دوره 12، شماره 48 - ( 7-1401 )
جلد 12 شماره 48 صفحات 86-76 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Ochi-Ardabili M, Nourafcan H, Naghdi Badi H, Mohebalipour N, Qaderi A. Distinctive analysis of qualitative traits of hazelnut germplasm in Northwestern Iran using ATG start codon region genetic marker(SCoT). NCMBJ 2022; 12 (48) : 6
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1462-fa.html
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1462-fa.html
اوچی اردبیلی مهران، نورافکن حسن، نقدی بادی حسنعلی، محبعلی پور ناصر، قادری اردشیر. تحلیل انطباق پذیری تنوع ژرم پلاسم فندق شمالغرب ایران بر اساس صفات کیفی و نشانگر ژنتیکی ناحیه کدون آغاز ATG (SCoT). مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي. 1401; 12 (48) :76-86
گروه علوم باغبانی، مرکز تحقیقات گیاهان دارویی و فرآورده های ارگانیک، واحد میانه، دانشگاه آزاد اسلامی، میانه، ایران ، hassannourafcan@gmail.com
چکیده: (2066 مشاهده)
سابقه و هدف: ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسمی طبیعی و حفاظت شده از راهبردیترین فعالیتهای جهانی و بهعنوان سرمایه ملی هر کشور است. بهطوریکه در طول سالیان متمادی جهشها و تلاقیهای مختلف باعث تجمع برخی ژنهای مفید در این ژرم پلاسمها شده و میتواند بهعنوان ذخایر ژنتیکی در مواقع بحرانی مورد استفاده قرار گیرد. ارزیابی تنوع بر اساس صفات مورفولوژیکی و فنوتیپی بهدلیل تأثیر محیط و اثر متقابل ژنوتیپ در محیط پایداری مناسبی ندارد. بنابراین استفاه از نشانگرهای مبتنیبر DNA که تکرارپذیری بالایی دارد. نشانگر مبتنیبر امپلیکون DNA ناحیه شروع کدون برای ترجمه SCoT در گیاهان بهدلیل وراثتپذیری و تکرارپذیری، بهتازگی مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از این پژوهش ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسمهای ذخیرهگاه ژنتیکی فندق در رگههای جنگلی شمالغرب کشور با استفاده نشانگر مولکولی SCoTو به روش PCR انطباقپذیری آن با تنوع صفات کیفی بر اساس نشانگرهای ملی آزمونهای تمایز فندق است.
مواد و روشها: در این تحقیق 77 ژنوتیپ از جنگلهای فندق اردبیل، میانه و ارسباران انتخاب و محل هر ژنوتیپ با استفاده از GPS نشانهگذاری شد. با استفاده از دستورالعمل ملی آزمونهای تمایز یکنواخت و پایداری فندق، صفات کیفی ارزشگذاری شد و پس از استخراج DNA از برگ آنها با استفاده از 15 پرایمر اختصاصی SCoT تنوع پلیمورفیسم آنها ارزیابی شد.
یافته ها: نتایج نشان دادند که ژنوتیپها از نظر صفات کیفی تمایز به 17 کلاستر طبقهبندی شدند. با استفاده از 15 نشانگر SCoT تعداد نوارهای چند شکل 165 نوار با میانگین 11 نوار برای هر نشانگر و میانگین درصد پلیمورفیسم با میانگین 11 نوار برای هر نشانگر و میانگین درصد پلیمورفیسم برای نشانگر % 2/90 ژنوتیپها بر اساس این نشانگرها در 19 زیر کلاستر گروهبندی شدند. مواد و روشها: در این تحقیق 77 ژنوتیپ از جنگلهای فندق اردبیل، میانه و ارسباران انتخاب و محل هر ژنوتیپ با استفاده از GPS نشانهگذاری شد. با استفاده از دستورالعمل ملی آزمونهای تمایز یکنواخت و پایداری فندق، صفات کیفی ارزشگذاری شد و پس از استخراج DNA از برگ آنها با استفاده از 15 پرایمر اختصاصی SCoT تنوع پلیمورفیسم آنها ارزیابی شد.
بحث: آنالیز صفات کیفی بر اساس نوارهای ایجاد شده در SCoT نشان دادند که نشانگرهای 3، 5، 11، 12، 18 و 20 دارای تنوع ژنتیکی بیشتر و معنیدار بودند که میزان انطباق گروهبندی ژنوتیپها بر اساس SCoT نشانگرها 87/0 بر اساس آزمون مانتل برآورد گردید.
نتیجه گیری: با استفاده از دو نشانگر ژنتیکی میتوان (%75=R2) از تنوع دیسکریپتورهای تمایز فندق دسترسی پیدا نمود.
شماره‌ی مقاله: 6
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
ژنتیک
دریافت: 1400/10/12 | پذیرش: 1400/12/2 | انتشار: 1401/8/1
دریافت: 1400/10/12 | پذیرش: 1400/12/2 | انتشار: 1401/8/1
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
