و روش ها: در این تحقیق به منظور بررسی خواص آنتی باکتریال کلوئیدهای نقره تولید شده به وسیله دو میکروارگانیسم از روش دیسک نفوذی استفاده گردید. برای بررسی اندازه و مورفولوژی نانو ذرات نقره حاصل، از میکروسکوپ الکترونی عبوری (TEM) استفاده شد.یافته ها: وجود نانو ذرات نقره در کلوئید حاصل با استفاده از طیف سنجی نور فرابنفش- مرئی به اثبات رسید. میانگین سایز نانو ذرات بدست آمده از قارچ فوزاریوم اگزیسپوروم کوچک تر از میانگین آن در باکتری اشرشیا کلی بود. نتیجه گیری: نتایج بدست آمده از این مطالعه نشان داد که خواص آنتی باکتریال سطوح پوشیده با کلوئید نانو ذرات نقره سنتز شده به کمک قارچ فوزاریوم اگزیسپوروم به دلیل کوچکتر بودن اندازه نانو ذرات نسبت به کلوئید حاصل از باکتری اشریشیاکلی مطلوب تر می باشد.}, keywords_fa = {نانو ذرات نقره، آنتی باکتریال، اشریشیا کلی، فوزاریوم اگزیسپوروم}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-179-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-179-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Heiat, Mihammad and Latifi, Ali Mohammad and Aghamollaei, Hossei}, title = {Using Novel Immobilization Engineering Technique to Increase the Efficiency of Antibody Immobilization on the Surface of Nylon and Nitrocellulose Supports, Utilized in Diagnostic Systems}, abstract ={  Aim and Background. Immobilization of biomolecules on the surface of different supports, so that it’s physicochemical properties to be maintained to Lead to an increase in process efficiency, is the most essential prerequisite for the design and manufacturing of biological sensors. Antibodies are the most efficient molecules for this purpose. This study was done aiming at increasing the efficiency of immobilization of antibody on nitrocellulose and nylon supports. Materials and Methods. In this study, different materials and polymer layers such as PEI, MAMEC were used to process (activation and blocking) the surface of nitrocellulose and nylon. Increasing the number of functional groups in nitrocellulose and creating new active groups on the surface of activated nylon, were the most important modifications on mentioned solid supports. After immobilization of antibody on above supports, the process efficiency was assayed and then was compared with control samples. Results. The results showed that the modifications caused increasing of antibody immobilization approximately 2, 3 fold on the nitrocellulose and nylon supports, respectively. Conclusion . this study demonstrated that depending on the kind of solid support, the type of processing may be different and also it is possible to change the physiochemical features of support like capillarity, flexibility, surface charge, etc which may affect the quality of immobilization negatively.}, Keywords = {Activation, Antibody, Blocking, Immobilization, Nitrocellulose, Nylon }, volume = {2}, Number = {6}, pages = {35-43}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بکارگیری تکنیکهای نوین مهندسی تثبیت جهت افزایش کارآمدی تثبیت آنتی بادی بر روی سطح بستر های نیترو سلولز و نایلون برای استفاده در سامانههای تشخیصی}, abstract_fa ={سابقه و هدف: تثبیت بیومولکول‌ها بر روی بسترهای مختلف به گونه‌ای که خاصیت آن حفظ گردد و بازدهی افزایش یابد اساسی‌ترین پیش‌نیاز برای طراحی و ساخت حسگرهای زیستی می‌باشد. آنتی‌بادی‌ها از دسته مهم‌ترین مولکول‌های کارا برای نیل به این منظور می‌باشد. این مطالعه با هدف افزایش کار آمدی تثبیت آنتی‌بادی بر روی بسترهای نیترو سلولز و نایلون انجام پذیرفت.مواد و روش‌ها: در این تحقیق جهت پردازش (فعال سازی و بلاکینگ) سطح بسترهای نیتروسلولز و نایلون از مواد و لایه‌های پلیمری  مختلف نظیر PEI و MAMEC استفاده گردید. افزایش تعداد گروه های عاملی در بستر نیتروسلولز و ایجاد گروه فعال جدید بر سطح نایلون از مهم‌ترین تغییرات انجام شده بر روی بسترها بودند. پس از تثبیت آنتی‌بادی بر روی بسترها، کارامدی فرایند مورد  سنجش قرار گرفت و با نمونه های کنترل مقایسه گردید.یافته‌ها: نتایج نشان داد که تغییرات اعمال شده روی سطح بسترها، باعث افزایش ظرفیت تقریبی 2 و 3 برابری تثبیت آنتی‌بادی به ترتیب بر روی بستر های نیتروسلولز و نایلون شده است. نتیجه گیری: بسته به نوع بستر نوع پردازش ممکن است متفاوت باشد، همچنین این امکان وجود دارد که خواص فیزیک و شیمیایی بستر نظیر خاصیت موئینگی، انعطاف‌پذیری، بارهای سطحی و غیره دچار تغییر شده و بر روی کیفیت تثبیت اثرات منفی بگذارد.}, keywords_fa = {آنتی بادی، بلاکینگ، تثبیت، فعال سازی، نایلون، نیتروسلولز}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-180-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-180-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {BakhshiKhaniki, Gholamreza and Mohammadi, Basir}, title = {Ecological Study of Some Species of the Genus Salsola (Chenopodiaceae) in Golestan Province}, abstract ={  Aim and Background. The genus Salsola is the largest genus in subfamily of Salsoloideae containing 100 species.  Materials and Methods. Some characteristics such as resistance to drought, saline, pests, diseased, grazing and having deep root system and different life forms make it suitable forage plant in arid lands. Different species of this genus are cultivated in salty lands where no other crops could give a good yield, or in areas where irrigation is possible only by salty water. Results. The main aim of this investigation is the ecology survey of some species of Salsola in Golestan province where, different species of Salsola are the main plants in the vegetation. Annual species are distributed in lowlands with maximum % 15 slopes. Conclusion. Habitats of three species, S. arbusculiformis, S. orientalis and S. tomentosa differ from the others in ecological condition where they grow in elevations (Max 1500 m) and pediment zone.}, Keywords = {Ecology, Chenopodiaceae, Salsola, Golestan Province}, volume = {2}, Number = {6}, pages = {45-52}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {مطالعه اکولوژی برخی از گونههای جنس سالسولا (کنوپودیاسه) در استان گلستان}, abstract_fa ={ سابقه و هدف: جنـس Salsola با داشـتن 100 گونه بزرگتـرین جنس در زیـر خانـواده Salsoloideae می باشد. برتری این جنس بر سایر جنس ها در این است که علاوه بر خشبی بودن، جزو گیاهان علوفه ای بوده و قدرت تولید بذر آن خوب و میزان تولید علوفه بالایی دارد. مواد و روش ها: شناسـایی گونـه ‌ های مختلف این جنس به خاطر نداشتن ویژگی های قابل تشخیص ساده، زیستگاه های خیلی متغیر، اختلافات مورفولوژیکی گیاهان جوان و گیاهان بالغ برای گیاه شناسان مشکل می باشد. وجود سیستم ریشه ای عمیق، فشار اسمزی بالا، کارایی بالا در استفاده آب و شکل های زیستی مختلف به عنوان یک گیاه مهم علوفه‏ای در زمین های خشک محسوب شده و برای کاشت در زمین های شور جایی که محصولات دیگر تولید خوبی ندارند و یا در نواحی که آبیاری فقط با آب شور امکان دارد حائز اهمیت است. یافته ها : در این تحقیق اکولوژی بعضی از گونه های جنس سالسولا در استان گلستان مورد بررسی قرار گرفته است گونه های مختلف این جنس یکی از عناصر اصلی پوشش گیاهی مراتع منطقه بوده که رویشگاه گونه های مختلف آن از اراضی پست مسطح تا کوه های پوشیده از خاک های شنی متفاوت است. گونه‏های یک ساله در اراضی پست با شیب حداکثر 15 % پراکنده شده اند. نتیجه گیری: رویشگاه سه گونه S . tomentosa S . arbusculiformis , S . orientalis , از نظر شرایط اکولوژیکی با دیگر گونه متفاوت بوده و در ارتفاعات و اراضی کوهستانی و کوهپایه‏ای می رویند.}, keywords_fa = {اکولوژی، کنوپودیاسه، سالسولا، استان گلستان }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-181-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-181-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {ZakerBostanabad, Saeed and Semsar, Yalda and Dydari, Ti}, title = {Comparison of Methods for Detection of Listeria Monocytogenes in Food Samples Contaminated}, abstract ={Aims and Background. Listeria monocytogenes bacteremia in pregnant women with various complications in the fetus, including Be aborted. However, Listeriosis can detect and isolate the bacteria to be cultured,due to being time consuming, low efficiency due to low number of bacteria and other bacteria problem in the differential diagnosis in many laboratories using this method typically does not. Also becomes less important as the methods of immunology, molecular detection of bacteria in samples from the patient or suspected food has high specificity. In this study the molecular method in comparison with other methods used to differentiate bacteria. Material and Method. In this study, 152 cases of suspected laboratory routinely referred to Ma ssoud laboratory, who had consumed contaminated food samples were collected, and of antibodies to Listeria monocytogenes Were studied by IFA Method. The deadly samples using molecular methods of DNA extraction and PCR method were evaluated that all of the standard molecular techniques were used. Results. 47% of all samples (71) in a dilution of 1/100 and 1/400 was positive in the immunology method. The bacterial cultures were positive in 41 cases, but the molecular method of total samples of suspected cases, 53 were positive. Conclusion. Due to the rise of virulent Listeria infection and also in connection with abortion, the importance of contamination by bacteria important in the foods and recently most doctors recommend screening pregnant women in terms of Listeria contamination. According to WHO estimates are not reliable methods antiserum and molecular methods and culture is very important, especially in screening pregnant women is high specify molecular methods.}, Keywords = {Listeria monocytogenes, Contaminated Food Samples }, volume = {2}, Number = {6}, pages = {53-57}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی و مقایسه روش های تشخیص لیستریا مونوسیتوژن در نمونه های مواد غذایی آلوده}, abstract_fa ={سابقه و هدف: باکتریمی با لیستریا منوسیتوژن در زنان حامله می تواند به عوارض مختلف در جنین از جمله سقط منجر شود. گر چه تشخیص لیستریوز می تواند با کشت نمونه و جدا سازی باکتری صورت گیرد ولی به دلیل وقت گیر بودن، راندمان پایین ناشی از تعداد کم باکتری و مشکل در تشخیص افتراقی از سایر باکتری ها در بسیاری از آزمایشگاه ها از این روش به طور معمول استفاده نمی شود و هم چنین روش های ایمونولوژی نیز کمتر اهمیت پیدامی کند، لذا تشخیص مولکولی باکتری در نمونه های بیمار و یا مواد غذایی مشکوک از اختصاصیت بالایی برخوردار است. در این مطالعه روش مولکولی در مقایسه با روش های دیگر در افتراق باکتری بکار رفته است. مواد و روش ها: در این مطالعه، 152 مورد مشکوک به لیستریوز مراجعه کننده به آزمایشگاه مسعود که از مواد غذایی آلوده مصرف کرده بودند نمونه اخذ شد و از نظر آنتی بادی های ضد لیستریا مونوسیتوژن به روش IFA تحت بررسی قرار گرفتند. در ضمن نمونه ها با استفاده ازکشت و روش مولکولی بعد از استخراج DNA با روش PCR مورد ارزیابی قرار گرفتند که تمام روش های مولکولی مورد استفاده از روش استاندارد بوده است.  یافته ها: از تمام نمونه ها 47 % (71) آن ها در رقت 100/ 1 و 400/ 1 در روش ایمونولوژی مثبت گزارش شد. در روش کشت باکتری 41 مورد مثبت شدند ولیکن در روش مولکولی از کل نمونه های مشکوک به تعداد 53 مورد مثبت گزارش گردید.  نتیجه گیری: با توجه به افزایش آمار بیماری زایی لیستریا و هم چنین در ارتباط بودن عفونت با سقط جنین، اهمیت بررسی آلودگی در منابع غذایی توسط باکتری اهمیت بالایی داشته و اخیرا اغلب پزشکان غربالگری زنان باردار را از نظر آلودگی به لیستریا توصیه می نمایند. بر اساس برآورد های WHO استفاده از روش آنتی سرم قابل اطمینان نبوده و روش کشت و مولکولی از اهمیت بالایی برخوردار است، بالاخص در خصوص غربالگری زنان باردار روش مولکولی از اختصاصیت بالایی برخوردار می باشد.}, keywords_fa = {لیستریا منوسیتوژن، مواد غذایی آلوده }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-182-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-182-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {AdibzadehSereshki, Nasim and Aminzade, Saeed and Jamili, Shahla and GhavamMostafavi, Pargol}, title = {Structural Comparison between Collagen Isolated from Sea Cucumber Holothuria Parva and Calf Skin Collagen Type I}, abstract ={Aim and Background. Collagen has a wide range of applications in biomedical, pharmaceutical, cosmetic, and food industries. Recently, isolation of collagen from marine species has been investiga ted. Collagen from cow has a risk for contamination from bovine spongiform encephalopathy (BSE ), transmissible spongiform encephalopathy (TSE ). The aim of this investigation is the extraction of collagen from body wall of sea cucumber (Holothuria parva) and comparison with collagen Type I. Material and Methods. Pepsin-solubilized collagen (PSC) is extracted from body wall of sea cucumbers (Holothuria parva) and characterized by SDS-PAGE , DSC, FT-IR. Results. SDS-PAGE shows that the major component consists of three α1 chains of approximately 130 kDa that is similar to calf skin collagen Type I with the same weight but different in α1 chains (α1)2 α2 . The Tm of PSC is 46.940C therefore the thermal stability is lower than collagen Type I. Two peaks of transmission bands is determined by FT-IR including amide A (3420 cm-1) and amide I (1638 cm-1). Conclusion. Collagen isolated from the sea cucumber determines Type I and the thermal stability shows that it can be used as an alternative to mammalian collagen in the food and pharmaceutical industries. The thermal stability of PSC shows that it has lower content of Proline and Hydroxyproline in comparison with collagen Type I.  }, Keywords = {Sea cucumber, Holothuria parva, SDS-PAGE, DSC, FT-IR, Pepsin-Solubilized collagen }, volume = {2}, Number = {6}, pages = {59-65}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {مقایسه ساختاری کلاژن استخراج شده از دیواره خیار دریایی parva Holothuria با کلاژن نوع I مهره داران}, abstract_fa ={سابقه و هدف: کلاژن دارای کاربرد های فراوانی در زمینه داروسازی و پزشکی، تهیه محصولات بهداشتی و آرایشی و صنایع غذایی می باشد. در سال های اخیر توجه زیادی به جداسازی کلاژن از موجودات دریایی شده است که علت آن عدم محدودیت استفاده از آن در رژیم غذایی و عدم ابتلا به بیماری های TSE1 و2 BSE می باشد. هدف از انجام این تحقیق استخراج کلاژن از دیواره خیار دریایی    Holothuria parva و مقایسه ساختاری آن با کلاژن نوع I مهره داران می باشد.مواد و روش ها: در این تحقیق جهت مقایسه ساختاری کلاژن حل شده با پپسین (PSC3) استخراج شده از دیواره خیار دریایی جنس Holothuria parva و کلاژن نوع I مهره داران (Type I Calf skin) از آزمون های سدیم دو دسیل سولفات پلی آکریل آمید ژل الکتروفورز 4(SDS-PAGE)، طیف بینی مادون قرمز تبدیل فوریه (5 FT-IR) و کالری متری روبشی دیفرانسیلی6(DSC ) استفاده شده است.یافته ها: الگوی پروتئینی SDS-PAGE کلاژن حل شده با پپسین استخراج شده از دیواره خیار دریایی و نمونه کلاژن نوع I مهره داران نشان می دهد که قسمت عمده در هر دو کلاژن از زنجیره 1 α با وزن تقریبی kDa 130 و مقدار جزئی β وγ تشکیل شده اند با این تفاوت که درPSC استخراج شده از خیار دریایی به صورت ساختار 3(α1) و در کلاژن نوع I مهره داران به صورت 2α2 (α1) می باشد. طیف FT-IR کلاژن حل شده با پپسین دارای یک باند پهن در ناحیه 1-cm 3420  و باند تیز در ناحیه1-cm 11638 می باشد که شباهت زیادی به طیف FT-IR کلاژن نوع I مهره داران دارد. از آزمون DSC ماکزیمم دمای انتقالیPSC، 94/46 درجه سانتی گراد تعیین گردید که نشان دهنده پایداری حرارتی کمتر نسبت به کلاژن نوع I مهره داران (62 درجه سانتی گراد) می باشد. نتیجه گیری: کلاژن استخراج شده از خیار دریایی  Holothuria parva نوع I تعیین شده و با توجه به پایداری حرارتی مناسب می تواند در مصارف صنعتی مورد استفاده قرار گیرد. همچنین پایین بودن ماکزیمم دمای انتقالی کلاژن استخراج شده نشان دهنده محتوی کمتر ایمنو اسیدهای پرولین و هیدروکسی پرولین نسبت به کلاژن نوع I مهره داران می باشد.کلمات کلیدی: Holothuria parva  خیار دریایی،SDS-PAGE ،DSC ،FT-IR، کلاژن حل شده با پپسین (PSC)}, keywords_fa = { Holothuria Parva خیار دریایی،SDS-PAGE ،DSC ،FT-IR، کلاژن حل شده با پپسین (PSC)}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-183-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-183-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Moeini, Zahra and TahmasebiFard, Zahra and Abdirad, Afshin and SeyedAliroteh, Seyedeh Maryam and Sarmadi, Soheil}, title = {Investigation of Correlation Between Human Papillomavirus and Endometriosis Lesion}, abstract ={Aim and Background. Endometriosis is a common gynecological disorder that is poorly understood. It is characterized by the presence of uterine endometrial tissue outside the uterine cavity and is mainly associated with severe pelvic pain and/or infertility. We hypothesized that viral infection endometrium (especially HPV) may increase the capacity for the invasiveness of basal layer especially along with retrograde menstruation in the intra abdominal or the myometrial region. Material and Methods. In this study, 46 paraffin blocks of endometriosis and 50 paraffin blocks of normal endometrium as a control were selected. After extracting DNA, all samples were examined for the presence of beta globin gene and suitable samples searched for the presence of L1 HPV-Common by polymerase chain reaction (PCR). Results. HPV was detected by PCR in 11 of 43 (58/25%) cases of endometriosis tissue samples and 7 of 43 (27/16%), endometrial samples. A total of 18 out of 86 samples (93/20) were positive by using general primers of HPV. Conclusion. HPV infection in endometriosis lesions as well as control tissues supports the spread of the virus or HPV-infected endometrial cells via retrograde menstruation. Due to an association of HPV in carcinomas, we propose that persistent HPV infection of endometriosis lesions could contribute to malignant progression.}, Keywords = {Endometriosis, Human Papillomavirus, Polymerase Chain Reaction}, volume = {2}, Number = {6}, pages = {67-73}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی ارتباط بین پاپیلوماویروس انسانی و ضایعات اندومتریوزیس}, abstract_fa ={سابقه و هدف: اندومتریوزیس یک اختلال ژنیکولوژی شایع است که اطلاعات کمی در موردش وجود دارد. این بیماری با وجود بافت اندومتریال رحمی، در فضای بیرون رحمی مشخص می ‌ شود و عمدتاً با درد شدید لگن و یا نازایی همراه ست. ما فرض کردیم که عفونت های ویروسی آندومتر نظیر Human Papillomavirus ) HPV )، می ‌ توانند توانایی تهاجم لایه بازال را خصوصاً همراه با بدرون برگشتگی قاعدگی بداخل شکم یا درون عضلات رحمی افزایش دهند. مواد و روش ها: در این تحقیق 46 بلوک پارافینی اندومتریوزیس و50 بلوک پارافینی نرمال اندومتر به عنوان شاهد انتخاب شدند. پس از استخراج DNA ، همه نمونه ‌ ها برای حضور ژن بتاگلوبین بررسی شده و نمونه ‌ های مناسب برای حضور ژن L 1 HPV- Common‌ با ( PCR ( Polymerase Chain Reaction جستجو شدند. یافته ها: HPV بوسیله PCR در 11 مورد از 43 (58/25 % ) نمونه بافت اندومتریوزیس و 7 مورد از 43 (27/16 % ) نمونه بافت اندومتر شناسایی شد. در مجموع از 86 نمونه، 18 مورد (93/20 % ) با مارکرهای عمومی HPV مثبت بودند. نتیجه گیری: عفونت HPV در ضایعات اندومتریوزیس مشابه بافت های کنترلی بوده و از گسترش ویروس بوسیله سلول های اندومتر آلوده به HPV از طریق بدرون برگشتگی قاعدگی حمایت می ‌ کند. بخاطر ارتباط HPV با سرطان ها، پایداری عفونت HPV در ضایعات اندومتریوزیس نیز می ‌ تواند به پیشرفت بدخیمی کمک نماید.}, keywords_fa = {ندومتریوزیس، پاپیلوماویروس انسانی ( HPV ) ‌ ، واکنش زنجیره ای پلیمراز ( PCR ) }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-184-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-184-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Gholizade, Fatemeh}, title = {Effects of Salt Stress in Germination Stage in Rice Genotypes (Oryza sativa L.)}, abstract ={Aim and Background. Germination stage is an important growth plant stage that is often affected by environmental stress including water and salinity stress. The aim of this study was to investigate the effects of Sodium Chloride Salinity on Seed Germination of Rice and found to have more salt-tolerant cultivars.  Materials and Methods. In order to study germination of three rice varieties named Gharib, Musa tarom and Abji buji at different levels of salinity. The experiment was carried out based on completely randomized design with four replications. Salt treatments were controlled in 0, 4, 8 and 12 ds/m-1. Results. The results of data analysis showed that salt effect on studied varieties and interaction of varieties × salt on the studied characters were significant in %1 level. In this research some characters including rate and percentage of germination, gemule length, and radical length were studied. With increasing salt all evaluated characters decreased. Conclusion. Statistical analysis of data showed significant difference in rice genotypes. With increasing salt all evaluated characters significantly decreased.}, Keywords = {Rice , Salt Stress , NaCl , Germination}, volume = {2}, Number = {6}, pages = {75-81}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی اثر تنش شوری ژنوتیپ های برنج در مرحله جوانه زنی(Oryza sativa L.)}, abstract_fa ={سابقه و هدف: مرحله جوانه زنی گیاهان یکی از مراحل مهم در طول دوره رشدی آن ها است که اغلب تحت تاثیر تنش های محیطی به ویژه شوری قرار می گیرد. لذا هدف از این مطالعه بررسی اثرات شوری کلرید سدیم بر جوانه زنی ارقام بومی برنج و شناسایی مقاوم ترین رقم نسبت به شوری می باشد.مواد و روش ها: به منظور بررسی جوانه زنی سه رقم برنج به نام های غریب، موسی طارم و ابجی بوجی در سطوح مختلف شوری آزمایشی در قالب طرح پایه بلوک های کامل تصادفی با 4 تکرار به اجرا در آمد. تیمارهای شوری (0، 4، 8 و 12) دسی زیمنس بر متر بودند. از کلرید سدیم برای ایجاد تنش شوری استفاده گردید. یافته ها: اختلاف بین ژنوتیپ ها برای کلیه صفات معنی دار بود. تجزیه واریانس داده ها نشان داد که اثرات شوری بر جوانه زنی، رشد ریشه چه و ساقه چه در ارقام مختلف مورد مطالعه برنج و نیز اثر متقابل آن ها در سطح 1% معنی دار بود. با افزایش شوری درصد و سرعت جوانه زنی کاهش یافت.نتیجه گیری: اختلاف موجود بین ارقام در تمامی صفات از نظر آماری معنی دار بود. همچنین با افزایش تنش شوری طول ریشه چه، ساقه چه، درصد و سرعت جوانه زنی کاهش معنی داری پیدا کرد.}, keywords_fa = {برنج، تنش شوری، کلرید سدیم، جوانه زنی}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-185-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-185-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Ladan, Seyed Amir behtash and Mohammadiazhar, abas and TajabadiEbrahimi, Maryam and HeydariNasrabadi, Mitr}, title = {Titanium Nanoparticles Biosynthesis by Lactobacillus Isolated from Iran’s Traditional Dairy Products}, abstract ={Aim and Background. Biosynthesis of nanoparticles using microorganisms is a noticeable method due to reduced use of energy and expenses as well as its environmental adaptation properties. It attracts many researchers as bio-method-based producing procedures were brought forth for discussion. Use of microorganisms in nanotechnology is one of the most important aspects of the discussion. Material and Methods. Native Lactobacillus of Iran derived from some local dairy products was used in this study and exposed to Tio2 solution. Samples were delivered to the relevant labs to perform the experiments 72 hours after incubation. The Titanium nanoparticles were characterized by Scanning Electron Microscopy and Atomic Force Microscopy .Analysis of Titanium Nanoparticles with XRD was prepared. Results: Nanoparticles Formation of Titanium in some Lactobacillus Plantarum strains was observed during the study. Conclusion. After some molecular mechanism deliberations, biosynthesis of nanoparticles using microorganisms and metal reduction via bacteria interpreted as a defensive process may be due to superoxide dismutase lack in some Lactobacillus Plantarum strains.}, Keywords = {Biosynthesis, Titanium nanoparticles, Lactobacillus, Metal Reduction, TiO2 }, volume = {2}, Number = {6}, pages = {83-90}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بیوسنتز نانو ذرات تیتانیوم توسط لاکتوباسیلوس پلانتاروم های بومی ایران}, abstract_fa ={سابقه و هدف: بیوسنتز نانو ذرات با روش های زیستی توسط میکروارگانیسم ها، بدلیل سازگاری بالا با محیط زیست و کاهش مصرف انرژی و هزینه ها از جایگاه ویژه ای برخوردار هستند. زمانی که روش های تولید بر اساس فناوری های زیستی مطرح شدند، نظر بسیاری از محققین را بخود جلب کردند. یکی از مهم ترین ابعاد این بحث استفاده از میکروارگانیسم ها در فناوری نانو است. مواد و روش ها: سویه های مختلفی از لاکتوباسیل های جدا شده از محصولات لبنی بومی ایران تحت شرایط کنترل شده، در معرض تیتانیوم دی اکساید قرار گرفته و نتایج با میکروسکوپ های الکترونی SEM و AFM و همچنین پراش پرتو ایکس (XRD) بررسی شدند.یافته ها: در این مطالعه، شاهد شکل گیری نانوذرات تیتانیوم در ابعاد مختلف توسط برخی لاکتوباسیلوس پلانتاروم های جدا شده از محصولات لبنی بومی ایران هستیم.نتیجه گیری: پس از بررسی و مطالعه سازوکار مولکولی بیوسنتز نانو ذرات توسط باکتری ها و احیای اکسیدهای فلزی توسط آنان، تحت عنوان فرایندی دفاعی که احتمالا به دلیل فقدان سوپراکسید دیسموتاز در برخی از این سویه ها است، تفصیر می گردد.}, keywords_fa = {بیوسنتز، نانوذرات تیتانیوم، لاکتوباسیلوس پلانتاروم، کاهش فلزی، تیتانیوم دی اکسید}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-186-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-186-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Fereidoni, Masoud and Hosseini, Shiri}, title = {Astrocyte Neurobiology}, abstract ={Astrocytes are special glial cells by a population of about 10 times more than the population of the neuron within the central nervous system (CNS) as they occupy almost the 25% to 50% of the brain volume. They are apparently stellar in shape and have many processes enabling them to produce non synaptic contacts with neural cells. Using perivascular feet they are covering near to 85% of CNS capillaries external surface. Astrocytes are arranged like building blocks all over the CNS and connected to each other by Gap junctions producing an electrical syncytiym. In the previous knowledge of medicine, within the CNS and between the glial cells, microglia were considered as more important player than the Astrocytes, as Astrocytes were seen merely as guard cells and filler of empty spaces in the CNS. However studies at the last 20 years were clarified that the Astrocytes are important not only for physical support and neural nourishment but also for neural system development and synapse formation, neural tissues blood current and energy regulation, neurotransmitter adjustment and even immunological responses within the CNS. The present article is to review and point on the different roles of Astrocytes within the CNS.}, Keywords = {Astrocyts, CNS, Inflammation, Neural development, Neurotransmitters.}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {9-26}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {نوروبیولوژی آستروسیت ها}, abstract_fa ={آستروسیت ها سلول های گلیال ویژه ای هستند که فراوانی آن‌ها تقریباً ده برابر جمعیت نورون های سیستم اعصاب مرکزی است طوری که در حدود 25 تا 50 درصد از حجم مغز را اشغال کرده اند. آن ها از نظر ظاهری، ستاره ای شکل بوده و دارای زوائد متعددی هستند که با سطح نورون ها اتصال غیر سیناپسی دارند. این سلول ها دارای پاهای دور عروقی (Perivascular feet) هستند که حدود 85% از سطح مویرگ های موجود در سیستم عصبی مرکزی (CNS) را می پوشانند. آستروسیت ها مانند آجرهای بهم پیوسته ای در سرتاسر CNS منظم شده اند و با اتصالات منفذ دار به یکدیگر متصلند و یک سن سیتیوم الکتریکی را ایجاد کرده اند. در دانش پزشکی گذشته تنها میکروگلیا ها را سلول-های حساس و مهم CNS می دانستند و آستروسیتها را سلول هایی کم اهمیت، نگهبان و پرکننده فضاهای خالی در CNS تلقی می کردند. اما مطالعات در 20 سال اخیر نشان داد که آستروسیت ها نه فقط در حمایت فیزیکی و تغذیه نورون ها، بلکه در تکوین عصبی و شکل گیری سیناپس ها، تنظیم جریان خون بافت عصبی و انرژی، تنظیم میانجی های عصبی و حتی پاسخ های ایمنی در سیستم عصبی دارای اهمیت فراوان هستند. این مقاله نقش های مختلف آستروسیت در سیستم عصبی را مرور نموده و مورد بررسی قرار می-دهد.}, keywords_fa = {آستروسیت، سیستم عصبی مرکزی، التهاب، تکوین عصبی، میانجی های عصبی.}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-204-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-204-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Ehtesham, Somayeh Ehtesham and Asghari, S. Mohsen and sadremomtaz, Afsaneh}, title = {Cloning, Gene Expression, Purification and Characterization of Elastase from Pseudomonas Aeruginosa}, abstract ={Aim and Background. Pseudomonas Aeruginosa Elastase is an important enzyme in basic studies on Zn-metalloproteases and is also considered as a virulence factor of the bacterium. In the present study, the gene encoding Pseudomonas aeruginosa elastase (PAE) was extracted and clone, Following expression and purification, its biochemical properties including optimal temperature and pH, and also enzymatic activity in the presence of glycerol, dimethylformamide (DMF), methanol, ethanol, ethylene glycol and isopropanol were investigated. Materials and Methods. Bacterial strain was verified by biochemical tests including citrate, SIM, MR-VP and TSI. Genomic DNA was extracted using gene extraction kit and elastase gene was amplified by PCR using two specific primers. Cloning was carried out within pET21a (+) vector with HindIII and NdeI restriction sites and transformation accomplished by chemical method. The cells were cultured under the given optimized conditions, in LB medium with 1mM IPTG. Results. Following the strain verification by biochemical tests, genomic DNA was extracted and PAE encoding gene was isolated using specific primers. Elastase gene, which is encoded as pre-proelastase, was cloned within pET21 a (+) vector and transformed into E.coli strain BL21. Nucleotide sequence analysis shows an open reading frame (ORF) of 1497 nucleotides corresponding to 497 amino acid residues. Following the induction by IPTG, the active enzyme was detected in the soluble fraction. Consequently, the enzyme was purified using affinity chromatography. Enzyme properties such as optimal temperature and pH, irreversible thermo inactivation and organic solvent activity were investigated. Our results clearly indicate that the above mentioned enzyme possesses a noticeable activity and stability within organic media. Conclusion. Elastase from Pseudomonas aeruginosa strain PTCC1430 shows only one amino acid substitution in the signal sequence in comparison with that of strain PAO1 whose crystal structure is solved. Biochemical properties reveal that elastase is a highly stable enzyme in organic solvents.}, Keywords = {Pseudomonas Aeruginosa Elastase، cloning، Expression, Purification, Characterization.}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {27-34}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {کلونینگ ، بیان ژن، خالص سازی و تعیین خصوصیات آنزیم الاستاز حاصل از باکتری سودوموناس آئروجینوزا}, abstract_fa ={سابقه و هدف: الاستاز حاصل از سودوموناس آئروجینوزا یک آنزیم مهم در زمینه مطالعات بنیادی بر روی Zn-متالوپروتئازها و نیز بعنوان فاکتور ویرولانس این باکتری مطرح است. در این مطالعه ژن مربوط به آنزیم الاستاز از سودوموناس آئروجینوزا (PAE) استخراج و کلون شده و پس از بیان و تخلیص، خصوصیات بیوشیمیایی آن شامل دما و pH بهینه و نیز فعالیت در حور حلالهای آلی گلیسرول، دی متیل فرمامید (DMF)، متانول، اتانول، اتیلن گلایکول و ایزوپروپانول مورد مطالعه قرار گرفت. مواد و روشها: تایید گونه باکتری با تستهای بیوشیمیایی شامل سیترات، SIM، MR-VP و TSI انجام شد. DNA ژنومی توسط کیت استخراج و با پرایمر اختصاصی بوسیله PCR ژن الاستاز بدست آمد. کلونینگ در وکتور pET21a(+) با مکان های برش HindIII و NdeI صورت گرفت. ترانسفورماسیون به روش شیمیایی انجام شد. سپس سلول ها در محیط LB تحت القای IPTG 1mM قرار گرفته و زمان و شرایط تولید بهینه گردید. یافته ها: بدنبال تایید گونه باکتریایی توسط تستهای بیوشیمیایی، DNA ژنومی استخراج شد و سپس ژن PAE به کمک پرایمر اختصاصی توسط PCR جدا شد. ژن الاستاز که بصورت پری پرو الاستاز کد می شود، درون وکتور) pET21a(+ کلون و در باکتری E. coli سویه BL21 ترانسفورم گردید. آنالیز سکانس نوکلئوتیدی ژن یک چارچوب خوانش (ORF) دارای 1497 جفت باز که 497 آمینواسید را کد می کند نشان داد. بدنبال القاء به کمک IPTG آنزیم فعال در درون سلول یافت شد. سپس آنزیم توسط کروماتوگرافی تمایلی تخلیص گردید. بررسی خصوصیات آنزیم از قبیل دمای بهینه، pH بهینه و غیر فعال سازی حرارتی برگشت ناپذیرانجام شد و همچنین فعالیت آنزیم در حضور حلالهای آلی بررسی گردید و بخوبی نشان داده شد که آنزیم مذکور از مقاومت و فعالیت بسیار بالایی در حلالهای آلی برخوردار است. نتیجه گیری:آنزیم الاستاز سویه PTCC 1430 در مقایسه با آنزیم سویه PAO1، که ساختار کریستالی آن تعیین شده، تنها یک تغییر در ناحیه سیگنال را نشان می دهد. خصوصیات بیوشیمیایی نشان می دهد که الاستاز یک آنزیم با پایداری زیاد در حلال های آلی است.}, keywords_fa = {سودوموناس آئروجینوزا، کلونینگ، بیان، خالص سازی، تعیین خصوصیات}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-206-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-206-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {TabatabaeiPanah, Akram Sadat and AkbarzadehNajar, Reza and Ghaderian, Sayyed Mohammad Hossei}, title = {Expression of Cardiomyocytes Alpha-Cardiac Actin and FLK1 (Vegfr-2/KDR) Genes in Human Embryonic Stem Cells}, abstract ={Aim and Background. Cardiomyocytes derived from human embryonic stem cells (hESCs) could be useful in restoring heart function after myocardial infarction or in heart failure. The hESCs can differentiate in vitro into spontaneously contracting cardiomyocytes and produce a model to investigate the early developmental stages of this system. After removing of cells from their feeder layer, hESCs create embryoid bodies (EB). Plating EB results in developing areas of beating cells. Materials and Methods. The expression pattern of Alpha-cardiac actin and FLK1 (Vegfr-2/KDR) were analyzed by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). Results. There was an enhanced expression of as Alpha-cardiac actin from day 10 in EB in suspension. The FLK1 (Vegfr-2/KDR) gene expression was first specified in 4-day-old EB and was significantly increased by day 10 & 14. Conclusion. hESCs might be useful as an effective model system to understand the developmental processes and functioning of the human heart.}, Keywords = {Cardiomyocytes, Embryoid Bodies, Gene Expression, Human Embryonic Stem}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {35-40}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی مولکولی ژن های (Alpha-cardiac actin ) و ( FLK1 (Vegfr-2/KDRمشتق شده از کاردیومیست های سلول های بنیادی جنینی}, abstract_fa ={ سابقه وهدف.در طی جنین زایی ابتدائی، سیستم قلبی- عروقی یکی از اولین سیستم هایی است که تشکیل می شود. سلول های بنیادی جنینی انسانی (hESC) مدلی را به وجود می آورد که می توان از طریق آن مراحل تکاملی این سیستم را بررسی نمود. زمانیکه این سلول ها از لایه مغذی خود جدا می شوند، hESC ها اجسام جنینی (EB) را به وجود می آورند که پس از کشت، نواحی ای از سلول های ضربان دار در 5/21% از EB ایجاد می شوند. مواد و روش ها.الگوی بیان ژن های اختصاصی کاردیومیوسیت ها به نام Alpha-cardiac actin و FLK1 (Vegfr-2/KDR) در EB انسانی (hEB) از طریق واکنش زنجیره ای پلیمراز- رونویسی معکوس (RT-PCR) مورد بررسی قرار گرفت. یافته ها.نتایج این مطالعه نشان داد که ژن Alpha-cardiac actin در EB 10 روزه،  بیشترین بیان را داشته است. همچنین بررسی های این تحقیق مشخص کرد که بیان ژن FLK1 (Vegfr-2/KDR) در EB 10 و 14 روزه، افزایش یافته است. نتیجه گیری.سلول های بنیادی جنینی انسانی ابزاری مفید جهت بررسی جنین زایی به طور کلی و تکامل سیستم قلبی- عروقی به طور خاص هستند.  }, keywords_fa = {کاردیومیست ها، اجسام جنینی، بیان ژن، سلول های بنیادی جنینی }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-207-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-207-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Aryapour, Elham and Shariati, Parvin and Tabandeh, Fatemeh and Yakhchali, Bagher}, title = {Investigation of the Amylolytic Enzyme Profile of the Bacterium Bacillus amyloliquefaciens BEH 111, and Determination of its α-Amylase Enzyme Characteristics}, abstract ={Aims and background. Amylases are one of the major industrial enzymes that occupy 25 % of the world enzyme market. These enzymes are used in many different areas, such as paper, textiles, pharmaceutical, food, starch saccharafication and processing industries. Much research has been carried out regarding application of amylolytic enzymes produced by the genus Bacillus, to the production of glucose and beverages, food and detergent industries. Because of the extensive applicability of amylolytic enzymes, research in relation to identification of these enzymes and their characteristic is continuously being carried out. Hence, the aim of this research was to investigate the amylolytic enzyme profile of a native Bacillus strain, and determine its enzyme characteristics. Materials and Methods. In this study, the enzymatic profile of the bacterium, Bacillus amyloliquefaciens BEH 111, was determined by using the SDS-PAGE, zymogram and TLC methods. Zymography and TLC were used to identify the amylolytic enzyme profile of the bacterium. The molecular weight of α-amylase was estimated by SDS-PAGE. The 3, 5-Dinitrosalisyclic acid (DNS) indicator was used to examine α-amylase activity, quantitatively. Investigation of enzyme characteristics and determination of maximal enzyme activity was carried by the DNS method, at different temperatures, pH values, substrate concentrations and time periods. Results. The molecular weight of α-amylase was estimated to be 55 kDa by SDS-PAGE. Investigation of enzyme characteristics showed that maximum α-amylase activity was achieved at a temperature of 50oC, pH 7, presence of 2% starch, during a 90 min time period. Enzyme activity obtained under these conditions was 8222 U/L. Conclusion. The high level of enzyme activity produced by B. amyloliquefaciens BEH 111 can thus be of commercial significance. Furthermore, by having activity at 50oC and above, makes it possible for this enzyme to be applied to processes that use high temperatures. The optimized pH levels of 6-7 that resulted in high enzyme activity can also allow the potential use of this enzyme in processes such as starch liquefaction and gelatinization.}, Keywords = {Bacillus Amyloliquefaciens BEH 111, α-Amylase, Thin Layer Chromatography, Dintrosalicyclic Acid}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {41-48}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی پروفیل آنزیمی باکتری باسیلوس آمیلولیکوئیفاسینس BEH 111 و تعیین ویژگی‌های آنزیم آلفا-آمیلاز تولید شده بوسیله این باکتری}, abstract_fa ={سابقه و هدف. آمیلازها، یکی از آنزیم های عمده صنعتی هستند که حدود 25% از بازار جهانی آنزیم ها را به خود اختصاص می دهند. این آنزیم ها در صنایع مختلف مثل نساجی، کاغذ سازی، داروسازی و صنایع غذایی مانند شیرین سازی و فرآوری نشاسته، استفاده می شوند. تحقیقات بسیاری در ارتباط با کاربرد آنزیم های آمیلولیتیک تولید شده توسط اعضاء جنس باسیلوس، در زمینه های مهم تولید قند، آبجو، صنایع غذایی، شوینده ها انجام شده است. گستردگی کاربرد آنزیم های آمیلولیتیک ، موجب می شود که تحقیقات برای مشخص شدن ویژگی های آنزیم ها ادامه داشته باشد. به همین دلیل، در این پژوهش، بررسی روی پروفیل آنزیمی آمیلولیتیک باکتری بومی و تعیین ویژگی های آن انجام شد. مواد و روش ها. در این مطالعه، پروفیل آنزیمی باکتری باسیلوس آمیلولیکوئیفاسینس BEH 111، با استفاده از روش های، SDS PAGE، زایموگرام و TLCتعیین شد. وزن مولکولی آلفا-آمیلاز، با استفاده از روش SDS PAGE تخمین زده شد. جهت سنجش کمی فعالیت آنزیم α-آمیلاز، از معرف دی نیتروسالیسیلیک اسید (DNS) استفاده شد. بررسی ویژگی های آنزیم جهت تایین بیشیته فعالیت آنزیم با روش DNS در شرایط مختلف دما pH غلضت سوبسترا (نشاسته) و زمان اجرا شد. یافته ها. وزن مولکولی آلفا-آمیلاز، با استفاده از روش SDS PAGE، 55 کیلودالتون تخمین زده شد. جهت سنجش کمی فعالیت آنزیم α-آمیلاز، از معرف دی نیتروسالیسیلیک اسید (DNS) استفاده شد. بررسی ویژگی های آنزیم نشان داد که بیشیته فعالیت این آنزیم در 50 درجه سانتیگراد، pH 7، در حضور غلظت 2% از نشاسته، طی 90 دقیقه است. میزان فعالیت آنزیم در این شرایطU/L 8222 می باشد. نتیجه گیری. این مقدار بالای فعالیت آنزیم تولید شده توسط باسیلوس آمیلولیکوئیفاسینس BEH 111، می تواند از نظر اقتصادی شایان توجه باشد. علاوه بر این توانایی فعالیت آن در دمای 50 درجه سانتیگراد و بالاتر، استفاده از آن را در فرآیندهایی که در دماهای بالا انجام می شوند، امکان پذیر می کند. شرایط pH بهینه 6 تا7 ، جهت فعالیت بالای این آنزیم، امکان استفاده در فرآیندهایی مثل مایع سازی و ژلاتینه کردن نشاسته را ایجاد می کند.}, keywords_fa = {باسیلوس آمیلولیکوئیفاسینسBEH 111، کروماتوگرافی لایه نازک، دی نیتروسالیسیلیک اسید،α-آمیلاز}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-208-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-208-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {ZakerBostanabad, Saeed and Heidarieh, Parvin and Sheikhi, Nasrin and Ghalami, Mostsfa and PourAzar, Shahin and Nojumi, Seyed Ali and Hashemi-Shahraki, abdolrazagh}, title = {Identification of Clinical Isolates of Mycobacteria Recovered from Iranian Patients by Phenotypic and Molecular Methods}, abstract ={Aim and Background. As mycobacterial species have different drug susceptibilities, precise identification is crucial for adoption of correct drug therapy and can ultimately influence patient outcome. Among various molecular methods, PCR-restriction fragment length polymorphism (PRA) based on hsp65 gene is preferred since it offers an easy, rapid, and inexpensive means of identifying pathogenic mycobacterial isolates to species level. A combination of phenotypic tests and PCR-restriction fragment length polymorphism (PRA) method targeting 441 bp hsp65 DNA used to find species diversity of Iranian clinical strains of mycobacteria. Materials and Methods. The test strains consisted of 270 clinical isolates of mycobacteria recovered from 2358 patients in two reference laboratories. A total of 207 isolates belong to M. tuberculosis were initially identified using conventional phenotypic techniques and specific PCR, based on detection of IS 6110. The isolates belonging to non tuberculosis mycobacteria (NTM) were subjected to further definitive identification using batteries of phenotypic tests and hsp65-PRA. Results. Out of 270 clinical strains, 207 isolates were found to be M. tuberculosis by phenotypic techniques and specific PCR based on detection of IS 6110. NTM strains (63 isolates) represented a variety of the species comprised of 12 M. simiae, 9 M. fortuitum, 5 M. gordonae , 5 M. abscessus, 5 M. kansasii and some rare species including 3 M. massilainase, 3 M. thermoresitbile, 2 M. senegalense type 2, 1 M. conceptionense type 1 or M. senegalense type 1, 1 M. phlei, 1 M. chelonae, 1 M. nonchromogenicum, 1 M. genavense, 1 M. montefiorense or M. triplex, 1 M. branderi, 1 M. novocastrense, 1 M. nebraskense, 1 M. lentiflavum and 1 M. avium. Conclusion. This study showed that hsp65-PRA technique offers a simple, rapid, and accurate method for the identification of NTM clinical isolates.}, Keywords = {Non-Tuberculous Mycobacteria, Identification, hsp65, PRA}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {49-56}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {تعیین هویت ایزوله‏ های بالینی مایکوباکتریوم جدا شده از بیماران ایرانی با استفاده از روش‏های فنوتیپیک و مولکولی}, abstract_fa ={سابقه و هدف. از آنجایی که گونه‏های مختلف مایکوباکتریوم دارای الگوی حساسیت دارویی متفاوتی می‏باشند، شناسایی دقیق برای به کار گیری درمان صحیح ضروری است و نهایتاً می تواند بر نتیجه درمان بیمار موثر باشد. در میان روش‏های مولکولی گوناگون استفاده از بررسی پلی مورفیسم حاصل از هضم آنزیمی محصول (PCR (PRAبر اساس ژن hsp65 به علت آسان بودن، سریع و ارزان بودن برای شناسایی ایزوله‏های پاتوژن مایکوباکتریومی تا سطح گونه ارجهیت دارد. تلفیقی از روش‏های فنوتیپیک و PRA بر اساس قطعه 441 جفت بازی از ژن hsp65 برای شناسایی تنوع گونه‏های ایزوله‏های بالینی مایکوباکتریومی مورد استفاده قرار گرفت. مواد و روش‏ها. سویه‏های مورد بررسی شامل 270 ایزوله‏های بالینی مایکوباکتریومی می‏شدند که از 2358 بیمار در دو آزمایشگاه مرجع جمع آوری شده بودند. تعداد 207 ایزوله متعلق به مایکوباکتریوم توبرکولوزیس به وسیله روش‏های فنوتیپیک رایج و PCR اختصاصی بر اساس شناسایی IS6110 تشخیص داده شدند. ایزوله‏های متعلق به مایکوباکتریوم‏های محیطی (NTM) با استفاده از تعدادی تست فنوتیپکی و PRA ژن hsp65 مورد شناسایی قرار گرفتند. یافته‏ها. از تعداد 270 سویه بالینی تعداد 207 ایزوله با استفاده از روش‏های فنوتیپکی و PCR اختصاصی بر اساس IS6110، به عنوان مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شناخته شدند. سویه‏های NTM (63 ایزوله) تنوعی از گونه‏های مختلف شامل 12 ایزوله M. simiae، 9 ایزوله M. fortuitum، 5 ایزوله M. gordonae، 5 ایزوله M. abscessus، 5 ایزوله M. kansasii و گونه‏های کمیاب شامل 3 ایزوله M. massilainase، 3 ایزوله M. thermoresitbile، 2 ایزوله M. senegalense type 2، 1 ایزوله M. conceptionense type 1 یا M. senegalense type 1، 1 ایزوله M. phlei، 1 ایزوله M. chelonae، 1 ایزوله M. nonchromogenicum، 1 ایزوله M. genavense،1 ایزوله M. montefiorense یا M. triplex،1 ایزوله M. branderi، 1 ایزوله M. novocastrense، 1 ایزوله M. nebraskense،1 ایزوله M. lentiflavumو 1 ایزوله M. avium شدند. نتیجه گیری. این مطالعه نشان داده که تکنیک hsp65-PRA یک روش ساده، سریع و دقیق برای شناسایی ایزوله‏های بالینی NTM می باشد.}, keywords_fa = {مایکوباکتریوم غیرسلی، تعیین هویت، hsp65،PRA }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-209-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-209-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {BakhshiKhaniki, Golamreza and Falaki, Malieh and LotfiGharaei, Alireza and Asri, Yones}, title = {The Anatomical Study of Leaf and Stem in Some Species of Atriplex L. and Chenopodium L. in Southern Khorasan Province}, abstract ={Aim and Background. The two genera Chenopodium and Atriplex contain 100 and 150 species, respectively both of which belong to Chenopodiaceae family. Due to morphological similarity, the recognition of species of these two genera is comparatively difficult, thus, the anatomical characters are considered in the southern Khorasan Province. Materials and Methods. At first, for studying anatomical structure of species, herbal samples were gathered from different areas of this province. Then, the method of manual cutting was used in laboratory, and for staining tissues and better distinguishing their organizing sections, the method of with green methyl and Carmen stain. After preparing slides, photo was provided for all sections (leaf, stem, petiole and epiderm) and anatomical characters were evaluated by Olympus microscope equipped with ruler. Results. The results show the characters of leaf and stem were distinctive in genus, but they couldn’t distinguish the species of each genus. In the species of C. botrys glandular trichomes, to be thick of its coticule in both surfaces, the form of petiole section and type of stomata is below surface in both level of epiderm, to distinguish it from other species of Chenopodium genus. Conclusions. The most differences have been seen in the petiole character signifying the recognition of the species.}, Keywords = {Anatomical characters, Chenopodiaceae, Chenopodium, Atriplex, Southern Khorasan Province.}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {57-74}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی آناتومیکی برگ و ساقه گونه هایی از جنسChenopodium L. و Atriplex L. در استان خراسان جنوبی}, abstract_fa ={سابقه و هدف. جنس Chenopodium دارای 100 گونه و جنس Atriplex دارای 150 گونه است که هر دو متعلق به تیره Chenopodiaceae می باشند. نظر به اینکه شناسایی گونه های این دو جنس به دلیل شباهت های ریختی نسبتا" مشکل است، صفات تشریحی گونه های این جنس در استان خراسان جنوبی مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روشها. برای مطالعه ساختار تشریحی گونه ‌ها ابتدا نمونه ‌های گیاهی از مناطق مختلف این استان جمع آوری شدند. سپس روش برش گیری دستی در آزمایشگاه انجام شد و برای رنگ آمیزی بافت ها از رنگ آمیزی سبز متیل و کارمن زاجی مورد استفاده قرار گرفت. پس از آنها لام و اسلاید از تمامی ‌مقاطع (برگ، ساقه، دمبرگ و اپیدرم) تهیه گردید و توسط میکروسکوپ تحقیقاتی Olympus اندازه گیری گردید. یافته ها.  نتایج نشان داد که صفات برگ و ساقه در حد جنس متمایز کننده بود ولی در بین گونه‌‌‌های هر یک از جنس‌‌ها این توانایی برای هرکدام به تنهائی نداشت. درگونه  L. C. botrys    کرک غده‌ای, ضخیم بودن کوتیکول آن در هر دو سطح, شکل مقطع رگبرگ و نوع روزنه که در هر دو سطح اپیدرم هم‌سطح می‌باشد آن را از سایر گونه‌های جنس Chenopodium متمایز کرد. نتیجه گیری. بیشترین تفاوت در صفات دمبرگ مشاهده شد که می تواند در شناسایی گونه ها اهمیت به سزائی داشته باشد.}, keywords_fa = {صفات تشریحی، خانواده اسفناج ، کنوپودیوم، آتریپلکس ، خراسان جنوبی}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-210-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-210-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Mobini, Soroor and TajabadiEbrahim, Maryam and Hashemi, Maryam and Jafari, Parvaneh}, title = {Isolation of Exopolysaccharides (the cell-bound EPS and the released EPS) Produced by Bacillus spp. Isolated from Arak Agricultures}, abstract ={Aim and Background. Exopolysaccharides are natural polymers that are produced by Lactic acid bacteria (LAB), Bifidobacteria and Bacillus. Due to their characteristic physical and chemical properties, EPS are widely used in food industry as viscosifying, stabilizing, gelling, or emulsifying agents. EPSs synthesized by Bacillus spp. have comparatively elevated viscosity and superior pseudoplastic properties there has been increasing interest about them in recent years. The aim of the present study was isolation of two Exopolysaccharides (the cell-bound EPS (EPS-b) and the released EPS (EPS-r)) produced by10 strains of Bacillus spp. isolated from agricultures and identification of a strain that produces the highest amount of EPS. Materials and Methods. 10 strains of Bacillus were overnight pre grown in MRS broth medium containing 2% (w/v) glucose at 37°C for 24-48h under aerobic conditions. The total amount of carbohydrate in the EPS was determined using the phenol/sulfuric acid method with glucose as the standard. Results. Among 10 Bacillus spp, two strains had the highest amount bound EPS (EPS-b), maximum amount reached 43 mg/l (B5) and minimum amount reached 0.2 mg/l (B1, B4, B8, B9, B100). All strains synthesized EPS-r that maximum amount reached 229 mg/l (B7) and minimum amount reached 45mg/l (B8). Growth kinetics of the chosen strain (B7) in liquid medium with the production of EPS was investigated. The results show that the maximum production of EPS of the chosen strain (B7) was obtained in exponential growth phase. The level of EPS was then quite stable. Conclusion. Results of this study showed that Iranian potential probiotic Bacillus species. have potential of EPS production.}, Keywords = {Exopolysaccharides, Lactic acid bacteria, Bacillus, Growth kinetics}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {75-82}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {غربال تولید اگزوپلی‌ساکاریدهای متصل به سلول و رها‌شده به محیط در باسیلوس‌های جداشده از مرغ‌داری‌های اراک}, abstract_fa ={سابقه و هدف. اگزوپلی‌ساکاریدها پلی‌مرهای طبیعی هستند که به‌وسیله باکتری‌های مختلف مانند باکتری‌های اسید‌لاکتیک، بیفیدوباکتریوم‌ها و باسیلوس‌ها تولید می‌شوند. به‌علت خواص فیزیکی وشیمیایی آن‌ها، به‌طور گسترده در صنایع‌غذایی به‌عنوان عوامل ویسکوزیته‌کننده، ژله‌ای‌کننده و قوام‌دهنده استفاده می‌شوند. از‌آن‌جائی‌‌که اگزوپلی‌ساکاریدهای تولیدی به‌وسیله سویه‌های باسیلوس ویسکوزیته و خواص سودوپلاستیک بالایی دارند، امروزه مورد توجه محققین قرار ‌گرفته‌اند. هدف این تحقیق بررسی میزان تولید پلی‌ساکارید خارج‌سلولی و اگزوپلی‌ساکارید متصل به‌سلول در 10جدایه ‌باسیلوس جدا‌شده از مرغ‌داری‌ها و تعیین جدایه ‌برتر بر‌اساس تولید اگزوپلی‌ساکارید می‌باشد. مواد و روش ها. 10جدایه ‌باسیلوس در محیط‌MRS جامد به‌همراه 2%‌(w/v)گلوکز کشت داده شده، در شرایط هوازی و دمای 37‌درجه سانتی‌گراد به‌مدت 48-24 ساعت گرم‌خانه‌گذاری شدند.سپس تولید اگزوپلی‌ساکارید‌‌ در آن‌ها(به‌صورت متصل‌شده و رها‌شده در محیط ) با روش فنل/‌سولفوریک اندازه‌‌گیری شد. به‌منظور بررسی کمی تولید اگزوپلی‌ساکارید، با مقایسه منحنی استاندارد گلوکز و نتایج به‌دست‌آمده، میزان تولید آن برحسب میلی‌گرم بر‌لیتر تعیین شد. یافته ها. از بین 10جدایه‌ باسیلوس، 2سویه بیشترین توانایی تولید اگزوپلی‌ساکارید متصل‌شده را داشتند، که بیشینه تولید،‌43 میلی‌گرم بر‌لیتر(B5)‌‌و ‌کمینه‌ تولید،‌2/ میلی‌گرم بر‌لیتر(,B4وB10وB9وB1وB8)‌بود. تمامی جدایه‌های مورد بررسی، اگزوپلی‌ساکارید رها‌شده در محیط تولید می‌کردند که در‌مورد آن‌ها بیشینه تولید 229 میلی‌گرم بر‌لیتر(B7)‌و کمینه تولید 45 میلی‌گرم بر‌لیتر(B8)‌بود. هم‌چنین کینتیک‌ رشد و کینتیک تولید اگزوپلی‌ساکارید جدایه ‌منتخب(B7)،‌در زمان‌های مختلف تعیین‌گردید. با مقایسه هر دو منحنی رشد باکتری و تولید اگزوپلی‌ساکارید رها‌شده و متصل‌شده می‌توان نتیجه‌گرفت که جدایه B7 ‌بیشترین تولید اگزوپلی‌ساکارید رها‌شده و متصل‌شده را در اواسط فاز لگاریتمی نشان می‌داد وپس‌از آن میزان تولید ثابت می‌ماند. نتیجه گیری. نتایج این تحقیق نشان ‌داد که پتانسیل تولید ترکیبات اگزوپلی‌ساکارید توسط گونه‌های باسیلوس بومی ایران می‌تواند وجود ‌داشته‌باشد.}, keywords_fa = {اگزوپلی‌ساکارید، باکتری‌های اسید‌لاکتیک، باسیلوس، کینتیک‌رشد}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-211-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-211-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Izadi, Amir and Moslemi, Elham and Hosseinyazdi, Ali}, title = {Detection of Brucella spp. in Raw Milk and Cheeses Samples Using Hemi Nested PCR}, abstract ={Aim and Background. Brucella spp. is a gram negative coco bacillus which has different hosts including human, cow, sheep and goat. Brucella spp. is transferred via milk and dairy products causing a Malta fever in human. Serological methods for Brucella spp. detection do not have sufficient sensitivity and accuracy in addition, they have great false positive and negative results. The aim of this study is determination of the hemi nested PCR technique sensitivity for detection of Brucella spp. in raw milk and cheese. Materials and methods. In this study 15 raw milk samples, 15 pasteurized cheese samples and 15 traditional cheese samples were collected from Tehran and suburbs. DNA was extracted using DNP kit from samples. After optimization of first and second round of PCR, sensitivity and specificity of reactions were examined. Then all samples were tested using developed PCR. Results. The PCR product which was obtained from first PCR round had 443 bp length, and the second round fragment had 225bp. The PCR sensitivity up to 100 particles was observed. Among 15 samples of raw milk, 10 cases were PCR positive. In 15 pasteurized cheese samples only 6 cases were PCR positive, and finally from 15 traditional cheese samples 8 were PCR positive. Conclusion. With respect to this result, it could be said that in comparison with conventional detection technique for Brucella spp. diagnosis, PCR has a significant sensitivity and accuracy. Furthermore, it seems that using molecular detection technique as confirmative tests for detection of Brucella spp. is inevitable.}, Keywords = {Brucella spp, Milk, Cheese, Hemi Nested PCR}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {83-90}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {شناسایی Brucella.spp در نمونه های شیر خام و پنیر به وسیله تکنیک Hemi Nested PCR}, abstract_fa ={سابقه و هدف. بروسلا یک کوکوباسیل گرم منفی می باشد که میزبانهای آن شامل انسان، گاو، بز و گوسفند می باشد. بروسلا از طریق شیر و فراورده های لبنی انتقال یافته و در انسان سبب ایجاد تب مالت می شود. روشهای سرولوژیک تشخیص بروسلا از حساسیت و دقت کافی برخوردار نبوده و دارای نتایج مثبت و منفی کاذب فراوانی می باشند. هدف از این مطالعه بررسی کارایی تکنیک همی نستد PCR جهت تشخیص بروسلا در نمونه های شیر و پنیر می باشد. مواد و روشها. در این مطالعه 15 نمونه شیر خام ، 15 نمونه پنیر پاستوریزه و 15 نمونه پنیر سنتی از سطح استان تهران جمع آوری گردید. DNAی نمونه ها به وسیله کیت DNP استخراج گردید. پس از بهینه نمودن راند اول و دوم تست PCR، حساسیت و اختصاصیت آن مورد ارزیابی قرار گرفت. سپس تمامی نمونه ها به وسیله تست PCR بهینه شده مورد بررسی قرار گرفتند. یافته ها. محصول آمپلیکون تکثیر یافته در محصول اول PCR ،443 جفت باز و در محصول دوم 225 جفت باز بود. حساسیت تست PCR بهینه شده تا 100 پارتیکل تعیین گردید. از 15 نمونه شیر خام،10 نمونه PCR مثبت، از 15 نمونه پنیر پاستوریزه 6 نمونه و از 15 نمونه پنیر سنتی 8 نمونه PCR مثبت شدند.نتیجه گیری . با توجه به نتایج بدست آمده ، تست PCR مورد بررسی در این مطالعه از حساسیت و دقت بسیار بالایی نسبت به روشهای متواتر برخوردار بوده، همچنین به نظر می رسد ضرورت استفاده از روشهای مولکولی به عنوان یک روش تاییدی جهت تشخیص بروسلا در کنار روشهای متداول غربالگری اجتناب ناپذیر می باشد.}, keywords_fa = {بروسلا ، شیر ، پنیر ، Hemi Nested PCR}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-212-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-212-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Bozorgnejad, Alireza and Baghi, Fatemeh and Zamanpourniavaran, Abbas and Akbarzadeh, Azim and Arjmand, Mehdi}, title = {Nanocarrier Liposome Production from Lecithin and Cisplatin Loading on it}, abstract ={Aim and Background. The main purpose of this research is cisplatin loading on liposome for targeted drug delivery. The suitable loading percentage obtained showed that we have achieved the target. Material and Methods. Liposome was extracted from a lecithin source and after dissolving in phosphate buffer the solution was sonicated in bath sonicator for loading the cisplatin on extracted liposomes and resizing to nano scale. Results. Total amount of plating in sonicated solution is known. Platin which exists in solution transparent phase after ultra centrifuge process, was determined with atomic absorption test. By subtracting these two amounts from each other we achieved the amount of platin existed in sedimentation phase. Particles’ size in nano scale were confirmed with zeta sizer. Conclusion. Liposome is known as a new lipid carrier for targeted drug delivery in cancer therapy. The anti cancer drug “cisplatin”, was encapsulated in liposome to reduce the side effects of drug on other cells and have a more dosage of drug on target cell.}, Keywords = {Liposome, Cisplatin , Targeted Drug Delivery , Loading}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {91-96}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {تولید نانو حامل لیپوزوم از لسیتین و بارگذاری داروی سیس پلاتین بر روی آن}, abstract_fa ={سابقه و هدف. در پژوهش حاضر ، هدف تولید نانو لیپوزوم حامل داروی سیس پلاتین بود که برای دارو رسانی هدفمند برای درمان انواع سرطان به کار گرفته می شود ، که با درصد بارگذاری مناسب به این مهم دست یافتیم . مواد و روش ها. لیپوزوم از یک منبع لسیتین استخراج شد و پس از انحلال در بافر فسفات ، به منظور بارگذاری سیس پلاتین بر لیپوزوم ساخته شده و تغییر اندازه ذرات به ابعاد نانو محلول در سو نیکاتور حمام دار سونیکه شد. یافته ها . میزان کل پلاتین موجود در محلول سونیکه شده مشخص است. پلاتین موجود در فاز شفاف محلول بعد از فرآیند اولتراسانتریفیوژ هم به کمک تست جذب اتمی معین می گردد. با کم کردن این دو مقدار از هم به میزان پلاتین موجود در فاز ته نشین دست یافتیم . همچنین با استفاده از دستگاه زتا سایزر اندازه ذرات در ابعاد نانو تایید شد.نتیجه گیری. لیپوزوم به عنوان یکی از حامل های لیپیدی جدید برای دارورسانی هدفمند جهت درمان انواع سرطان شناخته شده است . برای حذف اثرات جانبی دارو بر سایر سلول ها و رسیدن دوز بالاتری از دارو به سلول هدف داروی ضد سرطان سیس پلاتین در لیپوزوم کپسوله می شود .}, keywords_fa = {لیپوزوم ، سیس پلاتین ، دارورسانی هدفمند ، بارگذاری }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-213-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-213-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Atharinia, Masomeh and Nojoumi, Seyed Ali}, title = {Evaluation of Genotoxicity by Measurement of Micronuclei Induction Using Amphibian Larvae Xenopus laevis}, abstract ={Aim and Background. Environmental protection requires taking into account the genotoxic hazards likely to concern different populations of ecosystems. Genotoxins are substances that cause heritable changes in the genetic material in germ cells, namely spermatocytes or oocytes. Since such hazards may emerge within waters, it is essential to assess them by means of laboratory tests that allow the evaluation, within aqueous environments of the genotoxicity of a water effluent substance or preparation with respect to organisms living in aquatic environments. This article describes a method that is likely to provide information in this field. Material and Methods. Within aqueous environments it highlights, the genotoxic effects on larvaes of the amphibian species, Xenopus laevis. Xenopus laevis is a species of South African aquatic frog of the genus Xenopus. African clawed frogs can grow up to a length of 12 cm. They have a flattened head and body, but no tongue or external ears. The tested organisms were exposed to a range of concentrations for 12 days. Results. The negative and positive controls were carried out in parallel under the same conditions. The positive control allows the quality of the biological reagent to be checked and the test to be validated. The rate of erythrocytes with micronuclei was determined for each test concentration and control solutions. The rate of erythrocytes with micronuclei for each concentration was compared to that of the negative control in order to determine the concentrations that induce a positive genotoxic effect.Conclusion. The positivity of a test can be based on the detection, with respect to the negative control, of a statistically significant response for at least one of the test concentrations and the maximum concentration which does not give rise to an acute toxicity has been determined and tested.}, Keywords = {Genotoxicity, micronuclei, Xenopus laevis}, volume = {2}, Number = {7}, pages = {97-104}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {ارزیابی ژنوتوکسیسیتی به روش القاء میکرونوکلئی با استفاده از لاروهای آمفی بین Xenopus laevis}, abstract_fa ={سابقه و هدف. مخاطرات ژنوتوکسیسیتی ( سموم تاثیر گذار بر روی ژن ها ) یکی از نگرانی‌های سازمان‌های محافظ محیط زیست می‌باشد. ژنوتوکسین ها موادی هستند که باعث بوجود آمدن تغییرات قابل توارث در ماده ژنتیکی سلول های جنینی، اسپرماتوسیت ها و اووسیت ها، می شوند. با توجه به اینکه چنین مخاطراتی ممکن است از آب‌ ناشی شود، برای ارزیابی آن‌ها انجام آزمون‌های آزمایشگاهی آب با استفاده از ارگانیسم‌هایی که در این محیط زندگی می‌کنند، ضروری می‌باشد. این مقاله اثرات ژنوتوکسیسیتی در محیط‌های آبی را روی لاروهای گونه آمفی‌بین زنوپوس لاویس بررسی می‌کند. مواد و وروش ها. زنوپوس لاویس گونه ای از قورباغه آبزی آفریقای جنوبی از جنس زنوپوس است که دارای 12 سانتی متر طول با سر و بدن مسطح بدون گوش و زبان خارجی می باشد. ارگانیسم‌های مورد آزمون در مدت 12 روز در معرض محدوده‌ای از غلظت‌های نمونه تحت آزمون قرار می‌گیرند. یک کنترل بدون نمونه ( کنترل منفی ) و یک کنترل با یک ماده مرجع ژنوتوکسیک ( کنترل مثبت ) در شرایط یکسان به‌طور موازی مورد آزمون قرار می‌گیرند. یافته ها. با استفاده از کنترل مثبت، کیفیت معرف بیولوژیکی بررسی و آزمون تائید می‌شود. میزان گلبول‌های قرمز با میکرونوکلئی‌ برای هر غلظت از نمونه تحت آزمون و برای محلول‌های کنترل تعیین می‌شود. میزان گلبول‌های قرمز با میکرونوکلئی برای هر غلظت با نتیجه کنترل منفی به منظور تعیین غلظت‌هایی که ژنوتوکسیک مثبت را القاء می‌کند، مقایسه می‌شود. نتیجه گیری. مثبت بودن یک آزمون می تواند براساس نتایج معنی دار آماری در حداقل یکی از غلظت ها نسبت به کنترل منفی باشد و حداکثر غلظت، که سمیت حاد ایجاد کند، آزمون شده باشد و نتیجه آزمون مثبت باشد.}, keywords_fa = {ژنوتوکسیسیتی، میکرونوکلئی، زنوپوس لاویس}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-214-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-214-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {vosooghi, Samira and kheirkhah, Babak and kariminik, Ashraf and mirshekari, Toraj rez}, title = {A review of the role of Mycoplasma infections in humans\' infertility}, abstract ={  Mycoplasmataceae family found in different hosts such as humans , animals, plants and insects. Mycoplasma are one of the smallest and simplest bacteria, which have a free life and most of them are normal flora of male and female, moreover they are pathogens species. Genital mycoplasma and ureaplasma infections can lead to infertility . Sticking ability of these microorganisms to epithelial cells of urogenital system, sperm and erythrocyte make them able to establish infection in the human urogenital tract. These infections are often asymptomatic and will have pathological effects on reproductive health . The influence of infection on the volume , PH, motility , morphology and sperm count in men and pass through the birth canal in women is cause of infertility factors . There are a variety of statistics from different regions of the world about the role of infections in infertility since 39 percent in developed to 85 percent in African countries . In additional, according to existing reports, the prevalence of Ureaplasma in infertile couples (42 to 95 percent ) is more than fertile couples (23 to 25 percent ). In spite of lack of diagnosis, prevention and treatment , these infections remain continuously and ultimate to a risky consequences such as pelvic inflammatory disease (PID) and infertility. Therefore, the identification of these bacteria in asymptomatic infertile men and women is important and microbial screening for infertile couples , especially in young age should be essential.}, Keywords = {Mycoplasma , Infertility , Urogenital infections , Abortion }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {9-20}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی مروری نقش عفونت‌های مایکوپلاسمائی در ایجاد ناباروری در انسان}, abstract_fa ={  خانواده مایکوپلاسماتاسه باکتری­های بدون دیواره سلولی­اند که در میزبان­های مختلف مثل انسان، حیوانات، گیاهان و حشرات یافت می­شوند. مایکوپلاسماها از کوچک­ترین و ساده­ترین باکتری­هایی هستند که دارای زندگی آزاد بوده، اغلب فلور طبیعی مجرای ادراری – تناسلی مردان و زنان می­باشند و گونه­های بالقوه پاتوژنند. عفونت­های ناشی از مایکوپلاسما و اوره­آپلاسمای تناسلی می­تواند به ناباروری و نازایی منتهی شوند. توانایی و قابلیت چسبیدن این میکروارگانیسم­ها به سلول­های پوششی مجرای ادراری - تناسلی، اسپرم و اریتروسیت آن ها را قادر به ایجاد عفونت در دستگاه ادراری تناسلی انسان نموده است. این عفونت­ها اغلب بدون علامت بوده و تاثیرات منفی بر سلامت تناسلی خواهند داشت. تاثیر عفونت بر حجم، pH ، تحرک، مورفولوژی و تعداد اسپرم در مردان و عبور آن ها از کانال زایمان در زنان از عوامل مرتبط با ناباروری محسوب ­شود. امروزه آمارهای مختلفی از نواحی گوناگون جهان در مورد نقش عفونت­ها در ایجاد ناباروری موجود است که از 39 درصد در کشورهای پیشرفته تا 85 درصد در کشورهای آفریقایی متغیر می­باشد. همچنین میزان فراوانی اوره­آپلاسما در زوج­های نابارور (42 تا 95 درصد) بیشتر از زوج­های بارور (23 الی 25 درصد) گزارش شده است. در صورت عدم تشخیص، پیشگیری و درمان مناسب این عفونت­ها می­توانند به طور مستمر باقی مانده و منجر به عواقب خطرناکی مثل بیماری­های التهابی لگن و ناباروری گردند. لذا شناسایی این باکتری­ها در مردان و زنان نابارور فاقد علائم بالینی، از اهمیت بالایی برخوردار است و غربال­گری میکروبی برای زوج­های نابارور به خصوص در سنین جوانی ضروری به نظر می­رسد}, keywords_fa = {مایکوپلاسما، ناباروری، عفونت ادراری، عفونت تناسلی، سقط جنین. }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-250-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-250-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Parivar, Kazem and Alejafar, Roghayeh and Asadi, Asad elah and Maleki, Masu}, title = {Differentiation of Human Umbilicus Cord Wharton’s Jelly Stem Cells to Hematopoietic Cells}, abstract ={ Aim and Background. Stem cells have self-renewal potential and differentiating ability into adult somatic cell types. In this study the mesenchymal stem cells of human umbilical cord Wharton’s jelly were isolated. After proliferation, they were differentiated into blood cells via treating them by rat lung tissue extract which is rich in G-CSF, M-CSF,GM-CSF,IL-6 cytokines essential for various steps of differentiation.  Materials and Methods. Human umbilical cord Wharton’s jelly tissue was cut into 0.5 cm, and then cultured in T25 flask. After second passage, mesenchymal stem cells were treated with continuous lung tissue extract for differentiation. The cells cultured in 1:3, 1:1and 3:1 experimental volume groups of DMEM: extract ratio.  Results. Blood cells were observed at 1:3, 3:1 and 1:1 DMEM: extract experimental groups on the seventh day. Mesenchymal stem cells were confirmed by flow cytometric analysis (CD90,CD105). Positive cells were considered as mesenchymal stem cell in human Wharton’s jelly. Microscopic analysis of cells after Giemsa staining verified the presence of blood cells.  Conclusion. Human Wharton’s jelly mesenchymal stem cells were isolated by tissue culture methods . Also mouse cytokines could selectively induce human stem cells to adult human blood cells.}, Keywords = {Human Wharton’s Jelly, Mesenchymal Stem Cells, Blood Cells, Mouse Lung Cytokines }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {21-26}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {تمایز سلول های بنیادی ژله وارتون بند ناف انسانی به سلول های خونساز}, abstract_fa ={ سابقه و هدف : سلول های بنیادی، قدرت خودنوسازی و تمایز به انواع سلول های بالغ بدن را دارند. در این کار سلول های بنیادی مزانشیمی ژله وارتون بند ناف انسانی تحت تأثیر عصاره ریه موش به سمت سلول های خونی هدایت شدند عصاره ریه موش حاوی سیتوکین های نظیر: G-CSF,M-CSF,IL-6 و GM-CSF است که نقش فاکتور رشد در طول مراحل مختلف تمایز را دارند.  مواد و روش ها : در این پژوهش ژله وارتون بند ناف انسان به قطعات نیم سانتی متر برش و در فلاسک کشت T25 کشت داده شدند. بعد از پاساژ دوم، سلول های بنیادی مزانشیمی با نسبت های 3:1 ، 1:1 و1:3 محیط کشت: عصاره ریه موش تیمار شدند.  یافته ها : سلول های خونی در نسبت های 3 :1، 3:1 و1:1 محیط کشت: عصاره ریه موش در روز هفتم مشاهده گردید. با آزمایش فلوسایتومتری، بیان مارکرهای ( CD90, CD105 ) در سطح سلول های بنیادی مزانشیمی ژله وارتون بند ناف انسانی به اثبات رسید. بررسی شکل ظاهری سلول ها با رنگ آمیزی گیمسا نشان دهنده حضور سلول های خونی بود. نتیجه گیری : سلول های بنیادی ژله وارتون بند ناف انسانی با روش کشت بافت جداسازی شدند. سیتوکین های موش بر سلول های بنیادی انسانی تأثیر گذاشته و باعث تمایز این سلول ها شده است.}, keywords_fa = {ژله وارتون انسان، سلول های بنیادی مزانشیمی، سلول های خونی، سیتوکین های ریه موش }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-251-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-251-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Nasiri, Najmeh and Nematzadeh, Ghorbanali and Askari, Hossein and Shokri, Ehs}, title = {Study of Aeluropus littoralis Leaves Proteom Response to Salinity Stress}, abstract ={Aim and Background. Due to evolving in stress habitats, Halophyte plants are the best options to describe the fundamentals of molecular physiology of salt tolerance and breeding of crops. Therefore, because of genetic relationship of Aeluropus littoralis with rice, wheat and barley, the present study was performed to investigate leaves proteome pattern changes in response to different salt treatment using proteomics methods  Materials and Methods. To examine the effect of salinity on the Aeluropus proteome pattern, salt treatment in 3 levels (100, 200 and 300 mM NaCl) was applied . The mature leaves located in the middle part of plant were harvested for protein extraction after 21 days of salt exposure. Proteins were extracted according to TRIZOL approach and were separated by 2-DE using a nonlinear pH 4-7 IPG strips (24 cm) and 12.5 % poly acryl amide gel.  Results. Statistical analysis revealed that among 550 repeatable detected spots, at least 95 protein spots showed a significant change during salinity levels. In addition, the most proteins with increased and decreased expression levels were obtained in comparison between control and 200 mM NaCl levels and between 200 & 300 mM NaCl treatments, respectively. Based on cluster analysis the whole responsive proteome was classified into 10 classes.  Conclusion. Evaluation of these co-expression classes revealed that A. littoralis salinity responsive proteome follows four distinct expression patterns. These results showed that study of individual protein expression changes alone will not be fruitful. But also the identification of co-expression proteins collection and study of proteins gregarious changes pattern in response to different levels of stress was more importance and create better understanding.}, Keywords = {Proteomics, Salinity stress, 2D-Electrophoresis, Aeluropus Littoralis }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {27-35}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {مطالعه پاسخ پروتئوم برگ گیاه Aeluropus littoralis در شرایط تنش شوری}, abstract_fa ={ سابقه و هدف : گیاهان هالوفیت به جهت متکامل شدن در شرایط تنش، از بهترین گزینه­های پیش رو برای توصیف مبانی مولکولی فیزیولوژی تحمل به شوری و بهنژادی گیاهان زراعی می­باشند. در همین راستا با توجه به اینکه گیاه Aeluropus littoralis یک هالوفیت تک­لپه محسوب می­شود و قرابت ژنتیکی با گندم، برنج و جو دارد، پژوهشی بمنظور بررسی الگوی کلی بیان محتوای پروتئینی برگ­های این گیاه در پاسخ به تنش شوری در چهار سطح نرمال و شوری 100، 200 و 300 میلی­مولار با استفاده از تکنیک پروتئومیکس انجام گردید. مواد و روش­ها: برای بررسی اثر تنش شوری بر روی الگوی پروتئوم گیاه آلوروپوس، تیمار نمک در 3 سطح (100، 200 و 300 میلی­مولار کلرید سدیم) اعمال گردید و پس از 21 روز در شرایط تنش در نهایت برگ­های بالغ و کامل واقع در منطقه میانی گیاه، جهت استخراج پروتئین برداشت شد . پروتئین­های استخراج شده در دو بعد بوسیله ژل­های IPG با شیب 7-4 pH: ( cm 24) و ژل­های اکریل­آمید 5/12 درصد جداسازی شدند. یافته­ها: نتایج حاصل از ارزیابی آماری نشان داد، که از مجموع 550 نقطه پروتئینی تکرار پذیر حداقل 95 نقطه پروتئینی در سطوح شوری مورد مطالعه، تغییر بیان نشان دادند که این تغییرات شامل افزایش و کاهش بیان بود. همچنین بیشترین در صد پروتئین­هایی که افزایش و یا کاهش بیان نشان دادند به ترتیب در مقایسه بین تیمارهای نرمال و 200و سطوح 200و 300 بدست آمد. بر اساس آنالیز کلاستر مجموعه پروتئین­های پاسخگو در 10 کلاس پروتئینی هم­بیان قرار گرفت. ارزیابی کلاس­های پروتئینی مختلف، نشان داد پروتئوم پاسخ­دهنده به شوری در این گیاه از لحاظ هم­بیانی از چهار روند مشخص تبعیت می­کند.  نتیجه­گیری : نتایج این تحقیق نشان می­دهد که مطالعه میزان تغییرات بیان پروتئین­های منفرد به تنهایی راهگشا نخواهد بود بلکه شناخت مجموعه پروتئین­های هم­بیان و مطالعه الگوی تغییرات جمعی آنها در پاسخ به سطوح مختلف تنش نیز از اهمیت برخودار است و درک بهتری می دهد.}, keywords_fa = {پرتئومیکس، تنش شوری، الکتروفورز دو بعدی، Aeluropus littoralis }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-252-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-252-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Mard-Soltani, Meysam and Dayer, Mohammad Reza and Kesmati, Mahnaz and Ali-Bahar, Hamid and Shamshirgar-Zadeh, Abdolhossein and Nasirbagheban, Zahr}, title = {Hypocalcaemia Effects on Levels of Coagulation Factors in Type 2 Diabetics}, abstract ={ Aims and background. Cardiovascular complications are the main cause for much mortality among diabetics. Many studies show that cardiovascular diseases are developed after intravascular thrombosis in type 2 diabetics (T2D). Our previous studies show a significant hypercoagulable state and a prolongation in coagulation pathways. The current study tends to study the reasons of prolonged coagulation cascade in T2D patients and the possible relations between calcium and other minerals in blood plasma of T2D patients.  Material and Methods . In the present study, sixty T2Ds without any acute and chronic disorders were selected randomly and compared with 30 healthy subjects. In relation to the results of both groups, the following factors were studied: FBS, TG, calcium (Ca), Na, K, phosphate ions ( 12PO4-3'> ) and specific activity of coagulation factors: I, II, V, VII, VIII, IX, X, and XI with PT and APTT. All these factors were examined using laboratory methods and analyzed through Pearson correlation.  Results . The obtained results show that the factors of FBS, TG, II, IX, X and XI increase significantly in T2Ds in comparison with healthy subjects. The T2Ds show hypocalcaemia and hyperphosphatemia in comparison with healthy subjects. Also, the results show that APTT is prolonged in T2Ds and the Pearson correlation coefficient does not show a significant correlation between Ca, Na, K, PO4-3 and coagulation factors in T2Ds .  Conclusion . Hypercoagulable state, hypocalcaemia and hyperphosphatemia in the T2Ds suggest that heterogeneity has existed even in early stages in T2Ds. Although, there is an increase in hypercoagulable specific activities, the hypocalcaemia and its regulatory effect on the coagulation process might be considered as the reason for APTT prolongation. On the other hand, the hypocalcaemia and its compensatory mechanism cause hypercoagulable in order to compensate for the ineffectiveness of the coagulation process. Therefore, a sudden rise in plasma calcium concentration may increase the risk of intravascular thrombosis and cardiovascular complication in diabetics .   }, Keywords = {Hypercoagulable State, Hypocalcaemia, Cardiovascular Complications, Diabetes Mellitus}, volume = {2}, Number = {8}, pages = {37-43}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {اثر هیپوکلسیمیا بروی میزان فاکتور های انعقادی در بیماران دیابتی نوع 2}, abstract_fa ={سابقه و هدف : اختلالات قلبی-عروقی یکی از علل مهم مرگ و میر در بیماران دیابتی شناخته شده اند. مطالعات متعددی نشان می دهد که اختلالات قلبی-عروقی در بیماران دیابتی به دنبال تشکیل ترومبوز های کوچک در درون عروق ایجاد می گردند. مطالعات پیشین ما افزایش معنی دار برخی از فاکتور های انعقادی، کاهش کارایی آبشار های انعقادی و طولانی شدن زمان انعقاد در این بیماران را نشان می دهد. مطالعه حاضر به منظور مطالعه علل طولانی شدن زمان انعقاد در این بیماران و ارتباط با غلظت فاکتورهای انعقادی و نیز میزان کلسیم و برخی از املاح معدنی موجود در پلاسمای بیماران دیابتی نوع 2 طراحی و انجام گردیده است. مواد و روش ها: در مطالعه حاضر تعداد 60 بیمار دیابتی نوع 2 بدون سابقه ابتلا به هر گونه بیماری یا اختلال حاد و یا مزمن به عنوان گروه بیمار و 30 نفر فرد سالم داوطلب به عنوان گروه شاهد انتخاب شده اند. غلظت پلاسمائی میزان قند ناشتا یا FBS ، تری گلیسرید یا TG ، کلسترول تام یا TC ، و یون های + Ca ، + K ، + Na و یون های فسفات PO 4 -3 و همچنین فاکتورهای انعقادی شماره های I ، II ، V ، VII ، VIII ، IX ، X ، XI به همراه زمان پروترومبین PT و زمان انعقادی APTT اندازه گیری و ضریب همبستگی پیرسون بین پارامترهای مورد سنجش اندازه گیری گردید. یافته ها: نتایج بدست آمده نشان می دهد که از بین فاکتورهای اندازه گیری شده فاکتورهای II ، IX ، X ، XI ، TG و FBS در افراد دیابتی نسبت به افراد سالم افزایش معنی داری نشان می دهند. کاهش کلسیم و افزایش فسفات پلاسمایی در افراد دیابتی نسبت به افراد سالم از دیگر یافته های این تحقیق است. مدت زمان APTT طولانی تر در گروه بیمار در مقایسه با گروه شاهد و نیز ضریب همبستگی پیرسون معنی دار یون های + Ca ، + K ، + Na و PO 4 -3 با پارامتر های انعقادی در این بیماران از دیگر یافته های این مطالعه است. نتیجه گیری: افزایش فاکتور های انعقادی، کاهش غلظت پلاسمائی کلسیم و افزایش غلظت فسفات در بیماران دیابتی حکایت از ماهیت هتروژن دیابت نوع 2 حتی در مراحل اولیه دارد. علی رغم افزایش فعالیت ویژه فاکتورهای انعقادی شاید کاهش معنی دار یون های کلسیم و اعمال اثر مهاری آن روی فرآیند انعقاد، علت طولانی شدن زمان APTT باشد. از طرف دیگر کاهش غلظت کلسیم با مکانیزم جبرانی سبب افزایش میزان فاکتور های انعقادی شده تا ناکارآمدی فرآیند انعقاد را اصلاح نماید. بنابر این به نظر می رسد افزایش حاد و ناگهانی در غلظت پلاسمائی کلسیم می تواند دلیل افزایش احتمال تشکیل ترومبوز عروقی و حملات قلبی در این بیماران شود.   }, keywords_fa = {هیپوکلسیمیا، دیابت نوع 2، فاکتور های انعقادی، اختلالات قلبی-عروقی }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-253-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-253-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Sedighi, Mahsa and khosravi, Vahid and Ramedani, Arash}, title = {Estimating the Impact of Important Parameters on Biosorption of Cu and Mn Ions by Bacillus Thuringiensis}, abstract ={ Aim and Background . The importance of effective parameters on b iosorption of Cu and Mn ions from Sarcheshme Copper Mine Acid Mine Drainage (AMD) was investigated using regression analysis.  Materials and Methods. Bacillus Thuringiensis was isolated from Sarcheshme AMD water and sorption parameters of that AMD water were investigated. Results. Correlation between amount of biosorbent and amount of Cu removed (0.99) was greater than the correlation between amount of biosorbent and Mn removed (0.98) from wastewater. Furthermore, increasing pH increased Cu and Mn ions removal up to 19 and 9 times, respectively. It was also observed that increasing contact time raised the Cu and Mn uptake 4.83 and 1.5 times, respectively. Conclusion. Results showed that parameters like amount of biosorbent, pH, temperature and contact time have the most impact on amount of biosorption respectively and variation of effective parameters have more effects on Cu removal from wastewater.}, Keywords = {Biosorption, Cu and Mn ions, Bacillus Thuringiensis, Regression analysis. }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {45-51}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {برآورد تأثیر پارامترهای مهم در جذب بیولوژیکی مس و منگنز توسط باکتری باسیلوس تورنجینسیس}, abstract_fa ={ سابقه و هدف: میزان اهمیت پارامترهای مؤثر در جذب یون­های مس و منگنز از پساب اسیدی معدن با استفاده از آنالیز رگرسیونی تعیین گردید.  مواد و روش­ها: گونه­ای باکتری به نام باسیلوس تورنجینسیس از پساب اسیدی معدن جداسازی و خالص و پارامترهای جذب یون‌ها‌ی مس و منگنز موجود در همان پساب با استفاده از باکتری مذکور بررسی گردید. یافته ها: میزان همبستگی مقدار جاذب و میزان جذب یون های مس (99/0) بیشتر از میزان همبستگی جرم جاذب و میزان جذب یون های منگنز (98/0) می باشد و همواره با افزایش مقدار جاذب میزان جذب یون­ها بیشتر می شود. با افزایش pH ، میزان جذب یون منگنز تا 9 برابر و میزان جذب یون مس تا 19 برابر افزایش نشان می دهد.این در حالی است که با افزایش مدت زمان تماس مبزان جذب یون­های منگنز و مس نسبت به مقادیر اولیه شان به ترتیب 5/1 و 83/4 برابر افزایش نشان می­دهد. نتیجه­گیری: نتایج نشان می دهد که پارامترهای غلظت جاذب، pH ، دما و زمان به ترتیب بیشترین اهمیت را در جذب یون های مس و منگنز داشته و تغییرات پارامترهای مؤثر تأثیر بیشتری بر میزان جذب یون­های مس نسبت به منگنز دارد.}, keywords_fa = {جذب بیولوژیک، یون­های مس و منگنز، باسیلوس تورنجینسیس، تحلیل رگرسیونی }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-254-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-254-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Azimi, Akbar and Shahriary, Farajelah and Fotovat, Amir and HajizadehAgje, Khodaverd and KazemiQale, Rez}, title = {Investigation of Cell Cycle Gene Expression (Cyclin B1 and CDK-A ) Change Induced by Cadmium in Root Tips of Wheat (Triticum aestivum L.) Seedlings}, abstract ={ Aim and Background . The toxic effects of cadmium on growth parameters and cell division in Meristem of different plants have been demonstrated. However, the molecular mechanisms of this process are not completely understood until now. The aim of this study was to investigate the effect of cadmium on the expression of CDK-A and cyclin B1 genes in root tip of wheat seedlings for the identification of molecular cadmium limiting mechanism. Materials and Methods . Treated wheat root tips with 0, 5, 10, 15, 20, 30, 60, 90 and 120 mg/l concentrations of cadmium used for RNA extraction and RT-PCR with primers specific for cyclin B1 and CDK-A genes . Results . Resuls showed that expression of cyclin B1 gene at cadmium concentrations ranging from 5-15mg/l was invariant. But in higher concentrations (more than 15 mg/l) limiting effect of cadmium was quite clear. Also expression of CDK-A gene at 60, 90 and 120 mg/l concentrations of cadmium affected by limiting effect of cadmium. Conclusion . The decrease in root and coleoptiles growth of wheat seedlings treated with different concentration of cadmium depends on the expression of cyclin B1 and CDK-A genes and other unknown factors.}, Keywords = {Gene Expression, Cadmium, Cyclin B1, CDK-A, RT-PCR }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {53-59}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی تاثیر کادمیوم بر تغییر بیان ژن های چرخه سلولی (cyclin B1 و CDK-A) در نوک ریشه گیاهچه های گندم (Triticum aestivum L.}, abstract_fa ={ سابقه و هدف: اثر سمی کادمیوم بر پارامترهای رشدی و تقسیم سلولی در مناطق مریستمی گیاهان مختلف به اثبات رسیده است. اما با وجود این شواهد، مکانیزم های مولکولی دقیق این فرآیند به خوبی شناخته نشده است. هدف از این تحقیق بررسی اثر کادمیوم بر بیان ژنهای cyclin B1 و CDK-A در نوک ریشه گیاهچه های گندم، برای شناخت مکانیزم های مولکولی تاثیر کاهشی کادمیوم بر رشد است.  مواد و روش ها: نوک ریشه گیاهچه های گندم رشد کرده در محیط های کشت حاوی غلظت های 0، 5، 10، 15، 20، 30، 60، 90 و 120 میلی گرم بر لیتر کلرید کادمیوم برای استخراج RNA و انجام RT-PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی این ژن ها مورد استفاده قرار گرفت.  یافته ها: یافته ها نشان داد که بیان ژن cyclin B1 در غلظت های 5، 10 و 15 میلی گرم بر لیتر کلراید کادمیوم تغییری نداشته است، اما در غلظت های بالاتر از 15 میلی گرم بر لیتر اثر کاهشی آن بر روی بیان ژن کاملا مشهود است. همچنین بیان ژن CDK-A در غلظت های 60، 90 و 120 میلی گرم بر لیتر کادمیوم تحت تاثیر کاهشی کادمیوم قرار گرفت. نتیجه گیری: کاهش رشد ریشه و کلوپتیل گیاهچه های گندم تیمار شده با غلظت های مختلف کادمیوم، به بیان دو ژن cyclin B1 و CDK - A و به عوامل ناشناخته دیگری غیر از بیان این دو ژن بستگی دارد.}, keywords_fa = { بیان ژن، کادمیوم، cyclin B1 ، CDK-A ، RT-PCR }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-255-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-255-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Pourbaghi, Elmira and Isazadeh, Khosro and Anvari, Masoomeh and Modiri, Leyla and Nazari, Rashe}, title = {The Effect of Environmental Factors on Antagonistic Activity of Isolated Strain of Bacillus pumilus}, abstract ={ Aim and Background. Bacteria of the species Bacillus pumilus produce a large number of biological compounds which are active against bacteria and fungi. This study was designed with the aim of isolation, screening and optimization of antimicrobial production of Bacillus pumilus against four pathogenic microorganisms.  Materials and Methods. For the initial screening of antimicrobial activity against four pathogenic microorganisms , agar disk diffusion method and TSB medium and for the production of antimicrobial compounds, synthetic medium and agar well diffusion method is used. To obtain the maximum production of antimicrobial compounds, pH (6-9), incubation period (0-72 hours) and glucose concentration (1-5 ٪ ) are well considered. Data were analyzed by SPSS and ANOVA tests. Results. Maximum production of antimicrobial compounds by standard and isolated strain of B. pumilus was observed after 48 hours of incubation at 37oC, pH 7 and 3% glucose against four microbial strains.  Conclusion. B. pumilus species might be a potential candidate for the production of antimicrobial compounds in the future.      }, Keywords = {Bacillus pumilus ; Antibiotic Resistance }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {61-66}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {بررسی اثر عوامل محیطی بر میزان فعالیت آنتاگونیستی عصاره کشت ایزوله Bacillus pumilus}, abstract_fa ={سابقه و هدف: باکتری های گونه باسیلوس پومیلوس ترکیبات بیولوژیکی زیادی تولید می کنند که علیه باکتری ها و قارچ ها فعالند. مطالعه حاضر با هدف غربالگری و بهینه سازی غلظت گلوکز، pH و زمان انکوباسیون بر میزان فعالیت آنتاگونیستی ایزوله Bacillus pumilus علیه 4 پاتوژن انسانی انجام شد. مواد و روش ها: در بررسی اولیه فعالیت ضد میکروبی از روش انتشار دیسک و محیط TSB و جهت تولید ماده ضد میکروبی از محیط سنتتیک و روش انتشار در چاهک استفاده شد. حداکثر میزان تولید ماده ضد میکروبی با تغییر pH (٩ - ۶)، زمان انکوباسیون (٧۲ - ۰ ساعت) و غلظت گلوکز ( % ۵ - ١) مورد سنجش قرار گرفت. داده ها با نرم افزار SPSS و ANOVA مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. یافته ها: بیشترین میزان تولید ترکیبات ضد میکروبی توسط این ایزوله در7 pH ، %۳ گلوکز و بعد از ۴۸ ساعت انکوباسیون در C ˚ ۳٧ علیه ۴ سویه میکروبی بدست آمد. نتیجه گیری: گونه B. pumilus می تواند کاندیدی توانا جهت تولید متابولیت های ضد باکتریایی در آینده باشد.}, keywords_fa = {Bacillus pumilus ، مقاومت آنتی بیوتیکی}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-256-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-256-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Baghi, Fatemeh and Bozorgnejad, Alireza and Akbarzadeh, Azim and Arjmand, Mehdi and Rasekh, Behnam}, title = {Effect of Cisplatin Encapsulated in Nanoarchaeosome on Growth and Extension of Breast Cancer Cells in MCF-7 Cell Line}, abstract ={Aim and Background. The purpose of this research is to have increased level of stability and fatality rate of cisplatin by application of encapsulation process in nanoarchaeosome. Success of this research is proved by examining the results obtained from MTT tests on Breast cancer cells in MCF-7 cell line. Materials and Methods. After cultivation of MCF-7 cell line in culture room, fatality rate of encapsulated cisplatin was compared with normal cisplatin by performing the related MTT tests. Output numbers from Elisa Reader explained the death rate of cancer cells. Results. During the MTT tests performed on MCF-7 cell line, effect rate of encapsulated cisplatin was compared with normal cisplatin. Examining the figures resulted from Elisa Reader output numbers, shows that stability and fatality rate of encapsulated drug is extremely higher than normal drug. Conclusion. Nanoarchaeosome is used for encapsulating of cisplatin. This process causes increasing the stability of drug in addition to the rise of fatality rate. This was clearly shown by examining the Breast cancer cells in MCF-7 cell line.}, Keywords = {Cisplatin, Nanoarchaeosome, Loading, MTT Test, MCF-7 Cell Line }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {67-71}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {تاثیر سیس پلاتین کپسوله شده در نانو حامل آرکئوزوم بر رشد و گسترش سلول های سرطان سینه در رده سلولی MCF-7}, abstract_fa ={سابقه و هدف: در این پژوهش هدف رسیدن به میزان بالاتر پایداری و کشندگی داروی سیس پلاتین با به کار گیری فرآیند کپسوله کردن در نانو آرکئوزوم می باشد که با بررسی نتایج حاصل از تست های MTT بر روی رده سلولی سرطان سینه MCF-7 موفقیت این پژوهش اثبات می گردد. مواد و روش ها: بعد از کشت رده سلولی MCF-7 در اتاق کشت، با انجام تست های MTT مربوطه میزان کشندگی داروی سیس پلاتین کپسوله شده با سیس پلاتین معمولی با یکدیگر مقایسه می شوند. اعداد خروجی از دستگاه الیزا ریدر میزان مرگ و میر سلول های سرطانی را نشان می دهند. یافته ها: در طی انجام تست های MTT بر روی رده سلولی MCF-7 میزان اثر بخشی داروی سیس پلاتین کپسوله شده و معمولی با یکدیگر مقایسه شده و با بررسی نمودار های بدست آمده از اعداد خروجی الیزا ریدر به خوبی مشخص می گردد که پایداری و میزان کشندگی داروی بارگذاری شده به مراتب بیشتر از داروی معمولی است. نتیجه گیری: از نانوآرکئوزوم برای کپسوله کردن سیس پلاتین استفاده می شود. این امر علاوه بر افزایش پایداری دارو باعث بالارفتن میزان کشندگی آن نیز می گردد. این مسئله با آزمایش بر روی سلول های سرطان سینه رده سلولی MCF-7 به خوبی نشان داده می شود.}, keywords_fa = {سیس پلاتین، نانو آرکئوزوم، بارگذاری، تست MTT ، رده سلولی MCF-7 }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-257-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-257-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Rahmani, Hossein and Asghari, Seyed Mohsen and Ebrahimi, Sanaz and Sadr-e-Momtaz, Afsaneh and Taghdir, Maji}, title = {Biochemical Characterization of Elastase from Pseodomonas aeruginosa Strain PTCC1430}, abstract ={ Aim and Background . Metalloproteases have numerous industrial applications such as peptide and aspartame synthesis. However, their application is limited by instability as a result of autolysis. . In the present study, following purification, biochemical properties of a metalloprotease (elastase) from Pseudomonas aeruginosa have been investigated. Materials and Methods. Recombinant protein has been purified from E. coli by affinity chromatography. Temperature dependence of enzyme activity and optimum temperature has been measured using a plot of enzyme activity versus different temperatures. Optimum temperature of enzyme activity has been determined within a mix buffer solvent by activity measurements at different pHs, and the inactivation rate, t1/2 and thermodynamic parameters of inactivation have been determined using irreversible thermoinactivation. Results. Optimum temperature was 60°C in the presence of 0, 5 and 10 mM CaCl2, and optimum pH was 8.5. Inactivation rate was increased with elevation of temperature from 55 to 80°C. Half-life of thermoinactivation ( t1/2 ) was 150, 112, 47, 32, 18, 8 and 4 min at 55, 60, 65, 70, 75 and 80°C, respectively. Ea, D H # , D S # and D G # was 37.70, 37.02, 23.61 kcal/mol, respectively, and kinactivation was 4.49 ´ 103 s-1. Conclusion . Pseudomonas aeruginosa elastase can be considered between thermophilic and mesophilic enzymes. Optimum temperature did not alter in different calcium concentrations which imply that elastase stability is Ca-independent.}, Keywords = {Elastase, Thermal Stability, Kinetic Stability, pH. }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {73-77}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {مطالعه خصوصیات بیوشیمی الاستاز حاصل از باکتری سودوموناس آئروجینوزا سویه‌ی PTCC1430}, abstract_fa ={سابقه و هدف:  متالوپروتئازها کاربردهای فراوانی در صنعت از جمله در سنتز پپتید و آسپارتام دارند . با این وجود استفاده از آن ها با محدودیت هایی از قبیل ناپایداری به سبب اتولیز مواجه است. در تحقیق حاضر خصوصیات بیوشیمیایی یک متالوپروتئاز (الاستاز) حاصل از باکتری سودوموناس آئروجینوزا پس از خالص سازی مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها: با استفاده از کروماتوگرافی تمایلی پروتئین نوترکیب از E. coli خالص گردید. با رسم منحنی فعالیت آنزیم در دماهای مختلف وابستگی فعالیت به دما بررسی و دمای بهینه تعیین گردید. با استفاده از بافر میکس pH بهینه و با غیر فعال سازی حرارتی برگشت ناپذیر شیب غیرفعال سازی، t1/2 و پارامترهای ترمودینامیکی غیرفعال سازی تعیین گردید. یافته ها:دمای بهینه در هر سه غلظت 0، 5 و 10 میلی مولار کلرید کلسیم برابر با 60 درجه سانتیگراد تعیین گردید و pH بهینه 5/8 بدست آمد. شیب غیر فعال سازی حرارتی برگشت ناپذیر در دماهای 55، 60، 65، 70، 75 و 80 درجه سانتی گراد با افزایش دما افزایش یافت. در دماهای مذکور t1/2 بترتیب 150، 112، 47، 32، 18، 8 و 4 دقیقه محاسبه گردید. مقادیر Ea ، D H # ، D S # و D G # بترتیب 7/37 ، 02/37 و 61/23 کیلوکالری بر مول و مقدار kinactivation برابر با 1- s 103 × 49/4 بدست آمد. نتیجه گیری: از نظر وابستگی به دما الاستاز سودوموناس آئروجینوزا یک آنزیم با خصیوصیات مابین مزوفیل ها و ترموفیل ها می باشد. کلسیم در میزان دمای بهینه بی تاثیر است، و این پیشنهاد می کند پایداری آنزیم مذکور غیر وابسته به کلسیم است. }, keywords_fa = {الاستاز، پایداری حرارتی، پایداری سینتیکی، pH.}, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-258-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-258-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Kaligh, Solmaz and Bandehpour, Mojgan and Yassaee, Vahid reza and Parivar, Kazem and Kazemi, Bahram}, title = {Cloning, Expression and Purification CEL I Endonuclease Enzyme from Celery Plants}, abstract ={Aims . CEL I, is isolated from celery and the first eukaryotic nuclease is known to have cleavage DNA with high specificity at sites of the two DNA strands in a heteroduplex DNA molecule . The aim of this study was cloning, expression and purification CEL I endonuclease and a simple method for the detection of mutation s. Material & Methods . CEL I mRNA was used for RT-PCR. CEL I cDNA was synthesized and cloned into T-vector pTZ57R, then CEL I subcloned into pET32a expression vector. Recombinant plasmid was transformed into BL2I bacterial cells. Expression of recombinant plasmid was analyzed by western blot technique. Protein was purified by affinity chromatography . In first study, Recombinant enzyme was active in mutation detection in Product PCR normal and mutant BRCA1 gene. Results. The recombinant ( pET32a /CEL I) was successfully expressed in BL2I cells. Western blot analysis showed that the successfully expressed CEL I in the cells transfected . The first study showed that recombinant enzyme is kno wn to nick mismatch sites of the two DNA strands in a heteroduplex DNA molecule. Conclusion. The expression of CEL I in BL2I cells was strong. In vitro, purification protein was successful. Recombinant nucleases CEL I known to nick mismatch sites in a heteroduplex DNA molecule.}, Keywords = {CELI endonuclease enzymes, western blotting, plasmid pET32a, recombinant proteins, affinity chromatography }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {79-87}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {کلونینگ، بیان ژن وتخلیص آنزیم CEL Iاندونوکلئاز از گیاه کرفس}, abstract_fa ={اهداف: آنزیم I CEL یک گلیکوپروتئین گیاهی است که از گیاهان دسته کرفس استخراج می شود و اولین آنزیم یوکاریوتی است که پیوند ناجور را با یک اختصاصیت بالا در یکی از دو رشته DNA برش می دهد. هدف از این پژوهش کلون کردن ژن، بیان و تخلیص آنزیم CEL I اندونوکلئاز و بررسی عملکرد آن بر روی ژنهای جهش یافته در محیط آزمایشگاهی بوده است. مواد و روش ها: در این تحقیق از گیاه کرفس mRNA استخراج شد و سپس RT-PCR صورت گرفت و محصول به عنوان الگودر تکثیر PCR مورد استفاده قرار گرفت. ژن در پلاسمید بیانی pET32a ساب کلون شد و درون باکتری E.coli سویه BL2I( DE3) plysS ترانسفورم گردید. پروموتور ژن با IPTG القا شد و با وسترن بلاتینگ مورد بررسی قرار گرفت. پروتئین با ستون کروماتوگرافی تمایلی ( S.Tag / His.Tag ) تخلیص شد. همچنین فعالیت اندونوکلئازی آنزیم روی محصول PCR ژن جهش یافته و نرمال در حال بررسی می باشد. یافته ها: کلونینگ ژن با موفقیت انجام شد، پروتئین نوترکیب تخلیص شد و نتایج اولیه نشان دادند که آنزیم می تواند نواحی هترودوبلکس ژن را شناسایی کند. نتیجه گیری: آنزیم CEL I نوترکیب می تواند نواحی هترودوبلکس راشناسایی نماید.}, keywords_fa = {آنزیم CELI اندونوکلئاز، ،وسترن بلاتینگ، پلاسمید pET32a ، پروتئین نوترکیب، کروماتوگرافی تمایلی }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-259-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-259-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Rahmani, abas and Seighali, Narjes and Ebrahimzadeh, Hasan and ZareiJaliani, Hossei}, title = {Partial Purification of Peroxidase in Corms of Saffron (Crucus Sativus L.) during Dormancy and Waking}, abstract ={Aim and Background. Per o xi d ases a re o n e o f t he m o st i m p o rta n t enz y mes p artici pa ting in many p h y s i o lo g i c al p r ocesses in p l a n ts. Saffron, (Cr o c us s a t i v u s L) , is a v a luable plant w hi c h ha s b e en g r o w n s i nce a n ci e n t ti m es t o d a t e. B u t t he r e is a l a ck o f s u ffi c ient b i o c he mi c al a n d ph y s i ol og i cal i nf o r m a tio n abo u t t h e s ta g es o f t h e s a f fr on g r ow t h , d e v e l o p m en t a n d t he i m portant en z y m e s in v o l v e d . Peroxi d ases in C r ocus sa t i v u s L. ca n b e a m arke r o f di s t i n c t ph y s i ol o gi c a l o r d e v e l o p m e n ta l p r o c e ss e s , a s show n b e f or e by l a bo r ato r y st u d i es. Materials and Methods. In this study, the Crucus Sativus L. corms in two different months –July and November as dormant and waking stages of saffron growth, sampled and Corms were us e d for t h e enz y me e x trac t i on. It was partially purified with ion-exchange chromatography . Results. T h e r e sul t s showed that a m o u n t of t o t al pro t e i n in w a k i ng c o rms i s a b o u t t w o tim e s in c o m p arison with t h e dor m ant cor m s. The high a c tiv i t y o f t h e p l a n t in wa k i ng sta t e corresponds with m o re p rotein con t e n t. Conclusion. T h is d iff eren ce m ig h t be pa rt i a l l y d u e t o t he dif f e r e nt p a tte r n s o f th e e n z y m e gly c o s yl a t i on a nd s ur f a c e ele c t r o s t a ti c c ha r g es .}, Keywords = {C r ocus sa t i v u s L, P e r o xid as e, Dor m a ncy , Waking }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {89-95}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {خالص سازی نسبی آنزیم پراکسیداز در بنه های زعفران مزروعی در دو دوره فیزیولوژیکی خواب و بیداری}, abstract_fa ={سابقه و هدف: پراکسیداز یکی از مهم ترین آنزیم های فیزیولوژیکی در گیاهان می باشد. زعفران یک گیاه با ارزش از زمان های باستان محسوب می شود. اما اطلاعات کافی درمورد رشد و پیشرفت زعفران و آنزیم های مهم آن وجود ندارد. پراکسیداز یک شاخص فیزیولوژی محسوب می شود به گونه ای که در مطالعات آزمایشگاهی مورد بررسی قرار می گیرد. مواد و روش ها: پیازهای ریزومی(بنه ها) زعفران مزروعی ( Crocus sativus ) در ماه های تیر و آبان به ترتیب به عنوان نمونه های خواب و بیداری جمع آوری شدند. بنه ها به عنوان منبع عصاره آنزیمی مورد استفاده قرار گرفتند. این عصاره برای مطالعات بیشتر استفاده شد. یافته ها: محتوای پروتئین کل بنه های زعفران مزروعی در دو مرحله خواب و بیداری، در کلیه مراحل مختلف خالص سازی سنجش شد. نتایج بیانگر آن است که مرحله بیداری دارای مقدار پروتئین کل بیشتری نسبت مرحله خواب است. نتیجه گیری: این اختلاف می تواند مربوط به الگوهای متفاوت گلیکوزیلاسیون آنزیم ها و بارهای الکترواستاتیکی سطحی می باشند.}, keywords_fa = {زعفران، خالص سازی، پراکسیداز، خواب، بیداری }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-261-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-261-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} } @article{ author = {Sohrabi, Mojtaba and Onsory, Khadijeh and Helalat, deyed Hossein and BakhtiariTajar, Mostafa and Aslanbeigi, Niloofar and Sajjadi, Saman and SalehiSiavashani, Elham and JafariZavie, Alirez}, title = {Genetic Polymorphisms of CYP2D6 and Prostate Cancer Risk}, abstract ={Aims and background . The development of prostate cancer is dependent on heredity, androgenic influences, and exposure to environmental agents. The carcinogenic compounds require biotransformation by metabolizing enzymes and carcinogenesis of the prostate involves the associations between genetic polymorphisms of different metabolizing enzymes and prostate cancer. CYP2D6 belongs to the cytochrome P450 super family of enzymes and plays an important role in the metabolism of clinically used drugs including antidepressants. The polymorphic cytochrome P450 (CYP) enzymes are of particular interest in prostate cancer susceptibility because of their ability to metabolize both endogenous and exogenous compounds, including dietary constituents. Materials and Methods. Association between CYP2D6 gene polymorphisms and prostate cancer was studied in a case-control study on North Indian population comprising 100 patients and an equal number of age-matched control men. For this purpose, the PCR products were exposed to restriction enzyme through RFLP method. Results. Relative to men homozygous for the wild-type allele in CYP2D6 gene, those heterozygous for the B allele had an odd ratio of 1.78 (95% CI, 0.76-4.17, P=0.18) for patients, and for homozygous individuals, it was 1.95 (0.55-6.93, P=0.30). Conclusion. No association was observed between B allele of CYP2D6 gene polymorphism and prostate cancer risk.}, Keywords = {CYP2D6 Gene, Polymorphism, Prostate Cancer }, volume = {2}, Number = {8}, pages = {97-104}, publisher = {Islamic Azad University of Parand}, title_fa = {پلی مورفیسم در ژن CYP2D6 و خطر ابتلا به سرطان پروستات}, abstract_fa ={ سابقه و هدف : عواملی چون ژنتیک، هورمون های آندروژنی و همچنین قرار گرفتن در معرض ترکیبات شیمیائی در ابتلا افراد به سرطان پروستات نقش مهمی دارند. این ترکیبات باید توسط آنزیم های متابولیزه کننده از بدن دفع گردند و میزان فعالیت این آنزیم ها رابطه مستقیمی با سرطان پروستات دارد. 6D2PYC متعلق به خانواده بزرگی از سیتوکروم 054P می باشد که نقش مهمی در متابولیسم داروها و ترکیبات شیمیائی بازی می کند. میزان فعالیت اینگونه آنزیم ها باعث ایجاد تغییرات بین افراد درجمعیت های متفاوت می گردد، بطوری که فعالیت بالای این آنزیم ها باعث متابولیزه کردن کامل ترکیبات بوده در حالی که آنزیم های غیرعملکردی قادر به چنین فعالیتی نمی باشند. آنزیم های سیتوکروم 054P در ارتباط با سرطان پروستات از توجه بیشتری برخوردار است چرا که آن ها قادرند ترکیبات داخلی و مواد شیمیائی خارجی را مورد متابولیسم قرار دهند.روش مطالعه : هدف از این مطالعه بررسی رابطه بین پلی مورفیسم در ژن 6D2PYC وخطر ابتلا به سرطان پروستات بود. برای این منظور، تعداد 001 بیمار مبتلا به این بیماری و همان تعداد افراد سالم از جمعیت شمال هندوستان در شرایط سنی یکسان مورد مطالعه قرار گرفتند و از خون و یا بافت افراد مورد مطالعه استخراج AND صورت گرفته و سپس توسط PLFR-RCP مورد بررسی قرار گرفت. یافته ها : نتایج حاصله نشان دهنده این است که در مقایسه با مردان هموزیگوت برای آلل نوع وحشی در ژن 6D2PYC افراد هتروزیگوت برای آلل B ( MEH )،دارای و افراد هموزیگوت برای این آلل ( MP ) دارایبودند. نتیجه گیری : داده ها حاکی از آن است که رابطه مستقیمی بین پلی مورفیسم در ژن 6D2PYC و ابتلا افراد به سرطان پروستات نشان داده نشده است.}, keywords_fa = {ژن 6D2PYC ، پلی مورفیسم، آلل B ، سرطان پروستات }, url = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-262-en.html}, eprint = {http://ncmbjpiau.ir/article-1-262-en.pdf}, journal = {New Cellular and Molecular Biotechnology Journal}, issn = {2228-5458}, eissn = {2228-6926}, year = {2012} }