جوادی سیده مهری، شُبَّر زهرا سادات، ابراهیمی آسا، شهبازی مریم. بازسازی شبکههای ژنی دخیل در پاسخ به تنش خشکی درگیاه جو. مجله تازه هاي بيوتكنولوژي سلولي و مولكولي. 1396; 8 (29) :39-48
URL: http://ncmbjpiau.ir/article-1-1056-fa.html
2. گروه پژوهشی زیستشناسی سیستمها، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران ، shobbar@abrii.ac.ir
چکیده: (5118 مشاهده)
سابقه و هدف: با توجه به اهمیت تنش خشکی و نظر به اینکه تحمل به تنش خشکی صفتی چند ژنی میباشد، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژنهای کلیدی دخیل در تنش خشکی درگیاه جو با استفاده از تجزیه و تحلیل دادههای ریزآرایه و همچنین شناسایی فرایندهای موثر بوده است.
مواد و روشها: تمامی ژنهای دارای بیان افتراقی (≤ 5/2 و≥ 5/2-) در بین تمامی آزمایشات ریزآرایه انجام شده ، با استفاده از نرمافزار Genevestigator شناسایی شدند. ترسیم شبکه برهمکنش پروتئینی و شناسایی ژنهای کلیدی با استفاده از نرمافزار Cytoscape و بررسی هستی شناسی ژنها بوسیله نرم افزار AgriGO صورت گرفت.
یافته ها: نتایج بدست آمده از بازسازی شبکه برهمکنش پروتئینی منجر به شناسایی 14 و 15 ژن کلیدی دخیل در تنش خشکی به ترتیب در مرحله نموی رویشی و زایشی شد.
بحث: براساس نتایج بدست آمده، از موثرترین ژنهای کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی میتوان به ژنهای عوامل رونویسی ARF1، ABF3، DREB1A، DREB2A،HY5 و HYHاشاره کرد.
نتیجه گیری: بررسی هستی شناسی ژنهای پاسخدهنده به خشکی و هاب روشن ساخت که تنظیم فرایندهای زیستی، فرایندهای متابولیسمی، کنترل دوره نوری و فتوسنتز و همچنین تنظیم زمان گلدهی از مهمترین فرآیندهای تاثیر گذار بر این تنش میباشند.
نوع مطالعه:
مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
ژنتیک دریافت: 1396/12/8 | پذیرش: 1396/12/8 | انتشار: 1396/12/8