fa
jalali
1400
4
1
gregorian
2021
7
1
11
43
online
1
fulltext
fa
مروری بر همبستگی بین اضطراب و شیوع کووید 19
A review of the correlation between anxiety and the prevalence of Covid 19
کرونا ویروس ها خانواده بزرگی از ویروس ها هستند که بیماری های مختلفی را از سرماخوردگی معمولی گرفته تا سندرم حاد و شدید تنفسی، ایجاد می کند. ظهور کووید 19تاثیر روان شناختی بسیاری دارد که یکی از آن ها اضطراب است و تأثیرات جسمی و روانی را به همراه آورده است. با این حال ، بیشتر مطالعات فقط روی داده های بالینی متمرکز شده اند. هم اکنون این ویروس همه کشورهارا درگیر کرده و به صورت اپیدمی در آمده است و سلامت روانی و جسمی را به خطر انداخته است.بنابراین هدف از پژوهش حاضر بررسی میزان همبستگی بین اضطراب و شیوع کووید ۱۹ می باشد
در مقاله مروری حاضر،اثرات روانی COVID-19 و ارتباط آن با اضطراب مورد بررسی قرار گرفت. بر این اساس ، با استفاده از منابع الکترونیک در بانک های اطلاعاتی معتبرPubMedScopus ،SID ،Google Scholar ،Science Directمقالات ایندکس شده از تعداد 114 مقاله به دست آمده، 35 مقاله مورد ارزیابی قرار گرفت و ۱۳ مقاله وارد مرحله غربالگری ثانویه شدند.
مطالعه حاضر نشان داد که COVID-19 به جز مرگ و میر، مشکلات روانشناختی دارد. بررسی مطالعات انجام شده در سایر نقاط جهان نشان داد که COVID-19 چندین اثر روانی از جمله افزایش اضطراب ایجاد کرده است.
بــا توجــه بــه ماهیــت ناشــناخته آن در افــراد باعــث ایجــاد اضطــراب در افــراد مبتلا و سایر افراد جامعه می شود .با افزایش میزان شیوع COVID-19 و محدودیت های ناشی از آن، سطح اضطراب نیز افزایش می یابد. بنابراین، افزایش آگاهی عمومی از این بیماری و ارائه برنامه های مثبت روانشناختی در رسانه ها با هدف کنترل استرس می تواند اضطراب را در جامعه کاهش دهد.
Coronaviruses are a large family of viruses that cause a variety of ailments ranging from the common cold to acute and severe respiratory syndrome. The emergence of Covid 19 has many psychological effects, one of which is anxiety and has physical and psychological effects. However, most studies have focused only on clinical data. The virus has now spread to all countries and has become an epidemic, rapidly endangering mental and physical health. Therefore, the aim of the present study was to investigate the correlation between anxiety and the prevalence of Covid 19.
In this review article, the psychological effects of COVID-19 and its relationship with anxiety were investigated. Accordingly, using electronic resources in reputable databases of PubMedScopus, SID, Google Scholar, Science Direct, indexed articles were obtained from 114 articles, 35 articles were evaluated and 13 articles entered the secondary screening stage.
The present study showed that COVID-19 has psychological problems other than mortality. Studies in other parts of the world have shown that COVID-19 has several psychological effects, including increased anxiety.
Due to its unknown nature, it causes anxiety in affected individuals and other members of the community. With increasing prevalence of COVID-19 and its limitations, the level of anxiety also increases. Therefore, increasing public awareness of this disease and presenting positive psychological programs in the media aimed at controlling stress can reduce anxiety in society.
Corona virus, Covid 19, Anxiety, Mental health. Iau Science.
کرونا ویروس, کووید19, اضطراب, سلامت روان. Iau Science.
9
24
http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1561-4&slc_lang=fa&sid=1
2020/09/30
1399/7/9
2021/05/12
1400/2/22
Arezoo
kasavandi
1. Department of Microbiology, Shahr-e-Qods Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran.
آرزو
کساوندی
00319475328460011969
00319475328460011969
Yes
گروه میکروبیولوژی، شهرقدس، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
Mahsa
Amirani
2. Department of Biology, Yadegar-e-Imam Khomeini(RAH) Shahr-e-Rey Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
مهسا
امیرانی
00319475328460011970
00319475328460011970
No
گروه میکروبیولوژی، واحد یادگار امام (ره) شهررری، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
Narges
Pirzadeh nori
Department of clinical psychology, University of Shahid Beheshti , Tehran, Iran
پیرزاده نوری
pirzadenarges32@gmail.com
00319475328460011971
00319475328460011971
No
گروه روانشناسی بالینی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
fa
مقایسه اثرات ضد کاندیدایی عصاره های آبی و اتانولی و اسانس گیاه سرخارگل (Echinacea angustifolia ) با داروی فلوکونازول بر رشد سویه های کلینیکی قارچ کاندیدا آلبیکنس
Comparison of anti-candida effects of aqueous,
ethanolic extracts and essential oil of E. angustifolia
with fluconazole on the growth of clinical strains of Candida
سابقه و هدف: گونه های کاندیدا، پاتوژنهای فرصتطلبی هستند که بهدلیل افزایش مقاومت به داروهای شیمیایی لازم است که داروهایی با ترکیبهای گیاهی جایگزین این داروها شود. در این تحقیق به مقایسه اثر ضدقارچی عصاره آبی و اتانولی و اسانس قسمت گلریزه گیاه E. angustifolia روی رشد کاندیدا آلبیکنس با داروی فلوکونازول پرداخته شده است.
مواد و روش ها: در این مطالعه آزمایشگاهی که در سال 1398 در مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی دانشگاه آزاد شهرکرد انجام گرفت، 80 نمونه قارچی کاندیدایی از بیمارستان پارسیان شهرکرد تهیه و با انجام تستهای تشخیصی 50 نمونه کاندیدا آلبیکنس جدا شد. بوته های گیاه E. angustifolia از مزرعه آموزشی پژوهشی دانشکده کشاورزی دانشگاه آزاد شهرکرد تهیه شد. استخراج عصاره بهروش پرکولاسیون و استخراج اسانس بهروش تقطیر با آب صورت گرفت. مقایسه اثر ضدکاندیدایی عصاره و اسانس E. angustifolia با داروی فلوکونازول، با دو روش دیسک دیفیوژن و میکرودایلوشن براث انجام شد.
نتایج: میانگین قطر هالههای عدم رشد برای عصارههای E. angustifolia 1 و برای اسانس E. angustifolia 4/23 میلیمتر بود. مقایسه میانگین قطر هاله عدم رشد فلوکونازول 25 میلی گرمی بهعنوان شاهد با میانگین mm 26/16 نشاندهنده عملکرد ضدقارچی ضعیفتر و تفاوت معنیدار آن نسبتبه اسانس E. angustifolia است (05/0P ≤). میانگین حداقل غلظت عصاره اتانولی و آبی E. angustifolia و فلوکونازول به ترتیب 4، 8 و mg/ml 8 برای MIC و 8، 16 و mg/ml8 برای MFC بود؛ که تفاوت معنیدار بازدارندگی عصاره اتانولی E. angustifoliaنسبتبه دیسک mg25 فلوکونازول را نشان داد (01/0P ≤).
بحث و نتیجه گیری: با توجهبه نتایج حاصل از تحقیق فوق، به نظر میرسد عصاره اتانولی گیاه E. angustifolia میتواند بهعنوان یک کاندید دارویی مناسب با عملکردی ضدقارچی بهتر از فلوکونازول در صنایع داروسازی مورد استفاده قرار گیرد.
Aim and Background: Candida species are opportunistic pathogens that can be considered as the main cause of a wide range of diseases. Due to the increased resistance of these fungi to chemical drugs and also the adverse effects of these compounds on patients, it is necessary to replace these drugs with herbal compounds. In this study, the antifungal effect of aqueous and ethanolic extracts and essential oil of E. angustifolia on the growth of Candida albicans with fluconazole was compared.
Materials and Methods: In this laboratory study conducted in 1398 in Shahrekord Azad University Biotechnology Research Center, 80 candidate fungal samples were prepared from Parsian Hospital in Shahrekord and 50 Candida albicans samples were isolated by diagnostic tests. E. Angustifolia plants were obtained from Shahrekord Azad University Faculty of Agriculture. The extract was extracted by percolation and the essential oil was extracted by water distillation. The antifungal effect of E. angustifolia extracts along with E. angustifolia essential oil with fluconazole was compared on these isolates by disk diffusion and microdilution methods.
Results: The minimum and maximum diameter zone of inhibation obtained by disk diffusion method for E. angustifolia extracts, no growth halo formation with 1 and the lowest and maximum halo diameter for E. angustifolia essential oil were 6 and 37 mm. Therefore, the mean diameter of non-growth zone of inhibation for E. angustifolia extracts was 1 and for E. angustifoliathe essential oil was 23.4 mm. Comparison of the mean diameter of 25 mg fluconazole inhibition zone as control with an average of 16.26 mm shows a weaker antifungal performance and a significant difference compared to E. angustifolia essential oil. (P ≤ 0.05). The minimum inhibitory concentrations (MIC) of ethanolic and aqueous extracts of E. angustifolia and fluconazole were 4, 8, and 8 mg/ml, respectively; While the minimum fungicidal concentrations(MFC) were 8, 16, and 8 mg/ml, respectively; Showed a significant difference in inhibition of E. angustifoli ethanolic extract compared to 25 mg fluconazole disk (P ≤ 0.01).
Discussion and Conclusion: According to the results of the above research, it seems that the ethanolic extract of E. angustifoliacan be used as a suitable drug candidate with better antifungal performance than fluconazole in the pharmaceutical industry.
Essential oil, Fluconazole, Candida albicans, E. angustifolia extract, Iau Science .
اسانس, فلوکونازول, کاندیدا آلبیکنس, عصاره E. angustifolia,Iau Science
25
38
http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1575-4&slc_lang=fa&sid=1
2020/09/302020/12/13
1399/9/23
2021/05/122021/06/10
1400/3/20
Tohid
Piri Gharaghie
Sina Borna Aria (SABA) Co., Ltd Lab, Biotechnology Research Center, Shahrekord Branch, Islamic Azad University, Shahrekord, Iran.
توحید
پیری قراقیه
tohidpirie@yahoo.com
00319475328460011967
00319475328460011967
No
شرکت سینا برنا آریا (SABA) ،مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران.
Sameh
Hajimohammadi
Sina Borna Aria (SABA) Co., Ltd Lab, Biotechnology Research Center, Shahrekord Branch, Islamic Azad University, Shahrekord, Iran.
سامه
حاجی محمدی
00319475328460011968
00319475328460011968
Yes
گروه برق، دانشکده فنی مهندسی، دانشگاه غیرانتفاعی واحد ایوانکی، ایوانکی، ایران.
fa
تولید دمین نوترکیب متالوپروتئیناز ایکارین به عنوان فعال کننده اصلی پروترومبین در سلول HEK293
Recombinant Production of metalloproteinase domain of Ecarin as the main activator of prothrombin
سابقه و هدف: امروزه بیماران زیادی به دلیل نقص یا عدم عملکرد فاکتورهای انعقادی و استفاده از انواع داروهای رقیقکننده خون درگیر اختلالات انعقادی بوده و نیازمند بررسی کل پروترومبین و تعیین مقدار بازدارندههای مستقیم ترومبین میباشند. با وجود مطالعه روی ایکارین سم مار جعفری، به عنوان یک فعالکننده مستقیم پروترومبین، هنوز در مورد مکان فعال این آنزیم تحقیق و بررسی انجام نشده است.
مواد و روشها: دمین متالوپروتئیناز ایکارین با طول 639 جفت باز در وکتور pcDNA3.1 سنتز گردید و پلاسمید یوکاریوتی نوترکیب به رده سلولی HEK293 انتقال یافت. با استفاده از روش SDS-PAGE بیان پروتئین مورد ارزیابی قرار گرفت و عملکرد آن در واکنش با پروترومبین و با استفاده ازتست زمان پروترومبین سنجیده شد.
یافتهها: نتایج نشان داد که دمین متالوپروتئیناز ایکارین تولید شده در سیستم بیانی HEK293 ، مانند ایکارین کامل، قادر به تولید ترومبین از پروترومبین است. اما در مقایسه با پروتئین مشابه تولید شده در سیستم پروکاریوتی، شروع فعالیت آن آهسته بود.
نتیجهگیری: دراین بررسی دمین متالوپروتئینازی ایکارین که به صورت نوترکیب در سلولهای HEK293 تولید گردید، همانند ایکارین کامل قادر به فعال کردن پروترومبین به ترومبین بود و برای اولینبار به عنوان یک جایگزین مناسب برای هر دو نوع ایکارین طبیعی و نوترکیب در روشهای مبتنی بر تبدیل پروترومبین به ترومبین معرفی شد.
Aim and Background: Today, many patients with coagulation disorders due to defective or non-functioning coagulation factors and the use of various blood thinners need to check their prothrombin total and quantify determination of direct thrombin inhibitors. Despite the study of the ecarin from Echis carinatus venom as a direct activator of prothrombin, there have been not investigations into the active site of this enzyme.
Material and methods: Ecarin metalloproteinase domain (639 bp) was synthesized into the pcDNA3.1. Recombinant plasmid was transfected into HEK293 cell line. Protein expression was evaluated using SDS-PAGE and its function in reaction with prothrombin and using a prothrombin time test was measured.
Results: The results showed that the metalloproteinase domain of ecarin produced in the HEK293, like whole ecarin, was able to activate prothrombin to thrombin; but its activity was slow than one produced in the prokaryotic system.
Conclusion: In this study, the recombinant ecarin metalloproteinase produced in HEK293 cells, like whole ecarin, was able to activate prothrombin to thrombin and was introduced for the first time as a suitable alternative to both natural and recombinant ecarin in methods based on prothrombin to thrombin conversion.
Ecarin, Metalloproteinase domain, Active site, HEK293 cells, Iau Science
ایکارین, دمین متالوپروتئیناز, مکان فعال,سلولهایHEK293 ,, Iau Science.
39
45
http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-36-6&slc_lang=fa&sid=1
2020/09/302020/12/132021/02/13
1399/11/25
2021/05/122021/06/102021/06/20
1400/3/30
Nasrin
Mohammadi
Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
نسرین
محمدی
00319475328460011972
00319475328460011972
Yes
گروه زیستشناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
Mojgan
Bandehpour
Department of Biotechnology, School of Medicine, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran.
مژگان
بندهپور
00319475328460011973
00319475328460011973
No
گروه بیوتکنولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
Fattah
Sotoodehnejadnematalahi
Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
فتاح
ستودهنژاد نعمتاللهی
00319475328460011974
00319475328460011974
No
گروه زیستشناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
Bahram
Kazemi
Department of Biotechnology, School of Medicine, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran.
بهرام
کاظمی
bahram_14@yahoo.com
00319475328460011975
00319475328460011975
No
گروه بیوتکنولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
fa
بررسی اثر فرمولاسیون نانو نیوزومی حاوی داکسوروبیسین بر روی سلولهای سرطانی تخمدان (ردهی OVCAR-3
Investigation of nanoniosomal formulation containing doxorubicin effect on ovarian cancer cell line (OVCAR-3 cell line)
سابقه و هدف:سرطان از مهمترین عاملهای مرگ و میر در جهان است. درمان سرطان بواسطه دارو درمانی/شیمی درمانی با چالش دارو رسانی هدفمند مواجه است. نانوسامانه های دارورسانی مانند نیوزوم ها درمان پربازده و هدفمندی را فراهم ساختهاند. هدف از این مطالعه تهیه فرمول جدید نانو سامانه نیوزومی حاوی داروی داکسوروبیسین، به عنوان داروی درمان سرطان بوده است، که با تغییر در توزیع بافتی دارو منجر به بهبود اثر دارویی و کاهش سمیت آن شود.
مواد و روش ها:نیوزومها استفاده از روش فیلم نازک و توسط مقادیر مشخصی از اسپن60 و کلسترول به وسیلهی دستگاه روتاری سنتز شدند. از روش هیدراتاسیون برای بارگیری دارو درون نیوزومها استفاده گردید. بازده درون گیری و پرووفایل رهایش با استفاده از روشهای اسپکتروفتومتری و دیالیز صورت پذیرفت. قطر میانگین نانوذرات و پتانسیل زتا با استفاده از تکنیک DLS و دستگاه زتاسایزر اندازه گیری شد. فرمولاسیون بهینه پگیله شده و سمیت آن از طریق آزمون MTT بر روی رده سلولی سرطان تخمدان و سلولهای طبیعی فیبروبلاستی بررسی گردید.
یافته ها:اندازه ی قطر فرمولاسیون نیوزومی بهینه و پگیله 5/127 نانومتر و راندمان بارگذاری سامانه داکسوروبیسین پگیله شده حدود 18/1±83/95% بود. نتایج مطالعات آزاد سازی در بافرPBS در 37 درجه سانتی گراد نشانه کارایی نانونیوزوم های پگیله شده در کنترل رهش دارو بود، که درصدآزاد سازی دارو تا 48 ساعت 52/20 و اثر سایتوکسیتی آن بیشتر از فرم معمولی دارو بود.
نتیجه گیری:این مطالعه نشان داد که استفاده از حامل های دارو رسانی مانند نانو نیوزوم های سنتز شده در افزایش کارایی دارو وکاهش دوز مصرفی آن موثر بود.
Aim & Background: Cancer is a major cause of mortality in the world. Treatment of Cancer through drug therapy/chemotherapy faces the challenges of drug delivery. Drug delivery systems such as niosomes provided high efficiency and targeted treatment. The aim of this study was to prepare a new formula of niosomal nano system containing doxorubicin as the cancer therapy drug. Changing the tissue distribution of drug leads to drug effect improvement and reducing its cytotoxicity.
Materials & Methods: Doxorubicin encapsulated niosomes were synthesized using thin-film method. A certain amount of Span-60 and Cholesterol dissolved by chloroform in a round bottom balloon. Rotary evaporator was used in order to remove the organic solvent and form the thin-film. The thin-film was hydrated by doxorubicin and PBS solution using rotary evaporator in 10°C higher than span-60 transition phase. Entrapment Efficiency and release profile were investigated using dialysis and spectrophotometry. Size reduction was applied by probe sonicating. Nanoparticles average diameter and zeta potentiol was measured using DLS technique and Zeta sizer. The optimum formula was PEGylated and its cytotoxicity investigated through MTT assay on Ovarian cancer cell line and fibroblast normal cells.
Results: The diameter of optimized and PEGylated niosomal formulation was 172.5 nm and entrapment efficiency of PEGylated doxorubicin system was about 95.83±1.18. release studies result in PBS buffer at 37°C was the sign of PEGylated nanoniosomes efficiency in controlling the drug release, which the release percent of drug after 48 hours was 20.52 and its cytotoxicity was higher than the free drug.
Conclusion: The study demonstrates using of drug delivery carriers such as synthesized nano-niosomes has an effective role in increasing the efficacy and reducing the consumed dosages of drug.
Ovarian Cancer, Nanomedicine, Doxorubicin, Iau Science.
سرطان تخمدان, نانو نیوزوم, داکسوروبیسین, Iau Science.
46
62
http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1675-6&slc_lang=fa&sid=1
2020/09/302020/12/132021/02/132021/04/28
1400/2/8
2021/05/122021/06/102021/06/202021/06/23
1400/4/2
Mariya
Ghashghaei
2. Department of Biochemistry, Islamic Azad University Branch Shiraz, Shiraz, Iran
ماریا
قشقایی
00319475328460012019
00319475328460012019
Yes
2. گروه بیوشیمی، واحد شیراز ، دانشگاه آزاد اسلامی شیراز، ایران
Milad
Akhlaghi
4. Nano-Biotech Foresight Company Biotechnology Campus, Science & Technology Park of Yazd, Yazd, Iran
میلاد
اخلاقی
00319475328460012020
00319475328460012020
No
4. شرکت ریز فناوران فردانگر، مرکز زیست فناوری، پارک علم و فناوری، یزد، ایران
4. Nano-Biotech Foresight Company Biotechnology Campus, Science & Technology Park of Yazd, Yazd, Iran
عظیم
اکبرزاده خیاوی
00319475328460012021
00319475328460012021
No
5. بخش نانو بیوتکنولوژی، پایلوت، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران
Nanotechnology and Tissue Engineering Research Center, Reproductive Sciences Research Institute, Shahid Sadoughi University of Medical Sciences, Yazd, Iran
بیبی فاطمه
حقیرالسادات
Fhaghirosadat@gmail.com
00319475328460012022
00319475328460012022
No
6. مرکز تحقیقات نانوتکنولوژی و مهندسی بافت، پژوهشکده علوم تولید مثل، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات درمانی شهید صدوقی یزد، یزد، ایران
fa
اهمیت مسیر سیگنالینگ ErbB در شناسایی بیومارکرهای تأثیرگذار بر توسعه بیماری عروق کرونری: یک مطالعه in-silico
The importance of ErbB signaling pathway in identifying biomarkers influencing the development of coronary artery disease: an in-silico study
سابقه و هدف: عروق کرونری، عروق خونی هستند که خون را به قلب منتقل می کنند. با ایجاد پلاک در دیواره این رگ ها، عمل خون رسانی با مشکل مواجه می شود. تشخیص بیماری عروق کرونری به دلیل خطراتی که برای سلامتی شخص دارد، بسیار مهم می باشد. هدف از این مطالعه بررسی ژنهای دارای تفاوت بیان بین بیماران و افراد نرمال در مسیر سیگنالینگ ErbB، به عنوان یکی از مسیرهای مهم در ایجاد این بیماری و بررسی اهمیت آنها در شناسایی بیومارکرهای بیماری عروق کرونری است.
مواد و روشها: ابتدا فایلهای خام حاصل از RNA-sequencing نمونه های بیماران عروق کرونری و افراد نرمال، به ترتیب از دیتاست های با شماره GSE99985 و GSE100206 بدست آمده و مراحل آنالیز نمونه ها انجام شد. ژنهای دارای تفاوت بیان در زبان برنامه نویسی R و با پکیج DESeq2 جداسازی شد. سپس آنالیز عملکردی ژنها از جمله مسیرهای سیگنالینگ، فرآیندهای بیولوژیکی و ژنهای دارای تفاوت بیان در مسیر ErbB و نحوه تغییرات بیان آنها مورد بررسی قرار گرفت.
یافته ها: نتایج نشان داد 1069 ژن در بین نمونه های موردنظر دارای افزایش بیان و 851 ژن نیز کاهش بیان داشتند. بعلاوه با بررسی آنالیزهای عملکردی مشخص شد ژنهایی مانند CAMK2D، SHC3،ERBB3، NRG4، RPS6KB2، MAPK1، BRAF، AREG و CRKاز جمله ژنهایی هستند که هم در بیماران تغییرات بیانی را نشان می دادند و هم مسیر سیگنالینگ ErbB را تحت تأثیر قرار میدادند.
نتیجه گیری: درنهایت ، بررسیهای مولکولی دقیقتر منجر به دستیابی به ژنهای قابل اعتماد برای شناسایی بیومارکرهای بیماری عروق کرونری خواهد شد که برای تحقیقات زیست پزشکی ، توسعه دارو و کاربردهای بالینی ضروری است.
Aim and Background: Coronary arteries are blood vessels that carry blood to the heart. With plaque forming on the walls of these arteries, the blood supply becomes problematic. The diagnosis of coronary artery disease is very important because of the risks to person's health. The aim of this study is to determine genes with differential expression between CAD patients and normal individuals in the ErbB signaling pathway, as one of the important pathways in the development of this disease, and to investigate their importance in identifying biomarkers of coronary artery disease.
Material and methods: The raw files of RNA-sequencing of samples of coronary artery patients and normal individuals were obtained from datasets with numbers GSE99985 and GSE100206, respectively, and the steps of sample analysis were performed. Genes with different expression in R program were isolated with DESeq2 package. Then, functional analysis of genes including signaling pathways, biological processes and genes with different expression in the ErbB pathway and how they change were examined.
Results: The results demonstrated upregulation of 1069 genes and downregulation of 851 genes among samples. In addition, functional analysis revealed that genes such as CAMK2D, SHC3, ERBB3, NRG4, RPS6KB2, MAPK1, BRAF, AREG and CRK had differentially expression among patients could affect ErbB signaling pathway as well.
Conclusion: Molecular studies can help to achieve the reliable biomarkers of coronary artery disease which is important for biomedical research, drug development and clinical applications.
coronary artery disease, ErbB signaling pathway, genes biomarkers , Iau Science
بیماری عروق کرونری, مسیر سیگنالینگ ErbB, بیومارکرهای ژنی , Iau Science
63
72
http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1676-2&slc_lang=fa&sid=1
2020/09/302020/12/132021/02/132021/04/282021/04/13
1400/1/24
2021/05/122021/06/102021/06/202021/06/232021/06/28
1400/4/7
Akram
Gholipour
Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
اکرم
قلی پور
00319475328460011976
00319475328460011976
No
دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات ، گروه زیست شناسی، تهران، ایران
Cardiogenetic Research Center, Rajaie Cardiovascular Medical and Research Center, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
فرشاد
شاکریان
00319475328460011977
00319475328460011977
No
ﻣﺮﻛﺰ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت کاردیو ژنتیک، مرکز آموزشی، تحقیقاتی و درمانی قلب و عروق شهید رجایی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران
Head of Cardiogenetic Research Center,Rajaie Cardiovascular, Medical, and Research Center,Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
علی
زاهدمهر
00319475328460011978
00319475328460011978
No
ﻣﺮﻛﺰ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت ﻣﺪاﺧﻼت ﻗﻠﺒﻲ و ﻋﺮوﻗﻲ ، مرکز آموزشی، تحقیقاتی و درمانی قلب و عروق شهید رجایی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران
Shiva
Irani
Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
شیوا
ایرانی
00319475328460011979
00319475328460011979
No
دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات ، گروه زیست شناسی، تهران، ایران
Seyed Javad
Mowla
Department of Molecular Genetics, Faculty of Biological Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran
سید جواد
مولی
sjmowla@yahoo.com
00319475328460011980
00319475328460011980
No
دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی، گروه ژنتیک مولکولی، تهران، ایران
Mahshid
Malakootian
Cardiogenetic Research Center, Rajaie Cardiovascular Medical and Research Center, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
مهشید
ملکوتیان
Malakootian@rhc.ac.ir
00319475328460011981
00319475328460011981
Yes
ﻣﺮﻛﺰ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت کاردیو ژنتیک، مرکز آموزشی، تحقیقاتی و درمانی قلب و عروق شهید رجایی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران
fa
کلونینگ و بیان پلی پپتید نوترکیب HPV16 / 18 L1-L2-E7 در سیستم بیانی باکتری
Cloning and Expression of the Recombinant HPV16/18 L1-L2-E7 Polypeptide in Bacterial Expression System
سابقه و هدف: ویروسهای پاپیلومای انسانی (HPV) به ویژه انواع 16 و 18 مهمترین عامل سرطان دهانه رحم محسوب می شوند که شایعترین آنها، دو نوع 16 و 18 هستند. از بین انواع پروتئین های مرتبط با HPV، پروتئین های کپسیدی L1 و L2 و نیز انکوپروتئین E7 به عنوان آنتی ژن های هدف برای طراحی واکسن مطرح می باشند. در سالهای اخیر، واکسن های نوترکیب پلی پپتیدی چند اپی توپی مورد توجه قرار گرفته اند. هدف از این مطالعه طراحی سازه فیوژنی L1-L2-E7 و ارزیابی بیان آن در سیستم بیانی باکتری است.
مواد و روش ها: در این مطالعه، با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی مختلف، اپی توپ های ایمنوژنیک و حفاظت شده از پروتئین های L1، L2 و E7 ویروسهای پاپیلومای انسانی نوع 16 و 18 انتخاب شدند. پس از سنتز توالی فیوژن طراحی شده L1-L2-E7 در وکتور کلونینگ pUC57، ساب کلون کردن آن در وکتور بیان پروکاریوتی pET24a(+) توسط آنزیمهای محدودالاثر EcoRI/ HindIII انجام شد. بیان پلی پپتید چند اپی توپی نوترکیب در سویه باکتری E.coli Rosetta توسط القاگر IPTG انجام و تأیید آن توسط آنالیزهای SDS-PAGE و وسترن بلات با استفاده از آنتی بادی ضد دنباله هیستیدینی صورت گرفت. بهینه سازی بیان تحت شرایط مختلف جذب (در طول موج 600 نانومتر)، دما و زمان پس از القا و غلظت IPTG انجام شد.
یافته ها: ساب کلون کردن سازه ژنی L1-L2-E7 در وکتور pET توسط حضور باند حدود 525 جفت باز روی ژل آگارز بعد از هضم آنزیمی تأیید شد. نتیجه بیان پلی پپتیدL1-L2-E7 در باکتری، حضور باند حدود 20 کیلودالتون را روی ژل SDS-PAGE و وسترن بلات آشکار کرد. بهترین شرایط برای بیان پلی پپتید نوترکیب در دمای 37 درجه، جذب حدود 7/0 تا 8/0، غلظت IPTG یک میلی مولار و زمان 16 ساعت پس از القا بود.
نتیجه گیری: بیان موفق سازه پلی پپتید چند اپی توپی L1-L2-E7 در سیستم باکتری انجام شد. تخلیص پلی پپتید نوترکیب به عنوان کاندید واکسن در مراحل بعدی صورت خواهد گرفت.
Aim and Background: Human papillomaviruses (HPVs) especially types 16 and 18 are known as the major causes of cervical cancer. Among HPV proteins, L1 and L2 capsid proteins, and also E7 oncoprotein are proposed as target antigens for vaccine design. In the recent years, the recombinant multiepitope polypeptides have attracted a special interest. The goal of this study is the design of L1-L2-E7 fusion construct and evaluation of its expression in bacterial expression system.
Materials and Methods: In this study, the immunogenic and conserved epitopes of HPV16/18 L1, L2 and E7 proteins were selected using different bioinformatics analyses. After synthesis of the designed L1-L2-E7 fusion sequence in pUC57 cloning vector, its subcloning was performed in pET24a (+) prokaryotic expression vector using EcoRI/ HindIII restriction enzymes. The expression of the recombinant multiepitope polypeptide was done in E.coli Rosetta strain using IPTG inducer, and confirmed by SDS-PAGE and western blotting using anti-His-tag antibody. The expression was optimized under different conditions such as optical density (OD in wavelength of 600 nm), temperature and time after induction, and IPTG concentration.
Results: The recombinant pET-L1-L2-E7 vector was confirmed by the presence of a clear band (~525 bp) related to the L1-L2-E7 gene on agarose gel after enzyme digestion. The expression of L1-L2-E7 polypeptide in bacteria showed the presence of a clear band (~20 kDa) in SDS-PAGE and western blotting. The best conditions for expression of the recombinant polypeptide were at temperature of 37◦C, optical density of 0.7-0.8, IPTG concentration of 1mM, and time of 16 h after induction.
Conclusion: The successful expression of the L1-L2-E7 multiepitope polypeptide was performed in bacterial system. In the next step, the recombinant polypeptide will be purified to use as a vaccine candidate.
Human papillomavirus 16/18, Capsid proteins, oncogene protein E7, Bacterial expression system
, Iau Science
ویروس پاپیلومای انسانی 16 و 18 , پروتئین های کپسید, پروتئین انکوژن E7, سیستم بیانی باکتری, Iau Science
73
82
http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1679-2&slc_lang=fa&sid=1
2020/09/302020/12/132021/02/132021/04/282021/04/132021/04/22
1400/2/2
2021/05/122021/06/102021/06/202021/06/232021/06/282021/06/26
1400/4/5
Matin
Kayyal
Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
متین
کیال
00319475328460011986
00319475328460011986
No
گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
Azam
Bolhassani
Department of Hepatitis and AIDS, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
اعظم
بوالحسنی
A_bolhasani@pasteur.ac.ir
00319475328460011987
00319475328460011987
No
بخش هپاتیت و ایدز، انیستیتو پاستور ایران، تهران، ایران
Zahra
Noormohammadi
Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
زهرا
نورمحمدی
00319475328460011988
00319475328460011988
Yes
گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
Majid
Sadeghizadeh
Department of Genetics, Faculty of Biological Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran
مجید
صادقی زاده
00319475328460011989
00319475328460011989
No
گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس ، تهران، ایران
fa
افزایش بیان ژنB7-H4 درسرطان معده و نقش آن بعنوان یک بیومارکر بالقوه تشخیصی
Overexpression of B7-H4 gene in gastric cancer as a potential diagnostic biomarker
سابقه و هدف: سرطان معده یکی از متداولترین سرطانهای شایع با مرگ و میر بالاست. B7-H4 بعنوان یک بیومارکر جدید تشخیصی بالقوه در سرطان معده ذکر شده است. اما اهمیت بالینی آن در این زمینه هنوز نامشخص است. هدف از مطالعه حاضر، بررسی سطح بیان mRNA ژن B7-H4 در نمونههای توموری متاستازی و غیرمتاستازی در مقایسه با حاشیه تومور بافتهای مربوطه و ارزیابی نقش آن در پیشرفت و پیشآگهی تومور بود.
مواد و روشها: در این مطالعه، بلوکهای پارافینه از60 بیمار با گاستریک آدنوکارسینوما ( 30 مورد همراه با متاستاز در زمان تشخیص و30 مورد بدون شواهد متاستاز) که طی سالهای 1387 تا 1397 در بیمارستان امام خمینی تهران تحت گاستروکتومی قرار گرفته بودند، مورد استفاده قرار گرفت. نمونهها به روش پانچ ( شامل تومور و حاشیه تومور برای هر نمونه) از بلوکهای پارافینه بعد از مشخص شدن ناحیه مد نظر توسط پاتولوژیست گرفته شد. استخراج RNA از بخشهای توموری و حاشیه تومور انجام شد. بیان B7-H4 mRNA از طریق qRT-PCRمورد ارزیابی قرار گرفت.
یافته ها: افزایش بیان B7-H4 mRNA در 5/81% از بافتهای توموری مشاهده شد. اختلاف معنیدار در بیان B7-H4 mRNA در بافتهای توموری موارد همراه با متاستاز (001/0>p) و بدون متاستاز (003/0>p) در مقایسه با حاشیه تومور دیده شد. اما مقایسه بیان B7H4 mRNA بین بافتهای توموری افراد با متاستاز یا بدون متاستاز، تفاوت معنیداری (0.732p=) را نشان نداد. همچنین آنالیزها ارتباط معنیدار بین بیان B7-H4 mRNA و متغیرهای کلینیکال وهسیتوپاتولوژی را نشان نداد.
نتیجه گیری: یافتههای ما حاکی از نقش احتمالی B7-H4 بعنوان یک بیومارکر، در بیماران با سرطان معده است. اگر چه تحقیقات بیشتر در این زمینه مورد نیاز است.
Aims and Background: Gastric cancer is one of the most common cancers with high mortality. B7-H4 has been identified as potential novel diagnostic biomarker in gastric cancer. But, its clinical significance in this area is still unclear. The purpose of the present study was to examine the expression level of B7-H4 mRNA in tumor tissue of gastric cancer patient with and without history in comparison with their marginal tissue. Also we evaluate its role in tumor progression and prognosis.
Materials and Methods: In this study, paraffin blocks were studied from 60 patients with gastric adenocarcinoma (30 with metastasis at the time of diagnosis and 30 without evidence of metastasis) who underwent gastrectomy during 1387-97 in Imam Khomeini Hospital in Tehran. Samples were taken from paraffin blocks by punching method (including tumor and tumor margin for each sample) after the area was identified by the pathologist. RNA extraction was performed from tumor sections and tumor margins. B7-H4 mRNA expression was assessed by quantitative Real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR).
Results: Increased expression of B7-H4 mRNA was observed in 81.5% of tumor tissues. There was a significant difference in B7-H4 mRNA expression in tumor tissues of cases with metastasis (p <0.001) and without metastasis (p <0.003) compared to tumor margin. However, comparison of B7-H4 mRNA expression between tumor tissues of metastatic and non-metastatic individuals did not show a significant difference (p = 0.732). Analyzes did not show a significant relationship between B7-H4 mRNA expression and clinical and histopathological variables.
Conclusion: Our findings indicate the possible role of B7-H4 as a potential diagnostic biomarker in patients with gastric cancer. Although more research is needed in this area.
Gastric cancer, B7H4, qRT-PCR, Iau Science.
سرطان معده, qRT-PCR , B7-H4 و Iau Science.
83
90
http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1654-2&slc_lang=fa&sid=1
2020/09/302020/12/132021/02/132021/04/282021/04/132021/04/222021/02/28
1399/12/10
2021/05/122021/06/102021/06/202021/06/232021/06/282021/06/262021/06/1
1400/3/11
Khadijeh
Fanaei
Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
خدیجه
فنائی
00319475328460012111
00319475328460012111
No
گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران.
Iman
Salahshourifar
Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
ایمان
سلحشوری فر
isalahshouri@gmail.com
00319475328460012112
00319475328460012112
No
گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران.
Shiva
Irani
Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
شیوا
ایرانی
00319475328460012113
00319475328460012113
Yes
گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران.
Mohsen
Esfandbod
Department of Hematology and Oncology, Imam Khomeini Hospital complex, Tehran University of Medical Sciences TUMS.
محسن
اسفند بد
00319475328460012114
00319475328460012114
No
گروه هماتولوژی و انکولوژی، مجتمع بیمارستانی امام خمینی، دانشکده علوم پزشکی دانشگاه تهران.
Fereshteh
Ameli
Pathology Department, Cancer Institute, Imam Khomeini Hospital complex, Tehran University of Medical Sciences
فرشته
عاملی
00319475328460012115
00319475328460012115
No
گروه پاتولوژی، انستیتو کانسر، مجتمع بیمارستانی امام خمینی، دانشکده علوم پزشکی دانشگاه تهران.
fa
کلون، بیان و خالص سازی پروتئین ویبریوبلاک به عنوان کاندیدبر علیه وبا
Cloning, expression and purification of vibrioblock proteins as candidates for cholera
سابقه و هدف: با ظهور تکنولوژی کلونینگ و DNA نوترکیب، امکان تولید داروها و واکسن هایی محقق شد که در گذشته ممکن نبود. پروتئین نوترکیب بخش عظیمی از صنعت زیست دارو را به خود اختصاص داده که یکی از مهمترین بخش های آن واکسن سازی میباشد.
مواد و روش ها: در این پژوهش با هدف دستیابی به کاندید پروتئینی واکسن وبا، ابتدا کلونینگ پلاسمید طراحی شده به میزبان باکتریاییE. coli DE3 Rossetagamiترانسفورم شده، پس از آن با استفاده از IPTG القاء بیان صورت گرفته و پس از بررسی بیان پروتئین توسط ژل الکتروفورز SDS-PAGE، پروتئین مورد نظر توسط ستون کروماتوگرافی نیکل-سفاروز خالص سازی شده است.
یافته ها: نتایج حاصل از پژوهش نشان میدهد پروتئین خالص سازی شده دارای وزن مولکولی 31 کیلودالتون میباشد همچنین میزان پروتئین خالص سازی شده 1 میلی گرم میباشد.
بحث و نتیجه گیری: با توجه به نتایج حاصل از این مطالعه و مقایسه آن با دیگر مطالعات مشابه، پروتئین حاصل از خلوصی مناسب برخوردار بوده و میتوان برای مطالعات بعدی مورد استفاده قرارگیرد.
Aim and Background: With the advent of cloning technology and recombinant DNA, it became possible to produce drugs and vaccines that were not possible in the past. Recombinant protein occupies a large part of the biopharmaceutical industry, one of the most important of which is vaccination.
Material & Methods: In this study, with the aim of obtaining a protein candidate for cholera vaccine, first cloning of a plasmid designed for the bacterial host E.coli DE3 Rossetagami was transformed, then expression was induced using IPTG and after protein expression was examined by SDS-PAGE gel electrophoresis, and then the protein was purified by nickel-sepharose (NI-NTA) chromatography column.
Result:The results show that the purified protein has a molecular weight of 31 kDa and the amount of purified protein is 1 mg.
Conclusion:Based on previous studies as well as the results of this study, the resulting protein can be considered as a suitable candidate for the cholera vaccine.
cholera, candidate vaccine, Recombinant protein, Cloning, recombinant DNA, Iau Science.
وبا, کاندید واکسن, پروتئین نوترکیب, کلونینگ, دی ان ای نوترکیب, Iau Science.
91
100
http://ncmbjpiau.ir/browse.php?a_code=A-10-1584-5&slc_lang=fa&sid=1
2020/09/302020/12/132021/02/132021/04/282021/04/132021/04/222021/02/282020/12/15
1399/9/25
2021/05/122021/06/102021/06/202021/06/232021/06/282021/06/262021/06/12021/06/20
1400/3/30
Mohammadali
Yaghobi moghaddam
Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Iran
محمدعلی
یعقوبی مقدم
00319475328460012116
00319475328460012116
Yes
مجتمع دانشگاهی شیمی و مهندسی شیمی، دانشگاه مالک اشتر، ایران
Alireza
Saeedinia
Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Iran
علیرضا
سعیدی نیا
00319475328460012117
00319475328460012117
No
مجتمع دانشگاهی شیمی و مهندسی شیمی، دانشگاه مالک اشتر، ایران
Afshin
Samimi Nemati
Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Iran
افشین
صمیمی نعمتی
00319475328460012118
00319475328460012118
No
مجتمع دانشگاهی شیمی و مهندسی شیمی، دانشگاه مالک اشتر، ایران
Mohammadjavad
Dehghan
Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Malek Ashtar University of Technology, Iran
محمدجواد
دهقان عصمت آبادی
mohammad_dehghan@mut.ac.ir
00319475328460012119
00319475328460012119
No
مجتمع دانشگاهی شیمی و مهندسی شیمی، دانشگاه مالک اشتر، ایران