، asadjadian@gmail.com
چکیده: (7 مشاهده)
سابقه و هدف: گیاهشناسی جنایی با بهرهگیری از شواهد گیاهی میتواند اطلاعات مهمی درباره زمان و مکان وقوع جرم، ارتباط بین مظنونان و قربانیان و حتی مواردی چون قاچاق غیرقانونی ارائه دهد. در این راستا، بارکد DNA به عنوان ابزاری دقیق، سریع و قابل اعتماد، جایگزینی مؤثر برای روشهای سنتی شناسایی گیاهان محسوب میشود. در این مطالعه، بارکد DNA یک گونه گیاهی بومی مناطق جرمخیز کشور شامل گیاه شمشاد خزری (Buxus sempervirens subsp. hyrcana) مورد بررسی قرار گرفت.
مواد و روش ها: نمونه ها از صحنه جرم نمونهبرداری شد و از دو ناحیه ژنی nrDNA ITS هستهای و trnH-psbA پلاستیدی برای تعیین توالی استفاده شد. تحلیلهای فیلوژنتیکی با روشهای بیشینه صرفهجویی و استنتاج بیزی انجام شد و شبکههای بدون ریشه با SplitsTree ترسیم گردید. همچنین، شاخصهایی مانند فاصله ژنتیکی، تنوع و هاپلوتیپها با نرمافزارهای Mega و DnaSP محاسبه شدند. آزمون سازگاری دادهها (ILD) نیز با PAUP صورت گرفت.
یافته ها: با وجود هموپلازی بالاتر در ITS نسبت به trnH-psbA، توالی ITS به دلیل جایگاههای اطلاعاتی بیشتر، قدرت تفکیک بالاتری در شناسایی گونهها از خود نشان داد. آنالیز BLAST نیز برتری ITS را تأیید کرد. قطعه trnH-psbA در برخی گونهها کارایی مناسبی نداشت و استفاده ترکیبی از توالیهای هستهای و پلاستیدی برای B. hyrcana توصیه شد.
نتیجه گیری: در نهایت، یک پروتکل استخراج DNA اصلاحشده و قابل استفاده برای تمام بخشهای گیاه توسعه یافت. این پروژه نشان داد که بارکدینگ DNA میتواند با ایجاد تکرارپذیری و استانداردسازی، نقش کلیدی در پذیرش شواهد گیاهی در فرآیندهای قضایی ایفا کند.
مواد و روش ها: نمونه ها از صحنه جرم نمونهبرداری شد و از دو ناحیه ژنی nrDNA ITS هستهای و trnH-psbA پلاستیدی برای تعیین توالی استفاده شد. تحلیلهای فیلوژنتیکی با روشهای بیشینه صرفهجویی و استنتاج بیزی انجام شد و شبکههای بدون ریشه با SplitsTree ترسیم گردید. همچنین، شاخصهایی مانند فاصله ژنتیکی، تنوع و هاپلوتیپها با نرمافزارهای Mega و DnaSP محاسبه شدند. آزمون سازگاری دادهها (ILD) نیز با PAUP صورت گرفت.
یافته ها: با وجود هموپلازی بالاتر در ITS نسبت به trnH-psbA، توالی ITS به دلیل جایگاههای اطلاعاتی بیشتر، قدرت تفکیک بالاتری در شناسایی گونهها از خود نشان داد. آنالیز BLAST نیز برتری ITS را تأیید کرد. قطعه trnH-psbA در برخی گونهها کارایی مناسبی نداشت و استفاده ترکیبی از توالیهای هستهای و پلاستیدی برای B. hyrcana توصیه شد.
نتیجه گیری: در نهایت، یک پروتکل استخراج DNA اصلاحشده و قابل استفاده برای تمام بخشهای گیاه توسعه یافت. این پروژه نشان داد که بارکدینگ DNA میتواند با ایجاد تکرارپذیری و استانداردسازی، نقش کلیدی در پذیرش شواهد گیاهی در فرآیندهای قضایی ایفا کند.
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
