دوره 14، شماره 54 - ( 2-1403 )
جلد 14 شماره 54 صفحات 65-53 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Jelvehgar N, Miri S M, Mostafavi K, Mohammadi A. Genetic diversity and relationships of populations of three Lepidium species using combined data analysis of molecular markers. NCMBJ 2024; 14 (54) :53-65
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1658-fa.html
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1658-fa.html
جلوه گر نیلوفر، میری سید مهدی، مصطفوی خداداد، محمدی عبداله. مطالعه تنوع و روابط ژنتیکی تودههای سه گونه لپیدیوم با استفاده از تجزیه دادههای ترکیبی نشانگرهای مولکولی. مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي. 1403; 14 (54) :53-65
گروه باغبانی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، واحد کرج، دانشگاه آزاد اسلامی، کرج، ایران ، smmiri@kiau.ac.ir
چکیده: (433 مشاهده)
سابقه و هدف: جنس لپیدیوم (Lepidium L.) یکی از سه جنس بزرگ خانواده شببو هست که به عنوان سبزی و گیاه دارویی مورد مصرف قرار می‌گیرد. اطلاع از روابط و تنوع ژنتیکی گونه های لپیدیوم به وسیله نشانگرهای مولکولی یک راه‌کار مطلوب برای اصلاح و حفاظت از ژرمپلاسم آنها میباشد. این پژوهش با هدف مطالعه تنوع و روابط ژنتیکی تودههای سه گونه لپیدیوم با استفاده از تجزیه دادههای ترکیبی سه نشانگر مولکولی SSR، ISSR و SCoT انجام شد.
مواد و روشها: تنوع ژنتیکی و روابط بین 22 توده متعلق به سه گونه لپیدیوم ساتیوم (L. sativum) ، لپیدیوم درابا (L. draba) و لپیدیوم لاتیفولیوم (L. latifolium) با استفاده از داده های ترکیبی نشانگرهای SSR، ISSR و SCoT بر اساس تجزیه واریانس مولکولی، شاخصهای تنوع ژنتیکی، تجزیه خوشهای، تجزیه به مختصات اصلی و ساختار ژنتیکی بررسی شد.
یافته ها: تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که تنوع ژنتیکی درون گروهی بیشتر از بین گروهی است. بیشترین و کمترین تنوع ژنتیکی به ترتیب مربوط به لپیدیوم ساتیوم و لپیدیوم لاتیفولیوم بود. بیشترین ماتریس تشابه ژنتیکی Nei بین لپیدیوم درابا و لپیدیوم لاتیفولیوم و کمترین تشابه بین لپیدیوم ساتیوم و لپیدیوم لاتیفولیوم مشاهده شد. تجزیه خوشهای به روش Neighbor-Joining تودههای لپیدیوم را به سه گروه تقسیم کرد و تفکیک ضعیفی بین گونه‌ها وجود داشت که توسط تجزیه به مختصات اصلی و ساختار ژنتیکی تایید شد و به نظر میرسد به دلیل جریان ژنی بین تودههای گونههای مختلف لپیدیوم و وجود مخزن ژنی مشترک بین آنها باشد.
نتیجه گیری: نتایج نشان داد تودههای سه گونه لپیدیوم مورد مطالعه سطح بالایی از تنوع ژنتیکی و جریان ژنی دارند که می توانند به عنوان منابع ژنتیکی ارزشمندی در برنامههای اصلاحی مورد استفاده قرار گیرند.
مواد و روشها: تنوع ژنتیکی و روابط بین 22 توده متعلق به سه گونه لپیدیوم ساتیوم (L. sativum) ، لپیدیوم درابا (L. draba) و لپیدیوم لاتیفولیوم (L. latifolium) با استفاده از داده های ترکیبی نشانگرهای SSR، ISSR و SCoT بر اساس تجزیه واریانس مولکولی، شاخصهای تنوع ژنتیکی، تجزیه خوشهای، تجزیه به مختصات اصلی و ساختار ژنتیکی بررسی شد.
یافته ها: تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که تنوع ژنتیکی درون گروهی بیشتر از بین گروهی است. بیشترین و کمترین تنوع ژنتیکی به ترتیب مربوط به لپیدیوم ساتیوم و لپیدیوم لاتیفولیوم بود. بیشترین ماتریس تشابه ژنتیکی Nei بین لپیدیوم درابا و لپیدیوم لاتیفولیوم و کمترین تشابه بین لپیدیوم ساتیوم و لپیدیوم لاتیفولیوم مشاهده شد. تجزیه خوشهای به روش Neighbor-Joining تودههای لپیدیوم را به سه گروه تقسیم کرد و تفکیک ضعیفی بین گونه‌ها وجود داشت که توسط تجزیه به مختصات اصلی و ساختار ژنتیکی تایید شد و به نظر میرسد به دلیل جریان ژنی بین تودههای گونههای مختلف لپیدیوم و وجود مخزن ژنی مشترک بین آنها باشد.
نتیجه گیری: نتایج نشان داد تودههای سه گونه لپیدیوم مورد مطالعه سطح بالایی از تنوع ژنتیکی و جریان ژنی دارند که می توانند به عنوان منابع ژنتیکی ارزشمندی در برنامههای اصلاحی مورد استفاده قرار گیرند.
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
فیزیولوژی
دریافت: 1403/2/25 | پذیرش: 1403/2/23 | انتشار: 1403/2/23
دریافت: 1403/2/25 | پذیرش: 1403/2/23 | انتشار: 1403/2/23
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
