دوره 8، شماره 31 - ( 4-1397 )
جلد 8 شماره 31 صفحات 48-39 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Samiei K, Sohrabi S M. Identification of potential protein targets in P. syringae using bioinformatic analysis to control this pathogen. NCMBJ 2018; 8 (31) :39-48
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1127-fa.html
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1127-fa.html
سمیعی کامران، سهرابی سید محسن. استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی برای شناسایی اهداف بالقوه پروتئینی در پاتوژن Pseudomonas syringae به‌منظور کنترل این پاتوژن. مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي. 1397; 8 (31) :39-48
1- گروه مهندسی کشاورزی، واحد کنگاور، دانشگاه آزاد اسلامی، کنگاور، ایران ، kamransamiei@yahoo.com
چکیده: (4847 مشاهده)
سابقه و هدف: شناسایی اهداف اختصاصی در هر پاتوژن برای جلوگیری از اثرهای سوءمصرف سموم شیمیایی ضروری است. در مطالعه حاضر، با استفاده از یک روش بیوانفورماتیکی مبتنی بر همولوژی، پروتئوم پاتوژن P. syringae با پروتئوم گیاه گوجه‌فرنگی و دیگر محصولهای کشاورزی میزبان آن مقایسه و تعدادی پروتئین بهعنوان اهداف بالقوه برای مبارزه در پاتوژن انتخاب شدند.
مواد و روش‌ها: پروتئوم پاتوژن با گیاهان میزبان مقایسه و پروتئین‌های غیرمشابه انتخاب شدند. این پروتئین‌ها با پروتئوم انسان و سایر موجودات غیرهدف مقایسه و پروتئین‌های غیرمشابه انتخاب و اهداف بالقوه تحت آنالیزهای کیفی مختلفی قرار گرفتند.
یافته‌ها: نتایج آنالیزها، 95 پروتئین را بهعنوان اهداف منحصر بفرد مشخص کرد. از مجموع پروتئین‌ها، 59 پروتئین در سیتوپلاسم، 15 پروتئین در غشاء داخلی، 17 پروتئین در فضای پریپلاسمیک، 3 پروتئین در غشاء خارجی و 1 پروتئین در خارج از سلول پاتوژن P.syringae تجمع پیدا می‌کردند.
نتیجه‌گیری: پروتئین‌های مشخص شده در این مطالعه، اهدافی بسیار مؤثر برای مبارزه بوده و هدف قرار دادن چنین پروتئین‌هایی می‌تواند بهطور مؤثری باعث کنترل پاتوژن P.syringae شود. همچنین طراحی و تولید مواد شیمیایی علیه این پروتئین‌های هدف، در کنار کنترل مؤثر این پاتوژن، می‌تواند طیف وسیعی از پاتوژن‌ها را کنترل کرده و از اثرهای مضر بر انسان، موجودات غیرهدف و محیط زیست جلوگیری کند.
مواد و روش‌ها: پروتئوم پاتوژن با گیاهان میزبان مقایسه و پروتئین‌های غیرمشابه انتخاب شدند. این پروتئین‌ها با پروتئوم انسان و سایر موجودات غیرهدف مقایسه و پروتئین‌های غیرمشابه انتخاب و اهداف بالقوه تحت آنالیزهای کیفی مختلفی قرار گرفتند.
یافته‌ها: نتایج آنالیزها، 95 پروتئین را بهعنوان اهداف منحصر بفرد مشخص کرد. از مجموع پروتئین‌ها، 59 پروتئین در سیتوپلاسم، 15 پروتئین در غشاء داخلی، 17 پروتئین در فضای پریپلاسمیک، 3 پروتئین در غشاء خارجی و 1 پروتئین در خارج از سلول پاتوژن P.syringae تجمع پیدا می‌کردند.
نتیجه‌گیری: پروتئین‌های مشخص شده در این مطالعه، اهدافی بسیار مؤثر برای مبارزه بوده و هدف قرار دادن چنین پروتئین‌هایی می‌تواند بهطور مؤثری باعث کنترل پاتوژن P.syringae شود. همچنین طراحی و تولید مواد شیمیایی علیه این پروتئین‌های هدف، در کنار کنترل مؤثر این پاتوژن، می‌تواند طیف وسیعی از پاتوژن‌ها را کنترل کرده و از اثرهای مضر بر انسان، موجودات غیرهدف و محیط زیست جلوگیری کند.
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
سلولی و مولکولی
دریافت: 1397/6/14 | پذیرش: 1397/6/14 | انتشار: 1397/6/14
دریافت: 1397/6/14 | پذیرش: 1397/6/14 | انتشار: 1397/6/14
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
