دوره 11، شماره 43 - ( 4-1400 )                   جلد 11 شماره 43 صفحات 72-63 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Gholipour A, Irani S, Mowla S J, Malakootian M. The importance of ErbB signaling pathway in identifying biomarkers influencing the development of coronary artery disease: an in-silico study. NCMBJ. 2021; 11 (43) :63-72
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1397-fa.html
قلی پور اکرم، شاکریان فرشاد، زاهدمهر علی، ایرانی شیوا، مولی سید جواد، ملکوتیان مهشید. اهمیت مسیر سیگنالینگ ErbB در شناسایی بیومارکرهای تأثیرگذار بر توسعه بیماری عروق کرونری: یک مطالعه in-silico. مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي. 1400; 11 (43) :72-63

URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1397-fa.html


ﻣﺮﻛﺰ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت کاردیو ژنتیک، مرکز آموزشی، تحقیقاتی و درمانی قلب و عروق شهید رجایی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران ، Malakootian@rhc.ac.ir
چکیده:   (539 مشاهده)
سابقه و هدف: عروق کرونری، عروق خونی هستند که خون را به قلب منتقل می کنند. با ایجاد پلاک در دیواره این رگ ها، عمل خون رسانی با مشکل مواجه می شود. تشخیص بیماری عروق کرونری به دلیل خطراتی که برای سلامتی شخص دارد، بسیار مهم می باشد. هدف از این مطالعه بررسی ژن­های دارای تفاوت بیان بین بیماران و افراد نرمال در مسیر سیگنالینگ ErbB، به عنوان یکی از مسیرهای مهم در ایجاد این بیماری و بررسی اهمیت آنها در شناسایی بیومارکرهای بیماری عروق کرونری است.
مواد و روش­ها: ابتدا فایلهای خام حاصل از RNA-sequencing نمونه ­های بیماران عروق کرونری و افراد نرمال، به ترتیب از دیتاست های با شماره GSE99985 و GSE100206 بدست آمده و مراحل آنالیز نمونه­ ها انجام شد. ژنهای دارای تفاوت بیان در زبان برنامه نویسی R و با پکیج DESeq2 جداسازی شد. سپس آنالیز عملکردی ژنها از جمله مسیرهای سیگنالینگ، فرآیندهای بیولوژیکی و ژنهای دارای تفاوت بیان در مسیر ErbB و نحوه تغییرات بیان آنها مورد بررسی قرار گرفت.
یافته­ ها: نتایج نشان داد 1069 ژن در بین نمونه های موردنظر دارای افزایش بیان و 851 ژن نیز کاهش بیان داشتند. بعلاوه با بررسی آنالیزهای عملکردی مشخص شد ژنهایی مانند CAMK2D، SHC3،ERBB3، NRG4، RPS6KB2، MAPK1، BRAF، AREG و  CRKاز جمله ژنهایی هستند که هم در بیماران تغییرات بیانی را نشان می­ دادند و هم مسیر سیگنالینگ ErbB را تحت تأثیر قرار می­دادند.
نتیجه گیری: درنهایت ، بررسی­های مولکولی دقیقتر منجر به دستیابی به ژنهای  قابل اعتماد برای شناسایی بیومارکرهای بیماری عروق کرونری خواهد شد که برای تحقیقات زیست پزشکی ، توسعه دارو و کاربردهای بالینی ضروری است.
 
متن کامل [PDF 437 kb]   (83 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی | موضوع مقاله: سلولی و مولکولی
دریافت: 1400/1/24 | پذیرش: 1400/4/7 | انتشار: 1400/4/10

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله تازه های بیوتکنولوژی سلولی - مولکولی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2021 CC BY-NC 4.0 | New Cellular and Molecular Biotechnology Journal

Designed & Developed by : Yektaweb